SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp64841_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr24
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_ceramide_phosphoethanolamine_synthase_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0000139 C Golgi membrane
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006629 P lipid metabolic process
GO:0006665 P sphingolipid metabolic process
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016780 F phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups
Transcript
Level		FPKM:0.74 TPM:1.28
ORF EntryO_BomoEE11189_complete:A_BomoEE_comp64841_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
GTAGGCAGGTTGTTGACATCTACCTGTGTAGTAAACACCAGTAGAGTAGTACACCAGTAT
GACAGTGAAACATCCCAGTCCGCTAACACTCTCTATCACATTCAAGTCTTAAGGTTTGAC
AGCTGTAATATACTCTAAATGTGTTATAGTTGTAGAAATTCAACATAATATGTTACCAAT
AAAGCCATAATTGATTAAAATTCATTAACGCCTGAATTTGGAAGACTGAGATAAGAAGCC
AAGTTCAGCGATTCTGTTTGATTTTCCTATGCATTTTTACCACCATTCGTCATTCAACTT
AAAGGAACACTAAATATAGACAGGGCTCGACATCTAGTGTCCCGGCAAAAGTCTGCCCAC
AAGTTAATTACATTACTGGTAGAATGTTAGACATTAATTAACCATTAGTATTTTCGGTGG
CTTTCGCGAGTTAAAACAGCTATCAATAATATTTTATAATGATAATAAAAACGTGAGATT
AAATGGTAAAATTAGTTTAATTAATACATAGTTATTAACTTATTAAGTAGTTTTCGGCGC
GATTTACTGCTTCCCGTTTTAGCATTAAAACAGCTCTGTAGTTGAGATTTCTAATACACA
CCAAAACTTGTGGGAATAAAGTTTTGTGAATATTTTTAACCAGCTCGACATGACGAAGGT
GAATTTTCAATCGTATTTTATAATGACCCCCATATCCTTAAGGTGAAATGTGTGACTGCT
TCGTGGCAGAACTGGTCGGTTGGTGGTCTCATCTGCAGGCTAACAATCAAGACGCGTAGG
TACGTAAGGTTTTGGGTAGTCACTGCTGGATAAGCATAGACCTTTAAAGTAACTTCAGTG
TGGATCAGGCGTGTGCGTGTTTTGTAGGTTAGGGCATTTGTAGAATACAATAATTTGTAT
TTCGAACTCATCTCTCAGGGTGGTATTCACGTACCTAGTATTTTCGTTTTCAATAACCAC
TCAACGCTGGGTTAGTCGCGATTTTTGATTTTTCTTAAAACCACAATAAATAAAATAAAA
ATTCTCATTTATTTAACATTGGTATAAGTGCGAGGCATCGCATTCAGATTAAACTTGATT
AAAGCAGTTATTTAAATGTAGTATTTTGACAGTTGTAATTTAGGCGGGAATGAATCGTTC
GCGTTGCACACTTTTCTAAGTTTCAGTTTGGCGAGACCTAGCCGTGAGAGCGTACGTGTT
TCGCGATTTAAAATAAAGCCACAAAGAGCTCGATGCGAAATTTAATCCCATCCGATAAAT
GTTACACGTGGGACGTTTTTAATACTGTGTGATAATGAAACGCGTATAAACCGTATTATA
GTTTAGTGATTACAAAAAAAAAGTGCAATGGCCTTCAAATATAACTTTTTTTTCAATGCG
TTACGCTGTGATGATGTGTGAACGAAAAAATTAAATAAAATTGGGACATTAACTGGTACA
TTTGAAAGTGCCCAATGAATCTAAAATAGAGTTTATTTACATAGTTTATTTATAGAAATT
ACGTGGGATTAGAAGTATAGACGTGTTTAGACGTGCGATGGGCGGAATCGGAGCGATTGT
GTTTTAAAACGAAGCCTTAGAAAATACACGTATTGGATTAACAGTTAACAAACATAATGT
GGCCACCATCGCAAGCCAGCAAATTCCTTATTTTGCTTGTACTCATCTTAGTCGTCATTT
ACTGCGTCTTCATGGACACGCTCTTGTATATGAGAGTGCAGTATTACAGCATAGAAACAT
TTGAGACTTCAACGCAAACCACATTCCAAGAATCGCCCACAACGAGACTCCGGGCTCTGA
GCTATGAAGATGTTGTCTGGATACCTTGCAGTGTGAACCCTTTATGCCATCCAACAGTCA
AGGCTTTGATGGTCGATCACATCAACCATTACATCTACGGTCCCTTGTGCGCGATCCTAG
ATAAAGCATTGAGGATATCCGATAGAATGCTCTTCCTGACACCGAACACAATATCGTGCG
CTCACGTTTTTATAGCAATGATTGGCGCGAACCTTTTGACGTGTCCGAATCTAAGCGTCC
GTCGTATGGGCATAGTGCTCTTCCAGATCAGGATGTTCCTGGACGATTTGGATGGTCACG
TGGCGAGAGAGCGTAAGCATATCAGAGGTGAAAGGTCAGAAGTCGGCAGCCTTGGTTACT
GGGTCGACGGAATTTGCGATTTAATTGGCGTAGTCGCGATGATGCTCGGCATATTCGTGT
ACTTCAAGCAGTATCCGCCCAGACGTGGGTACAGGGGTACTTCCGCATCAGCGTTACCGT
ACTATCAGCTAAAAGAGATGAACGCTGCCGAGAATATGGAAAAGGATCACGCGTCAGACG
TGGGGATCTCGTACAAAACCAAAGTGTCTCTGAAGGCGATAATTCAAGTTATTATACTGT
TTTCTGGTCAAATGGTACTGTCTTCTGTCGCCTGGAATAGATATATAAATGTTTACCAGG
AAATGTTCGAGAACGGCAATGGATATCTTGCCGGGAGGCTGGTCACTTTTAGATCTGTGA
GATTCTTTTGTGCCACTTTGATGTGGAGGATATTGAACCCGCATAGTTACTTGCATGTTC
TATCGCTAGCCGTGTTTATTGATAAGACGTGGTCTCTCCTGAAATCGGTCCGATATATCG
GCTACGTGCTGTTGTTACTGGCCGTTTTTGTAACTGAATATTTGATTAGTGGCTTCGAAG
CCTCCGTTAAAACCTCCGTTGATGGTAGATAAGCACATGTTATCAGTCTTAAGAGTTTAG
TTACTTTGGTTATGCCACGAGAAGCGGTAATTTTAGTTGACAATGTAAACCCAGTTTTAA
CTTATTATTTAATGTAGGTTGCCTAGTCGAAGACGCTATAAGCGTTGAAGCCGGCATTTT
TTATTTCCAAATTATTAAAAAAAACTCATCAAAACTGTCTCTGTCTAAAGGGTGGTATGC
GATTTTCAACTTTAACTTCAAGACAGTGTGTAGCATAATTCATTACAAATCGAAGAATTG
TATAAGTTTATTGCCTTGTGAACCCTTATGATCTTGCTTCGCTAACCTTTTTTTTATTTA
TTTTTATTGC
(3070 bp)

- SilkBase 1999-2023 -