SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp64444_c0_seq4
Scaffold_idBomo_Chr11
NCBI non-redundant
(nr)		DNA_cytosine-5_methyltransferase_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0001975 P response to amphetamine
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0008033 P tRNA processing
GO:0008168 F methyltransferase activity
GO:0008175 F tRNA methyltransferase activity
GO:0016740 F transferase activity
GO:0030488 P tRNA methylation
GO:0032259 P methylation
Transcript
Level		FPKM:3.30 TPM:5.75
ORF EntryO_BomoEE10708_complete:A_BomoEE_comp64444_c0_seq4
Sequence
(Nucleotide)
GTCGATTTCTGTTACTAAGGCGCCGAAATATCTAGTAGAGTCTGGGATATTTTTTTTTTT
TTTTATTATGCACATAATACACATTACAAGCTAAAAAGATACACAAAAAATAACAACCAT
TGCGGGCTCAGTAATTATTACCAACGACATTATTAAAGCCACAAGTGTTTTATGCTTAAG
TCGGTTAATGAATATTGTTTTTCTGTTCTTTTATATTTTTTTTCGCTAGTTTGTGGTTTT
ATTTTCACAGAATGGTTTTTTTTTCACATTGTGGGTACTTATTTATGCGGTTCTTACGTC
ATCACTGACCGTAGTATGTACTGGCCAACGTGTATTCAAAATGCTCATAGTTTCCTTGTT
TCTTTTTTTTGGGATTTTATGACCTGCTATTTACAAACCTTTAGGTCAACTCTTATTAAA
TTTATTGGATTAGACGAGTGTTCATATCATAGATAATGCACCAATTTTGTCCGTACTGTC
ACTTGTCAGTGTCGTCACTGAAGTATGAAACCCAGATTTGTGTTCCTTCAAAGAAAACAA
ATGATATTGGCTGGAAAACAAATTGATTATTATATTCTTTCTGGTATTAGCGATAACTAC
ACTTAGAACTGTGCTATTTTAAATGTACCTAAAATGATAGAAACATGTTCAAAAAGATGT
ATGCTTCTAGGAACGTTGTGCCTAGGCATATTTTGAGATTCGAAGTAAGAGTATAGGAGT
ATGTATACATACAAGTTTTAAAGAAATTTTGAAGTGTGAAAATGGAGAAACTGTGACAAG
AAGCTGCGACCGAGTGGCCTATTTAGAGAAGTGGGCCTACTGGAAGTTCACAATTTGGTC
ATTTGTCATTGGTGCAGCATCCTCTATTGCTGTGATGCTCAGAATGAGAGTTCTCAATTA
TCGAGCTAAGCGAAGAGCACGACAAATCCTGAGTAATGGAGCGATTTAATAAAACAAAAA
CAAAGAACAATACTGCATATAACTTTAATTTGTTTAATTAGAAAAATGAATGAACATATG
ATATTTATTATTGAAATAAATTTATTATTTTTACAGATTATTAATTACAAAAACAGTAGA
TTAGAATATGCTTTCCAACAACAAAAATAATAATCTATGACTTTCATAATATAAATTCTA
AAGTACAATAGGAAAATAAAAACAAACCATGCCAATTAGTATGTAAAAATACATTTTAAA
AAATATTGTTTAAAATTTTAAGATGCCACTTGGATAATAAAATCAGCACAATACAATATT
AACGTTTAGTGTTTTTGGAAAAATAACTAACGTTTCAACTTCATATTATGGCCTTCTATT
ATTAGGTTTATTTCAATTTTAAATTTAATATTTTAATTAAACTGAGATCCCAAATGATAG
ACCAATTTTCAAATAGGTTCTTGGTTCTAGGTTTCCTTATGTTGGTAACAGCAGCGTGCT
TCAAATATGAATGCTGCATATTGTTTTGGTTGGATCTAGTAGTTCCTGTATTTATTATAG
ACTTCCCAGTAAGGAGTCACTAGTTAGTTCAATTATCTTTGTAACTAACATTTAGCATTG
TGGTCTCTATGTACTTACTTTTTCTCAGTGTAATTAATATTTAATCTGATGTTAAGTAAA
ATCTCGAGTGTGTATGTTTCACATATCTTCTCTACATTGGTCAAAACACTAAGTGTTTGC
CCTCTCATACATTAGTCCTCCGCAGTTTGGTTGAAAACAGTTTTAACACAAGAGAAGTTG
TAATGTGATATCACTCAATGTAGAGCATGTAACTTGTACACCTTGTGCCTATGATAGCAC
ACTCACCCTCCTCAATTTTTTTTTTGTATAAGAAATTCGCAAAAATATAGCATCTAATAA
TATGTAATTGAAACATTTTGACATTACATTAATCCACTATAATTAATAAAATGCTATTAC
TATCATTTCAATTCAAATACAAAAAAAAACTTCAATACATTTATAGAAACTATTATACTC
TTATTCATCAAACAAAATTTGTAATAATTCACTGATAACTTTAACATTTACACTATTTCC
AAGAAGCCTATAACATTGTTTCCTTGTAACAGTCTTAGGAAAACTATACTCACTAGGAAA
TGACATTAACTGCAAGATTTCTTTAGACGTAAAGAACCTAAGTTTAAGCTTTTTTAAGGT
TTGCAGAAATTCATCACTACCTACTTCGAAATAATTAGCCAATTTTAAATACTTCTGTAC
TATGTCATAACTTGTTTCAGTGAACACAGAGCCTGTACCTTCTACATAATGTGTGTATGC
TTTAGTAAAACAACATGACCTGTTAGAATCTGCATAACAAATGTCAAATATATTTGCTTT
CCTTAACATCTTGTCTGGCACCAAGTAATCATCAGGCACATTATTTTCAATAATATCCTT
AAGGCAATGAGGTTTTGCAAAGGTTTTTGGAAGACATGTAATAAGCTCATCTTTTCTTTT
AAAGTTCCATGTATTATTCCTTTTAGCTATACAATAATACCTCAATCTTGAATTAGGCAC
TCCAACACTTACAGGACTCAACATAAACTCTTGATAGACAAATCCACAGTAAGTCAACTT
TTCAACAAATAAATTTCGAACAGTAGAACATTCAAACCCTTTAACATTTTCCATTAAAAT
ATATTGAAGGGTATTTAATTTGTCTAATATATCTATGAAATATAAAAATGAGTTGGTTCT
TGGATCATTTTCATCCAAATTTTTTCCATTGCGAGTAAAAGGCTGGCAAGGTGGTGACAT
GAGAACTGTGTCAATTTTATACTTTTCTATTTCTATCGGTGTTAAAGATTGTATATTTTT
GGTGAATAATAGTGTCTCAGGAAAGTTGTACTTGTAAACGTCATTTGCGACGGTGTTTAT
ATCTATAGCGGCTACAACTTTCCCTTTGATTGTGCTTTCATTCCAGGCACAATGCATGCC
ACCAATACCGCTGTAAAGTTCTAATATTCTGTGTTCCATTTTTTCCTCCATCGTTGAGCT
TACATTTACAAAAAAAAAACATATCACAGTGAGATGATGAAGCACTAGAAACAATACAAA
ATACAATTATGTGTAGAATCTATTAATCAGACACATGTTTGAGTTTGATTAGAAGTAGGT
AGGTATCATAGACATATAGATGTCATACTTCAGTTTTTTTTGTAGGTAGGTACGGTAGGT
ACCGTACAATGGGGTAAATAGGGGA
(3205 bp)

- SilkBase 1999-2023 -