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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp64241_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_histone_demethylase_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0008270 F zinc ion binding
GO:0016491 F oxidoreductase activity
GO:0016568 P chromatin organization
GO:0016706 F 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0051213 F dioxygenase activity
GO:0055114 P obsolete oxidation-reduction process
Transcript
Level		FPKM:10.72 TPM:18.70
ORF EntryO_BomoEE10455_complete:A_BomoEE_comp64241_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
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AATAAATCTTAATACAGAGCCTTCTAAGACTGGCAAGTTATTGAGGTTCCAACCAGAATC
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GGGACATCGCCAGTCTCCATCTGGCACAGCTGTCAGTGGTGGTTTTAAACAGAATGTATG
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AGCTTCCAGCTCATTTACTTTTTGAATGCGAGGAACAAATTTCAATTTGTCTACGTCTAA
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TAACATTTTATTGATCTTTCTTTTGGAGTCTTATTTGTAAAACACAATCAGTGTGCACTG
TCGCACTGTCGGAACTGTCTCACTCAAATTGAATACTGTTCATACATAAGTGTCCTACAG
TGTATATATCGCCGTATTTTACTTTACTATCTAGTACCAATTACAAACATTCATCCACTC
CATCCATTTATATATATTTAGATTATTCTCTTTGGTCGTTTCATTGATTTACTGATTCTT
CAGTCAGTCTACCGAATACACCATTAAATGCAGAATACGCACTGAAATATGTCTATGAAA
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ACATTTAAGTTTGCACAACATTAAATCAGACTTGTTCACACATTAAAATCATATTCGCTT
CAGCATTTTTCTCTATTTCTCCGTAACGCGAATGTTAGAGAAGGATGTACGATCCGCCAA
ATTTCCGACATTGTGCAGTCTAGTAGAAACGTATTTCTAATGTAATAGTAGAAATGGATG
GTTGACCTCTAATATCAGTGTGGCTTCTAGCTAGTTCTAGCGCTCCTCCCATAATGCCGG
ACATGGATTTAAAGGCTATTTTCGTTCATTTACATTCGCCAGTAATAACATCAAATACAA
AGATCAAGGCGTATTTAAGAAAGCCGAGAAAATTCGTAAGGTAACAACTAATCGAAACCT
TAATACTGTCTCGGTTCATTAACGTTCTTCATTGTATATCAGACACGTTCCGTTAAACGT
CCGGAAATTTGCAGGCCTTAGTAGAAAAGATTCGCGCAGAGTTCCTTACGGCACGCGTCA
CCCCGCTTCGGTTACTTGCTTAGCTTACTTAGTTATGCACAGGCGCCCATCTTATGGTAC
GGCATCTTTTGCATGCGAACATGCGTATTGGGTTGTCGCTATTAAATTATAACGGCTGCA
TAGCATAACGTGAGCCATGAG
(7101 bp)

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