SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp33936_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr8
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_dual_oxidase_maturation_factor_1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0005886 C plasma membrane
GO:0006810 P transport
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0042743 P hydrogen peroxide metabolic process
GO:0045666 P positive regulation of neuron differentiation
GO:0050727 P regulation of inflammatory response
GO:2000379 P positive regulation of reactive oxygen species metabolic process
GO:2000609 P regulation of thyroid hormone generation
Transcript
Level		FPKM:6.67 TPM:11.64
ORF EntryO_BomoEE2343_complete:A_BomoEE_comp33936_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AACAAATCGAGAACGACAAAGGAGCAGCCAGATAAGTCTCGGTACGCGGTCGACCGCGAC
CACCGAAACCTTGACAACAGCAGCGCGCGCCTTCCCGCGATACAATAATAAAACTCTCAG
TGCCGCCCGAGCCTTTACCGATACAACACGAACGATATTATAAGCAACTCGATATAGATA
CGTGACGACTCGCGAACCAAAACACTCGATACGGGCACAATATCCCGCGTTCGCCCACTT
CAACTGGACCAGTGGCAAAATGAAGTGATTCGATTTTGCATACTCAGTGTACACTGTGTG
ATGTTTTGTGCCAATACTCCTTGTGCCATATTAGGAGATAATAAGTCCAAAATTATAATA
AAAAAAAGGCTGGGGGAGCGATGAAGGGGTGGTTTGACGCGTTCCGCGAGGAAGGCGGCC
CTACCTTATACGCCTATCACAACAGGACGGCGGTGGCAGCAGACGTGCCTGCACTAGCAC
TGCTGCTCGCCGCCCTGACTCTCTACCTCGCCTTCCTTGTCGTGTTCCCTGGAATCAGAA
AAGAGAGATTTTCCACGTTCACGGTAGTCACGCTCAGCTTATTTGTCGGGACAGTTATCT
TAGTATGTAAGCACGGATCGTCATGGCACATAGCAGGGGCGCGCGTGGCGAGAGCTGCAT
ACCGCGCCTTCTCCTCTGAGCGGCTTGATTGCTGGTTAGCAATACACGTGGGGCTGGGAC
ATGTTAACGTCACGCTCACAGCGCTGTCTTGGGGAAACACAACTATAGGTGACCCTGGTG
TCGACTACAATGAGCAGTTCCGATGGGAAGAAGCCGGTGCAATACAGGAGTGGTATCGCG
CTGGGCTTACCCGTGGCCTTCCATACCCAGTGCTATCGGTAGCAGAGCACTTTGCTGTTC
AGCATGAAGGCTTCGAGTGGGGAGCTAAGTACCGCGCAGCCGGATACACTACGTCAACAT
TGCTCTGGACAGCATTAGCACTATGGCTTCTAATGAATCTGCTCCTAGTGGTTGTCCCTC
GCTATGGTGCATACGCAATGGCGATCCTCGGTGTGACATTGTGCGCTGCTGCGGGCGGCT
ACTGGGCCTCTCTGCCAAACGCTCCCTTAGTAGTCAGATTAGACGGAGCGATGCTGTTCT
TCTCGCTCGGCTGGTGCTTCTGGCTAGTCCTAATAGCAGGTAGCGCTTGTGTACTAGTTG
GGATGGTGATAGCGATGCTGGATCTAATATGGCCGCATCGTTTCTCGACTGTTCTGGAGG
TGGACTATGACACTCCTTACGACAGGCACGTGCTGATTGTCGACAGCCGACAACGAGCGA
GACCTCAAACTCAAGCTTCGTTGCCTACTAGAATTTTAAGAAGATTGTCGTCAAAAACCC
GTGAAAACGAAGCACAAGCCAGTTTGTCGGTTGTAAATGAACGGGGTCGGGACAACCCAG
CCTTTAGACATGAACAGCGGAAACCTAACTCTCCGTGGAGGTATCCGCTCTTTAGGCGAC
AGATAGACAGAGCGGACTCAGCATCGAGTCTCGGTTCTAGTGTAAACGGGAACAGTTCCG
GAATAAAAATGTCACCGCTCGCGGGCGATCATCCCGCGCCATCAGCCGCCATCCCTCCAC
ATAGGTTCCGCCCGCAAATTCCAGCGGCGGAGCGAGTGAAAGACATGTGGTGACTAACAA
TCGGCACTAGGATGTAATTAACACATTTAACTCTCTGATAATCGTGTAAAAATATTTTTT
TGATGTTTTAGTAAGCACGTGAATAACACGGACTAGAGGATTTACCAAAATACTAAAAAA
GCTTTGATATCGGTCGAAGCAATGGCTTTCCAATCAAAGCTATTGTAATATTAAGCTCTT
GCTTCGCAACATCGTTCCTTTAGTTTGGTGAACACTCATCGTCTGCAAATTTGTATTGAT
TCGAATATTTTCAAAATAATAATACCGTTTTGCGTGACTCTGATAGCTCCTACACTTTAT
TTAAATGTAACTGCTGTCAATCAAATTCTGTCGTATAATAATTTTTTAAGTGTGCTCCTT
CTAAATATAAAGGAAAGAAAATAAATTTTACAAATGTTTTAGTTACTGATCTCTATGGCA
GAATGTAAGTAGATAGTTATTAAAAATTAAAAATTCACATCGTGTACACGTTTGTAAGTA
TATATAATGTGTGTAAATATGTAAATTTTAATATAAACTATGTAACTAAACATTCAGTGT
CATAAACTTTATAATAAACATAAGAATATTGTTATGTGTGCGTTAATTCGAATTTAGTCT
CAATTTTACACCGAAATAAATGAGAATTGTTAAAACAAAAGCTAAATTATGAACGTAATC
AAAGACGATTCTCGATTCTGGCATAACCGTTATTTTTTCTTCAAAATTAAATAGCCGAGT
ACTATTTTCTCATTTGATGTTTTCTATCTTAACTCTTATAAACAAATTCACTTAAACATT
AACTGAATATTAAAGAATCACACTAGTTTATGTAATTGTAACTCACTTATATATATATCT
GTTAAGTAAACCATGAAAATCATCATGTAAGTCTTGAAATTGACGGAAATATACATATAT
ATTTCTGTACAATGTTTATACCGTAAACTGAAACAAAATTATATTTGTGTTTTCAGCAGA
CTATAGTTTCAACATTAATAAATAATATTGCATAATCTTATGAAATAAAACACATGATAT
CTGCATATAATTAAAATACATTGACACAAATGAATGCTTTGTGCCATTATAACCTTAATT
ATGATGTGATCAAAATCTTAGATTAAGACAACTGCACACTTCATTGTTATAAAAAAAAAA
CAATTAATAATGTACAGATTAACGTTTTTGAACCAGTTATTTTTAACAAGTGACATGAGT
ATTAACGAAATGTTTCTGTGTTATTTAATAACCTAAGATTATTTTATGGATTAACCTTTA
AAGGTCACAGAGAAAGGCAATGGTAAATCACAGAATTAAAAAAAAATCAGCGCAGTCAAG
TAACTGTAAATTTAGATATAAGTTATTTATTTTGTAAAGTTGAAATTGAACAAGAACGAA
TGGATGAAATATGATATTTATGTATGAAAATGTTGTTTAGTATCAATCAATCAAAAAAAT
TGTGTAGTAAGTAGGTATCAAGTATTAAAATCTAAAATGTTCAATGAAATATATTCAATG
TTGCGAAAATGTGTTTGCAACAGTGAATATGTTGTGATTCTAATTTAATTAGTCAAAGGA
CTCTTACTCGATATACTGTTTATTGTACGTACATCACCCGATCGAGGGTGATTACAAAAA
CGGATCATTCACATACACACCATAAAATATAATAGGTACATCAATTGTAAAATTAGTTAT
GAAAAGGCGGCAAAAAAGGTTCTAGTAAAAAATTTATGCGTGTGCAATAAATTTAGCGCC
CGTTTTCAAAAACGTGTATCTCTAATTAAATCTATAATTGACCTAGAATGAGAATTATTT
GAGAGTGCCTGATAATGAAACTATTTATTGTGATAAAAAAAATAAACAAATTCCAAAAAA
AA
(3542 bp)

- SilkBase 1999-2023 -