SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoEE_comp33499_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_BTB/POZ_domain-containing_adapter_for_CUL3-mediated_RhoA_degradation_protein_3_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0004842 F ubiquitin-protein transferase activity
GO:0005634 C nucleus
GO:0005654 C nucleoplasm
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0016567 P protein ubiquitination
GO:0031463 C Cul3-RING ubiquitin ligase complex
GO:0043161 P proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0051260 P protein homooligomerization
Transcript
Level
FPKM:85.94 TPM:149.88
ORF EntryO_BomoEE2109_complete:A_BomoEE_comp33499_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
AAAAAATAGATCTACTACTCCAAAATCAATTCTATCAAACTACACAAAATCTCTTGAATA
TCCGTAGCTTGTCTAATTGCAATCGAATGTTGGATTAACTAATAATCCAGCGCTAATGCT
CATTTCTGCAGTTCATAATTTAAATGACCCTACTTTATGGTATTGAAACTGCACAAAATG
TAGTATAGGTACATTTGGAACAAGAAAATAGTTGAGAGTCCGGGTGTACTGGTCGTTTCG
TATTATCGCGTTGATGTTATTTCTTCGTTTTGAAATAATGTCGGGAGATCACAAAACGTT
GTTAAAAGGCAGTCCGTCACAATATGTGAAGTTAAATGTGGGCGGCACATTGTTCTACAC
TACTATCGGCACGCTTACGAAAAGCGATAACATGTTGCGAACCATGTTTAGTGGGAGGAT
GGAGGTTCTCACAGATTCGGAAGGGTGGATTTTGATTGATCGTTGTGGGAAGCATTTCGG
TACTATTTTGAATTATCTTCGTGACGGCACAGTAGCGCTACCCGACAGTTATAAAGAGAT
CATGGAGTTATTGGCGGAGGCTAAATATTTCCTGATTGAAGAGTTAACTGAATCTTGCCT
ACAGGCCTTAGCCAAAAAAGAACGCGAGGCAGAGCCTATTTGCAGAGTTCCTTTAATTAC
TTCACAAAAGGAAGAACAACTTTTAATTATGTCCACTTCCAAGCCTGTGGTGAAACTGTT
GATTAACAGACACAATAACAAGTATTCTTACACGAGCACTTCTGATGATAACTTACTAAA
GAACATTGAACTCTTTGACAAACTTTCGCTGCGATTCAGCGGGAGAGTGCTGTTTATTAA
AGATGTTATTGGTTCTAATGAGATTTGTTGTTGGTCTTTCTTTGGACATGGAAAAAAATG
TGCTGAAGTCTGCTGCACTTCAATTGTGTATGCTACAGATAAAAAGCATACTAAGGTTGA
GTTTCCGGAGGCCAGGATATATGAGGAAACACTGGGAATTTTACTTTATGAAAGTCGTAA
TGGCCCTGATCAAGATTTAATTCAAGCTACTTCATCACGAGGTGCTGTTGGGGGATTGTC
TTGCACTAGTGATGAGGAGGAAGAGCGATCTGGCCTTGCCCGACTTAGATCAAATAAGCA
GAATAATCAATCTTAGCGGTTACAGTCAGGCCTGGCACGCCTTCGCAGCTCAAAACGAAC
AAATGTTTGATATGAAGCTGGCTGTTTTCCGCCACTCTGTTGGCTGCCCTGCTTCGGTCT
GTAGACTGTTTTGAGCCTCATTCTTGTCTCTGGGTTTCCCTTTTTGAGCTCTCTAAATAA
TGTGACAGTGAAAAGTGGGTATAACAAAAAGGCACCCAAGATTTGTGAAAACAAAGTGAC
ACTTGAGTAGGGATTTTTCACTATATTACTGTGTCTTCAAGTGTTGGTGACTAAATGTTT
AAAAAGTTCTAGTAATTAAATACTTGCAGTTGTTTTAAGATGTGTGATGATGTAGTATGC
ACTGACTTTAAACTTCTATATTTAAAAACTCTCTTAGAAACTTAACTATACTTATTCCGT
GTACTGTCTCTATTAGTGTTTGTCCTCAAAAATATACTGATAGCTCAAGTATTGCCAAAT
TGATGTTAGTGAAAAAAAAAGTAAAGATTCAATTGTTCAATGTTAAATATTAATCAAAAG
AGTATTTAGCTATTATGTAATTTATATTCTCAAAAATATCACTCAAACTATTCTTTGTTA
AAATACAATATATAATCAATGTATAAAAAAAAATTATAAAATTAGCAAACTTTAATGTGT
AACTGTGCTTAATGAATTTTTGTGTATACTGTGTACATAATTCATATGTTAGTAGCCCTT
TATGCATGAACTTTGTGTAATTTTATGGTCATTACACTTAATAAGTTGTAAGTAATGTGA
ACAAAGACAAGTATGACAAAGTAGTTGAATTAATGTCTAGTCTTATGTCTTCAATTCTAT
TGTGTAGTCTGATAATTCTGGTGGAGATCAAGATGGTATAGGTACATGAAGTCAGGTACA
TGGTAAAATTTTACTCAAAATTCAATAAAAAATTACGAATACAGCAAATGTTTTGTTACG
AATGGAAAGTCTTGCACCTATGCAGCCTGGCATATTATTTGTGTCGAGTTTGTACCTATG
ACTTAGTGTCAGGAATGTTGAGAGGCTATGTTACTTTAGTATTAAAAAATTCCATTGTGC
TGTGTAAATGTGAACTTGTTACTTAGAGCGTGTTTAGTCACAGTGACACTGGGTTTATAG
TTATAATTTTATTAAGACTAATCTATGCAATTGATGATGAATGATGAACTATAAAAAAAC
TTACATTTTACTTTTTTCAAAATATATGCTCACTGTCTAGCTCACTATAAAAAAAAAAA
(2399 bp)

- SilkBase 1999-2023 -