SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp27399_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr10
NCBI non-redundant
(nr)		hypothetical_protein_KGM_05194_[Danaus_plexippus]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003727 F single-stranded RNA binding
GO:0003729 F mRNA binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005844 C polysome
GO:0008266 F poly(U) RNA binding
GO:0048864 P stem cell development
Transcript
Level		FPKM:0.59 TPM:1.03
ORF EntryO_BomoEE1231_5prime_partial:A_BomoEE_comp27399_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTATTGTTTGAACAATGTCCATATTATATTTATTACCACATACACACGGCA
CGATGTGAACCTTGTCTTAAATCATTTTATTATAATAGGTATATGTACATTGCACAATGT
GTAGGTATACATGCATCGCCATACACGCGCGCCCCGAGAGGCTGTATGATTATATATCTC
ATAGTATAATGTATGTTATATAATGTAATATTCCAATAAGAAAGTGCATTGGTGCACGAA
ATCGGGGCGGCGGACGTACCCACCGCTTTTACAAAACATTTTGATATTATCATTATTTAA
TAAAGAGATGCCGTAAAAACTAATTTTATTCATTATTACGATTTATATCCATATTGTATA
CAGATTCATGTAACATATTATACACGAAGAAATGACGAAATTATCGCGTCGACGCGGCGT
TCGCACGCGTCGCGGGCCGTTCGCCTAATCATTTACCTCCATTCTCTAATACTTAAATGT
ACATGACACGAAATTCGAACGTATATAAATCCAAATTTACTTTTAATGTAAAATCTTAGG
TAATTGATTTTTTTTTTATTATTGCTATAGAAAATCAGTCAGCACGCGAAGCACGCAATC
GAGAAGTAACCGCGAGATTGAAAGCAAGCGGGCGGCGTTGCGCGGGGCGGGACAGGGTGT
CGGAGCCAACGATTATCTCGGCTCTAGTAGACACGCTCTCATGCTGACTACCGATCGGCC
GGTCTGTTCGTGCGGAGCCAATGCGCGTCCGGTTCTACGCGACTATCTATACCTTTGGTC
CTTGAAATGTTCACTTGGCCATCGCCGTATATGCAAAGCTACCGTTCTATGGCCGCTGCG
GCGACTCTACCAACTTCACCAGTCTGTCACGTTATTAGATTAAAATTAATTATTATCATT
AATATCAATAATAGTAGATCGTGTTTAAAATAATGTAGAACGTCATCATCGTACAAAATA
TAATAATAAAATTATCTTTTAAATTTACAATACATACGTAAAGTCGCAATACTAGGATCA
CATAACGAATTTAAATTATAATTTGAGATCTCGCTTATTTGTTACGTAGTCTTTATTGTG
TGATAGAGAAGACAACTAAAATGATAGAAGTGAACTAGCGCGTATAGGAACAAGCGAGAA
CAGAAGCGAGTCGCGGTGGCTGTTGGCATCGAGCCTCGGCCGCTCCGCACTGCTTATCGG
CGGTCTGGCTTCTAAACTGCGGTCCACACTAACGACACACTTATATAATATTGCTCACGA
TAATTAGGAAACCAAAATGACGCTTGTAAATTTGTTTGTTACAATGGAATATGGGATTAA
TTTCAAATCATTACCAACTTTAACTTTCGGTTGATTTTTATTTGTCACGTTTATGTTTTA
ATGTATAATTCAATTTACTCAATTTCTGATGTTAATTTTGCGCACACGTAAAAAATGTTT
ATAGGTTTTTAACTCAATAAGTGGTTTCTTAATATGAACCGTATTTAAGAAGCTCTAAGG
GTTATTCTAACAAAACAACCTCACAATCCGTTTCAACAAACAATAACAACAACAATGAAA
CTAAACGTCCGTCAAGCTAATCCTGATTGCAGCTCCAATGAATCTAATATCGACCAGATG
GTACGAGTATCTAAGCGTTGCGCCAAACTACTTACATTTTTCATTGTACACTATTTTTAA
CGTCCTTAACACGTAAATATATATAAAATAAAATAAACAGTAATTTTGCATCGAACACTG
ACTCGTGATTTACTAATTATTACAATAATATAATATCATTATTATTACTTAAAATTTGAG
TAATTATTGTTTACGTCAAAGATATGTCAAAATAAGCTATTATTGCTTTCGATTGGTCGT
TAAACATAGTGTACGGACGCCGCCGAAACGTGTTCTTGATTTTATACGGCGCCATGCGTA
TTACGGCCCTAGCATGATCCGCGGCGTATTCGGTCGCGAAAAATAACCCTCACAGGGGTG
GCGCCTACCTATTATTCTTTTTTTTACACATGCGGCTACCTATTTATATACAATAAATTT
TCATCATGTCTCGTCTCGATGCAATCGCGGCGAACCGATGGCTTCTCACGAACGGTAGTA
CGAACCTCTTTCACTATAATGAATGTTTGTTATCGTACTAGCGCGGGGACAAGCAGCCGT
GTGCGCTTCTCCTACATTAAAAAGGTCGGTAAGAAAATATAATTATAGTGAGGATGTGAA
AGAGAATGAGACGACCGATGGCGGCGTGAAGCGAACGCGACCGTCGCCTTCGGTCCGGGC
CTAAAAGTTATAATGTCTCATCGTAATAATTAAATATTCTAAGAAAGAAAAAAAAAAACG
TCTTAAATACCTATAACACCGTAAATATAAAAACAAATAATTACGTTAATTTGTTTAGGT
ATGATATCGATATCCCGACCGTCCTATAGACGCACACCTTTCGATTTCATTATCAATTTC
CTAGCTAAGGTTCATAACAACATAACCGCGGTCGCTTATACTCGTAGTGCGGTGGGTCGG
CCACGTCTCGATCGGACTGTAGACGCGAGTTTGCCGCACACTCCCCCTACCACTCCATTA
TTCAATTAACTACGCACGAGACATCGTAATGAATTAATCTTTGAAAAGAATATTGATTCC
TCTCGTACCGTTTTCAATGTAATTTTTTTTTTTATTATTTATTAATTTTAAACAGGGAAC
ATTTATATTAATAACGTATTTAATAATAGCATTTAAAAGATTGTTTTATTATTAATACCT
AAAATTTAATAACTAGATTAATAATATTAATGTTTAATTGATGTAGGTAATGAGTAATAA
TAGTAAATAATGAATGAATGCCACTTAGTGCATGTTGTAATGCTAGCGGCTAGCGATACG
CGGTCAGATTATATCAGCAGTCAGCGGAACGCAGTCGTCGCGTTATAAGTCTGTAGCCGA
CTCCACGCCGCCTTACTCTGCGACTGCTGCATACTAGATAAAGTGATCGATTTAATTGTA
TCCAGTACCTAACGAATATGATTAACGAATTGACTTCATATTTTATTCTATTACCTCAAA
CCTGCGCCTTTGGCTGATTCTTTTGTTATCCCTGTCTTTAAAATATTGAAATTTTGTTGT
GTAGTGTGTGTGGGTTTATTGCGAATGTACGATTTACGAAAGTTTATTTTTTTATTAAAA
ATTTGAATACGACTAAGTACGGTGCGACTCCGTGATACAACCGGAGCCTGGTTTTTTAAC
AGTGTTCTTATATATACGGTTAATACAATCGTAAGAAACAATGAAATACTTATTTATTTA
ATACACAAAAACTGCAATGAATTATAATTACAATACCTACGTTCAAAGGTACAGGATTGA
AATGAATTTTTATCTTAGATCATGAGAGATATTCAGAAATGTATCGACTTAGCTCGACAA
ATGTTATCATGAATCATCAATATCCTTAGGATAAAATTTATAATATCGTAATACATAATA
TAAGAAAGTTGTATATACGCCATACTAACATAGTCTTAATGAAGTAATCGAGAAACTCGC
TACAGAAAAAGAACAGCTGTTCAAAGTAGTGATATCATACAATTCGAATTAGAAGAAAAT
AATTACATTTATAGATAAAATATGCGATAGTACATCTTATTATAATTACGTTAATATTTG
ACGTTAATATTAAAAATAGATAGAATAAAATATGTGTCGGTGGACGAGCGAGGAGGCGCA
GTTTTTGTGCGCCGCGTTACTGTCTCCGGTGTCCAGCCGTCGCGTCGCAGTTGTGCGAGA
GTCGTGCGAGAGTCGCGCTAGAGTCGCGCGACCTTTTGTCCACCAGCTCGCGGAGCCCAC
GGAATGGAACAGGGACAAGCTGCTTGCGAACACGATCACATCTCGATGCCTCCTAACGCC
GGACTTTACAACATCTCATCAAAGCGAACTATTGAAAACCCTACTATGCAGACGCGCTTT
TCGCTGGACGCGAGAACGTTCTTAACAGATTGACTTATCTAAAGTCCTGCGCAGAGGACT
GATTACATTAACTGTAATTTAACTATGAATTATAAAATATTAAAGATATACCTCCCTGCA
ATAAAATCGTCTACATGCACATTATAATTATGAAATGTATTTTTTTTTTGTAATATAAAT
TGATTATTATTTTGACAACACATCTACGGTACAGACGAAAGCGAGAAAAATTTGAAAAAA
TACCTGTTCAATCGATAGACTATTTTTCGTTCACACGACAAAAAGTTATTTACAATAGAC
GGGGTCTTTTCGACCGGGTGTGGGGATGGGGAGGGACGTGAGGACGAGGGGAGTAGGGTG
GGATGTGTTGCGGCCGCGCAGGAGCGAGGAACTTCGGAGTCGTCGCGCTGGCTGGAGGAG
AGGCGCTGGCGGCGGGCGGAGGGCGCTAAGAGGGCGGCACATTTAAGGGGACGCTATGCG
CCACCACACCGCTCGCCACGTAAAATATTTGTGCTATAACACTTTCAATGATATCCGTTG
GTGAAAGCCGCCGGAATCAGGGGTCCTGGGGTGTAATTGAGGGGAGCGCGGCTGACAGCA
ATCGCGGGGAATCCAGAGGGCTGGGGACTAGCAGCCTGGACGTAGCCAACACTGTCCGCT
GCAGACCCGTACACGTCGAGGGCTGGTCCCGGGGAGCTCGCGGCCGGGAACCCAGCGCGT
CCACCGGCAGCGTGAGGAGACGCCGGAGGTCCAAAGCCAGCCGCTGCAGCTTGATAGTTG
TTCATCACTGAGAGCGCCTGCGCGAGAAGCGGTGTGTTGTTGTTCGGTGTGAGTTGGCCG
TTGGTCAGGTCAACTGCTG
(4819 bp)

- SilkBase 1999-2023 -