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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoEE_comp109435_c0_seq1
Scaffold_idBomo_Chr24
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_spectrin_beta_chain,_non-erythrocytic_5_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003779 F actin binding
GO:0005509 F calcium ion binding
GO:0005516 F calmodulin binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005938 C cell cortex
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0051693 P actin filament capping
Transcript
Level		FPKM:5.27 TPM:9.20
ORF EntryO_BomoEE90076_3prime_partial:A_BomoEE_comp109435_c0_seq1
Sequence
(Nucleotide)
CGCCGCGCCGCCAGCCACGCGCGCGCCTCCGCTACCTCCGACACCAGCATAAGCACGTCG
CACCGTCGTTGCAGTGCCGCGGTCCTCACGCTGGCGCCGTGCAGCAGGGACCGCATGAGC
GCCGACAACTCGCGCGCCCGGGCCTCTAGGGCGCCCGACGCGAAGTGACCTCGCCGGGAT
AGCTGCGCCGCGCGCCCGCACACGGCGCTGACCGTGGGCTCTCTGGCGATAAGCTCAGCT
TCCAGAGACAGGTGCTTCTTCAGCAGAGCTTGCGCCTCCGGGAGCGAGGAGCCGGCGTCC
TCCTGGTGCACCAAGGGCTCCCGTTCCTGTAACCAGGCGAATTCCTCGTCGGCGTCTCTA
TCCCAGCGGTGGAGAAGCTCGGCATCTTCTAGATTATCTCTTCTGATCTGTATCGGCTCT
TGTAGCTGGCGGTAGCGTTTGACGGCCTGGTCGGCTCTGTCCAGTATCTCCTGTGCCATG
AAGTGCTTGGTGTCGGCGAGCTGGCGGGCGGTGTCGGCCAATTGCGTCGCCGTGTCGGCC
TTGCTCGACACCTGCTGCTCGAGACGCGAGTGTCGCTTCAGAAGGACCGTCACCGACGCC
AGGTCCTTGCCGTGGTCCTCGCTGAGCAGCTGCGCCTCCACCTCGTCCAGCCAGGTGGTG
AAGTCGTCTAACCCTCGGAAGAAGATCCTGGCCTGGTAGGCTTCTTGCAGGCGATCGTGA
CGCAGCTTAGCGGCGGTCTGCAATTCCTGCCACTGGTTCTCCAACTCCTCGACGTGTTTC
GCTATCTCTTGAGAAGCGTAATGTTTTGATTCAATAAGCGCCTCCCCTCTGTTGGCGACG
TCGTCGATGCGTCCCTTGTTGGCCGCAAGCTCTGATTCAAAGGCGGCGTGCCTCTGTATC
TTGGATTGCAGGTTAGACAGTTCTCTGTAATTCTGGTCGTTGGCGATCTGCATCTTGAGC
GCGATCCACTCCCTCTCGTGCTGCAGGTCCTGTAGGAACTGGTGCAGCTGTCTGGACTGC
TGCAGCACGTCTCCGCGCGACTTACACGACTCCTTGAGTCTGTCGGCCCTGCGGAGGACG
TCGTCCACCCTGACCCTCAGAGGATGGTCCTTCAAGCCCTCAGCGCTCTTCCTCAGCTCG
TCGACGCGGCAGATCTGGCTCTCCAGCAGCTTGCTGAACTCAGCGTGCTTACGGATGAGG
GTCTCGACGGCGTCCAAGTTCTCTCCCAAGTCGTCATTGTTCAAGAAGGCCTCCTTAGTC
GAGAGCCAGTCTTCAATCTGTCTCGCTTGCTCCTTCAGTAGCTGTAACTGGTGCGCCTGA
GTCAAATTCTCCTTCCTCTTCAGCCAGGCTTGGTCGAGGGTGGTGGAGAGGTGTTCGACT
TTCTTAAGCTTCTCCGGCGTTTGCTCGGCCTCCTTCTTCAGCGAGGCTATGGCTTTCTGG
CGGTTGTCGATTTCGGCCTTCTTCTCGTCGTGAAGCTCCAGCAAGGCCTGGGCTTCTGCC
ATCGTCTCCGGGTCCTCGACTTCGTCCATCTGCTTCACGGCTTCCGACACCCAGACTTCC
AATTCCTTTAAGTTCTCATCGAATTTGTGCTCGTTGATAGCCGCATCTAGCAGCGCGGTT
CTCCTCTCAGCCAACTTCTGCAGGTTGTCCCAACCCTCGCGTAAGTTGCGGAGACTCTCC
TCTATATCTTTAGCGTGCTCTGGGTGTCTGGTGGCGAGGTCGGTGCCGTCCGCCTGAAGC
TCCTGGATCCTGGTGAGCACGGCGGAGGCCTCGGCGGCGCGCGCCAGGTGGCTGCGGCGC
AGGAGGTGGGCGGCCTCCAGCTCGCGCCCGCGCTCCGTGCTGCTGAAGATGGCCGCCTTC
TTCGAGATACGCTCCGCCGTATCTTCCACGTCTCTGTTAAACGAATGTATCTCGAGGGCG
GCGGCCAGGTTGTCCCGGTACCGCTGTAGGGCTCCGCTGAGGGCCGCCCACTTCGACAGG
AAGGCGTCGCGGCGCTGCGCCACCGTGGCCGCCTGCTGGGTGGGGCCCTGGTTGAGCAGC
TTGTCGGCGAGCGCCCGCACGCTGCGCACGCGGCGGTCGTCCACGCGCATGTCGCTGTCC
ACGTCGTCCAGCTTGCGGAGCAGCGCGCTGCAGTGCTCGTAGTCGCGGCCCAGCTCGTGC
GCCTGCACCATCATCTCCTTGTCTCTGATCCAAGCCTCGAACTTGTCCAAGTGCTGGTTG
AACTCCAGGATGTCTTGGGCTTCTTCCAAACCGCGACCAGTCTCCCGGGTCGCGTCTTCG
AGTTTCGCCCAGTCATTCCTCAGCTCAGCCAGCTGCTCCTCGACCTCAGGGTCGGGGCTG
AGCTGCCGGGCCAGCGCCTCCACCTCCTGCAGGCGCGCCTTGTTGGCCGCCAGCTCGGCC
GTGAAGGCCTGGTGCTTCTGCAGCTTCTTGATCTTATCCTCCAAGTTTGTTACTTCGCCG
TGCTGTTGGTCGGCAGTCAGCTTGGCGAGCTTCTCCGCGACCCAGCTGCGAGTCTCGGCC
GCGTCCCGGGCGAGCTGCGCGCGAGCCCGCAGGCGACCCAG
(2561 bp)

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