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Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoASG_c6762_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr11
NCBI non-redundant
(nr)		cleavage_and_polyadenylation_specific_factor_5_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003729 F mRNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005849 C mRNA cleavage factor complex
GO:0006378 P mRNA polyadenylation
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0017091 F mRNA 3'-UTR AU-rich region binding
GO:0042382 C paraspeckles
Transcript
Level		FPKM:34.80 TPM:26.69
ORF EntryO_BomoASG1151_complete:A_BomoASG_c6762_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CCGTGAACGTCACTAATTATAATTCTTAATAATTCTTATTATTAAATGGCCGAATACTGA
CGCTTGTTTGTCTTGGTAAAACAATTTTTAGTTGTGATCATCTCTGCATACGCGGTTTTG
TTGAAAATAAGATCAAATATAAGATGGCAGCAGTTCAAGGGCCTCCCGGTAACAAACAGT
GGCCTGCGCGACCAGGACTACAACATCAAATAAGCCAAAACCCAAGCATGAATTTAACTC
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TGTTCGAGAAAGACGCGTCGGTCCCGGCGAGGTTCCAGAGGATGCGAGAGGAGTTTTGTA
AAATCGGAATGAGAAGGTCAGTCGAAGGTGTGTTATTAGTACATGAACATGGTCTCCCTC
ATGTGCTGTTACTGCAACTCGGCACTGCGTTTTTCAAGTTGCCCGGTGGAGAATTGAATC
CTGGAGAGGATGAAATTGATGGTTTGAAGAGGCTTCTCACAGAGACTTTAGGCAGGCAAG
ACGGTGTCAAACAGGAATGGCTCATTGAAGACACAATAGGAAACTGGTGGCGACCGAATT
TCGAACCACCGCAATATCCATACATTCCGCCTCACATCACGAAACCAAAGGAGCATAAGC
GCCTATTCCTGGTTCAACTGCAAGACAGAGCTCTGTTCGCTGTACCGAAGAATTACAAGC
TGGTTGCGGCACCATTGTTTGAATTGTACGATAATGCTCAGGGATACGGACCTATAATAT
CGTCGTTGTCTCAGAGTTTATGTCGTTTTAATTTCATTTATATGTGATAAATGGTATTTA
AAGTGAAGTTTGATGAAGAAAGTTTAAATGGAATGAGTTTCTGCAATACTTCTGCAGCTA
GACCACAACGAAGCTCAGTGTTAGGCAACTATGGATATCACCTTCCATAATATGTTTACC
TAAAAACATCCAATTATTGTTCCAAATCCATAGGACAATTTAGGCTTTCTTCATTATTGA
ACTTGTATAGATATATGCAAATGGACATTTTTTCTATAGTTTAAGATAAGGTTTTCTATA
TTTTTGTCAATAAAAGAAAATTGTCATGTTATATCTAAATAGTTATGTGCGACAGAAAAT
ATCTGAAGTGAGTGTTGTTATTAAGAGATGCATAAGATGTTGCAGGGACCGGTATGGATC
TTGAGATTTCCCAGAAGAGTCGTATTGTTTTATAACTTGGGGGACTTGGGACAATGTGTA
CAAAAGGGGTTCCTTAATTTTTTTGACAACTTCAATTTGACAATTTATTTGTTTTTTAAC
TGCAGTCATGATTTATATAACTTTGATTTGCTTTAAAAATACCTTCATACTTCAGTGTGT
TTGAAGATCTTATGCCTTTAGAACTGCTAGCTCACAGATATTTGTTGAGGGATATGCAGA
GAAGGGACTTCATTTAATGAACGAATTGTTGAGTTGTCACCATTCTCTCATTCCCAAACT
TGGAGCATCAGAAAGAGATAAATTCACCAGCGTTCAGACCACACTCAGCATCCAAGATCC
AAGCTGTTCTTTGTCCTCTTAAATTGACTCAGTTGCAGACTGCATACCAATCTGATTATT
CGCAATTATGAATTAGGTCAGCTGTTATGATGCAATTTAGACCTTACAGCTCAAGAAATA
AAACAGCAGTTTGATTTAATGCTAAATGGCACTGGAGCTAGTTTTGACATCAAGGCCACA
CGTCAAACTGACCATGACCTAATATGTAATTTCCGAATGCTGAACTTAGTCTAATTTAAT
GCCGATTCATTAAAATTTTAATTGAAAGTTAACTTGAAGAAACTTTGTAACTAATAATAT
GTATTTTAATATTAAGCGTATTTGACTAAAACTTATGTAACACAATTTTTACAGGTTGTT
TCATTTTGTACCTGAAGAAAGAAGACTGTTTTAGTTTCTAAGTTGTATATATATACATAC
AGGGTGTAGTTCTAAAATATTTTGTTTTTTGTAGATTTAAGTGATTATCAAGCTTATATT
GAGGGAGTGCCTAATCTCGAGTGAAATTTTTCGATAATAATTCTTATTGTCTGAATTATG
TTAGAAAAAGCCAATAATACCGGTACAAGGAAGTACAGCACACCCTGTATTTGTTAAAAT
GCTAGGTTTTGCTTGACATGTGATTAGTATTCAAAAGAAGTTAAGTGCTAAACATTCTGA
TTTATGTATTCTCATTTTCGAAAATTCATAAAAAAAAATCACACGCG
(2267 bp)

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