SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoASG_c6701_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr12
NCBI non-redundant
(nr)		ribonuclease_Oy_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003723 F RNA binding
GO:0004518 F nuclease activity
GO:0004519 F endonuclease activity
GO:0005576 C extracellular region
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0033897 F ribonuclease T2 activity
GO:0090305 P nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
GO:0090502 P RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
Transcript
Level		FPKM:97.12 TPM:74.50
ORF EntryO_BomoASG1137_complete:A_BomoASG_c6701_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
TTTTATTCTAGTAATCTAGTTGGAAAAATGTGGTACATATATATGTATGTACTTAATGTA
TTTTAAAACGATTTAAACAATTCTCATATAAATTTCATTTAAGATTTTTTTGTAAGCTAT
GGTATATGTAACTAAAATTCAAAGCAGAAATATAAAATATTGATCATTTGTAAAAATGTG
GAGAAATTTGAGTTATGCTATATTTTTGCTGTCGTGTTTTACATATGCAGAACTAAGCGA
CACAAAAAATAATGAGTGGGATTTTCTAATATTCACGCAACACTGGCCGGCGACTATATG
CAGAATATGGATGGAGAAACCTACGCACTCTTGTATTATGCCACACGAGCAGAATTCATG
GACTATTCATGGTATATGGCCAAATAAAAATCACTCCATGGGACCATTTTTCTGTAATAA
GACTTGGTCATTTGACCCTGATCAAGTTAAATCTATTGAAACAGACTTGGAAGAATCTTG
GGGCAATATTGAGAAAGAACAATCATTGTACAGTTTATGGGCCCACGAATGGACAAAACA
CGGTACTTGCGCCGCATCAATCGAGCCCCTTAACTGCGAGCTGAAATACTTCACGAAAGG
GTTAGAATGGCTGAAAAAGTATACCATGAAAAATATTTTGAACAATGCAGGTATCACCCC
TTCAGACATGAAAGAGTACAAAGCTATTGATTTTCATAATGCTGTGAAAACTAAACTTGG
ATTTAAACCAATGGTTGAATGTCACAAAGTTGACGGTAAACAATTCTTGTTTGAAATACG
CATATGCTTCTCAAAGTCACTTGAATTGATTGACTGTGAAGATACACATATGACTAATAC
GGATATTATTACGAATTGTAAGCCAACTGAAGGGATTATATATCCGGTAAATGAGAAACC
TCCCAAAAGATATTTGATACAGCTTCATAGATTATTGTCATGGTTACGTTGGTTCACAGT
GTAAATACTATTTATTCGCTACAAAGAAGCCTTCAAGCCAATCTACACTTATCCTAGTGA
AACAGGTAAAGCCTCTGAGCCCCCCATACATCCCATAAAAGTTATAAATTTCAGTGGCCA
TCATCGTCACCTTAAATTTTTACATCAAACAAGGCAATTAATTAAAACTTCTATTTGCGT
GTCTCTTAGTGTGCTGCAGTATTTCTTTTTTCAATTAACTCAACAACTTGGGTAAAAACA
CCATTCAACCCAATATTCGTAATTTATCTACATCATGCATAAAGTGGCAAGAATGTCAGC
TTCGCGTCAGAAAAAGCATGATGATCTGGTAGTATTTACCTATACTGACTTGCAATTACG
CCATACCACCAGTAAATGCGATTTTGTTTTTTATTAGTCATATTGATTCATAGCGGAAGC
AGTAGGTATGATAGTACACACTTCAAAGTTGTGTGGGAATTAAAATGATTATATTATCTG
ACACGTGATTCGAACACAACCATAGTCGCTTCGCTTGAAACGACTACACCGTGTGTCTTG
TCCGTTAGGCCACAATGATTCTAGTTAATATTTTTTTATTTGAAATAAAATGATGGCACT
TATGTTAGTACTTAAAAACGTTAAAGGCATAGAACAGTACCTACTTAATTAAAGTTTACA
ACATTTTAAAGGATTAAAGTTAATCATTATTGGAGAAGTGCTTAGACAATTAGCGGAATT
ATTAAATAATTAAAATAATCATCAACATGAAATATAAACAATTAATTAATCAATATTTTT
TAATGATTTTTTAATTTTTATTTAATGAAATCTGTGAGTACCTATTCCTAACAACAATAC
CTGATAATTTTCTATAAAGCTCTTTTACTTCTTTGATATTAATTCCAAATCAAGATTTTT
TCTAACAATTTTAATGAAATTACTAAATATATATTTCATTGATCTGTGTTTCCCATTATT
ATGGGAGTCATAATTTGGCCTGAATTATCTATTTATCCTTTGTATAAATTTGTACTAATG
TTTGAATGTAGTTAACAAACAATCATAACTCATGATATTATTTGTCATTTGTAACCTAAC
TATTTACAAACTTCTCTATGTCGGTTTGTTGTTTAGTAGCCCTGATTTGTACAATGAGCA
TAGGTGTGACCAGATTGATGTCAATATCTTTAAGTAAATATACTTTGTATTCAATTGGTG
TACATTGTACATTTGTCTTGTATGTATATGATGGTGATACCCATAACTTAAAGAAATACT
AGCTTCGGTATGAAAATCAAATGTGGAACGCAGGAGGTGTTGGCGTTTCGTTTTATTTTA
TAATCGTTTTAAATATACTGAAACTGAATGGATTTGATATGAAATGGTTGGCATAAAAAA
GCAGCATGATCATTGAATGCTAGTCAAAATTATTAATTGTTAATATAGCATAACAAGATT
AATCAAAACAGGATATATTATTACATTAATATTATAGCCAACAGATCGGAAGAGCGTC
(2458 bp)

- SilkBase 1999-2023 -