SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomoASG_c30599_g5_i6
Scaffold_idBomo_Chr24
NCBI non-redundant
(nr)
U4/U6.U5_small_nuclear_ribonucleoprotein_27_kDa_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005634 C nucleus
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008150 P biological_process
GO:0008380 P RNA splicing
GO:0071011 C precatalytic spliceosome
Transcript
Level
FPKM:33.68 TPM:25.83
ORF EntryO_BomoASG19535_complete:A_BomoASG_c30599_g5_i6
Sequence
(Nucleotide)
GATCTCGTTCGTATAGGAAGTGTGCGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTTTAAATGTAAATTT
TAAATACTGTTGACTTAAAAATAAGACGACAATGGGTAGGTCGCCTAGCCCTCGGCGGCG
CGACGACAGACGCCGCGAAGACAGGCGAGAGAGGGAGAGACGGCGCCCTCGGACCAGATC
TCGGTCCCGCTCCCTGGACCGGCGGAGACGCAGCCCCGACAGACGCAGGTCTCCGTCACC
GCGCCGCCGCCGATCGAATTCGCCCTCGCCGATACCGAGCACCTCATTCGTGAGACAAAA
GAAACCGATCGGAGAACGCCCCATTATAACACCGGCAGACTTAGAAGGAAAAACTCCGGA
GGAACAGGAAATGTTAAAGGTTATGGGCTTTTGCGGTTTCGACACAACGAAAGGTAAGAA
AGTCGATGGTAATGTTGAAGGGGACGTACATGTGGTATTGAAACGGAAATACAGACAGTA
CATGAACCGGAAGGGCGGATTCAACAGGCCACTAGACTTCGTAGCTTAAATACCCGATGA
CTGTCCAATTGTTTCGAGTATGGGCTGCTGCGGCAGATGAGTTGACTCCTGAGGACTGCA
GTAATAGAATTTATTAGGAGCTCGTATTTGGATAGATTGACACGCCACTGCTGTCATATC
ACTTGGTGTATTAATAGATTTGTTTTTACCATTTCCCGAGAAGACTATTTCCAATCTCTC
TAAGGTCAAGATTGGCTTATATATAAATCAATTGTTAGGTATGTTTCGTGAAAAACTTTA
ATTGACTTTACATTTTACTAATGGTTTTTCTGTAAGTGAAAATAACATTTAAACTATAAA
TATGTTGAGAATGACCAACAGTGATTAGACGAGGTACCCCAAAATGATTATTACCCTCAT
GTTGTCATCTATCATTGTGCATGCAAACAGATAAAGTATTGCTCCGACCGCATAGTAAGA
TTACTGGCACAAATACACCAAGTGACATGTTAGTAAAAATATATTTAACAGTACAAGTGC
TTCCCAGGCAAAATGCCACAAATTTAATGGCACGCAGTCATGTTTCTGAGCATCAGTACG
TAAATAATTTTTTTTATATGTACTGTGAGTCATTTATTAATTTTGGTGACATCAGAGTCT
TACGTGAAAACAATGAAATACCCATACTCTTACAATTAGACCGTCATCTCACACTGTCGT
CTTTTTTTTTTTCGGGATCAACGCACACACGACCTGCAGGGTCTTGGGTTTTTTTATATA
TTACATATTGTGATACAAAATTGACCTTATTGTATGAATGTATGTATAATTTGTTCATAA
ATACAGGGATAATAAGCATTTAATGGAAACTAAAAACTTTTGAACTCATTCAAGAGGTTA
AAGTATCATTAAGGTATATTTGACAAGATGTAGAATAGCTGTCATACAGTTTTGCTACAA
TAATATCGGTTATACTAAGCGACATGACATTGGCAAGGATTGTAGCTGACAGAAACCGCT
TCCCATAACATGGCCTGAATTTACTTCAAATTTCTGAATGACGCATCATGTGAGCTGGGA
AGGAAGGGTACATCATATCAGTCCACCGATTTCTGTATTACATTTCATTTTGACAAGTGA
GACAGTTATATCATACAATTGAGCTTAACCTCTCAAGATGGGGGCGGTATTCACGTGGAG
ATGTTTAATAGCTACGATGAATTTGTAATAAGTGATGGTGACATTTTTGCCCATTAATGG
ACTGTAAACCGTTAATAATTGAGTACACATTTTGAGCTTTGGTGCTATTTCTCCAAGCTC
AGTTTAATTTGACCTAAATGATTATTATTCATACATTCATACAATAATGAATCAATACAC
TGCTATTTTTAGTATGTAAGTGTTGTCTGTTTTCTTTTATACGAACAGAAAAGCATTTAT
GTGTGTATATAGCCATTAAAATATTTTATGAATCATTTGAGTATTAAATTTTCAAAGAAG
CCATTTTTGTTTCTTATCAAATCAATATATTCAAATATTCTTTTGGCTATGTACACATTC
CCAATTGTTTTTATGCCTTGTCACTATTAAAAAGAATATCAGAATAGAACTATCGAATTC
CCATAAAGTTCTGCTTGATACTGAACATTATTTGGAAATGCCTCGATACAATTAATTTTC
ATTATCAATATTATAAGATGAGCCATATTGAGTTTCGGGGAAAATCTTAATTCGTTGCGG
TAACACTGATCAGTTTTCTCAGATAAACTACCTAGACTGATATATGTATTTAATGGGTTT
GGGAACACCATCGGACCATGAAATCTGGAACTGATCTAGAAGTTTATTTAAAACAGAACT
GTAGTATTTCATGTCGGTTTGGCTGTATGTACACAGTATTAAAAATTTGGAGTGTGTTTG
AGGGTTGTAATTTTACTGAAAATAATTAGAAATTTTGTTTGTTTTCAATCAAGTGACAAG
GCATTGCTAGTTGTATATGTGATAGTTTAATGTCCGTTACATTCAGTACCCGCGCGCTGC
TAACGCCCGCGCGGGCCCGGCTCCCCACACCATGAAGCCGACTTGAATCGTTCTCACGAC
AACACGTAATGGTTCCCCTGATGCGTTTTGGAACGTGTTGACAGGAATTTTGAACGTAAA
ATGCGAAGGTTTTTTTGACGTGACAACGTCTTATAATTCGATGGAGCCGGCTGCACGCAC
GAAAAAACATGACTCGTGCGGCGTTACCTCGCTCCGAGGTGTTCCGCGATCACGTGGCTA
AACTAAAAAAAAAGTTTTTTCTTATGACGCTGTCACGTTCAACTATTGTCAGTAAACCGA
CTTTACAGACAATAGTTTACATATAAACGCGGTCCTAGGAATGGCTTTTTGTTTGTGTCA
TCGAAAGAGACAAAACAAGGCTAACTTAAGGTCGGTGTATACGTAACGAGATGTGAATGG
GACGGGTACTCGGATCTAACGTGCTAGTGTTGTGAACAAGGATAGATAGAATTGGCTTTA
ATTGCTACTGCTCTAGATGAGGAAGTAGCTCCTATCTTACGTGGTAGAATAGAGAACAAT
AAGGAGAATACCACATTATAAAGAACTTTTGAATGATGAGACTCAATTTTATCAGTTTTT
TTGCCAAATGCCAAAATAATGTTTTGCTTTACTGGAAAATATCATCGTCAAGACGTCACT
AATTCTATCTCCGGAACGAATAGAGTGACTGTGCATACGAAATATCCTCTTTCATATTAA
TTTAGTATGAACCCATCCCGTCCGTATAGAACTTGTGACGTATGCAGCGATCTTTAACCT
AGAAGATTTTATTACGTGTCAACAACAAAGGCGCGCTAACACGAAAAAAACGCGCGGGAA
CTTTCTATAAGACTGATAGTTCGTTGTATTTTTTTTTTCGACCTCGTCCGCCGACCGAAC
CAAATAGGATATAATATAGATATATTTATATACACAATACATACACACACACATTCCCCC
CGGTTTTACCCGTGTCCTCCATAGACTACAATAGCGCGGCCCGCCAATACAGATTGTTGT
GTTCGAAAACGGAGAACTTTCGCGGTGAACTCATCGGAACTATCGGCTGTAGCAACGTTA
ACGTAAGACTAAAATTTCTTGATAACTCTGTTGAATACTGGCTAAAATTCGAAAATAAAC
ATCACATAAGCAAAGTAAAAAAAAAAAAAACAATATGGCCGCCGATTCACAAAAGTGACA
TTTGTAATGTCACTTGAAATTTTTAGTTCCGTCTGTGGTTTGTCACGTTTTTTTTTTTTT
CGTCTTTCGAGAACACAGCAGTCTGCGTTGTTGGTGCCTTCAATAGTTTACCGATATATA
CAATTGTTATTTTTTTACAATAATATATAAGCACGTACGCGGTCGGCGGACGGGCGATTG
ACGAAGGTTGCAGCGAAAACGATTCAAATCGGCTTGTCACGACATCCGCATTGATACGAA
TGAATCCAGCACAATATATGTTTTGTACGAATTTTTTACAGTCGAAAGCTCAAAATTACG
AGCTTTACTTTAATAATACAAATAAATCTTGAAATTTTTTCTAATGAGCAATAACTTCAT
GAGGGTATTTGAATAAAAGCTTTCTTATATCCATCTGTGATTGTGGTTTGGAAATGCGTA
ATAATTTTTCACGCCTATAAATGTATTATCTTGAGGCTGTATGTGCAAAAAAACTGCACC
TAAAAAAAAAGTTGATTGACATTGACTTGTTTATCAAATTTGAAAATTTTAAACCTATTT
TTTCAATCGAGTTTTCTTCATGGCTAGTTTTTTTGTACAATCAAAAACTATCGTTAAGTA
CATAGTTGATTTGGCAGTTAATGTCGAGAATATTTTTTATTTTTACTGTCATTATGTTTA
AAAAAGAACCTTAGCTTTTTGGTTGGTTTGAAAATTGTAAAAACCAATTTCAGCAAAAGT
CAAACAAAACAAAAAGAACAATGTAATCTTTGAAATGTTTGGTAAAAACGATTCATTCCC
ACGTGTAAATACCACGTTTTATTGTACGAAATTAGGGTTTGTTTTTTAAGAATAAAATTA
ATTTTAAACTCTAAATTGATGTAATTTTTTGATTGATGTAAAAACTGTTTCC
(4612 bp)

- SilkBase 1999-2023 -