SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomaMSG_c21839_g1_i2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		small_GTP-binding_protein_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003924 F GTPase activity
GO:0005525 F GTP binding
GO:0005622 C intracellular anatomical structure
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005794 C Golgi apparatus
GO:0006810 P transport
GO:0006886 P intracellular protein transport
GO:0006913 P nucleocytoplasmic transport
GO:0007165 P signal transduction
GO:0007264 P small GTPase mediated signal transduction
GO:0008152 P metabolic process
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016192 P vesicle-mediated transport
Transcript
Level		FPKM:10.01 TPM:4.47
ORF EntryO_BomaMSG11099_complete:A_BomaMSG_c21839_g1_i2
Sequence
(Nucleotide)
ATCTGACTTACGTCAGTGGGTGTTTCGTTCGGCGGCCATTATCCTACGTAGAATTAATTT
TTTTTCGCTATTTAGTACTAGAAACAAAGAACTTAAGTGCTTTCTATAAATTCGACAACT
AAATTGTGTGAAAAACAATTACTAGTACAAAAATAAAAAAATGAATCCAGAATACGACTA
TTTATTCAAACTACTCCTGATTGGTGACTCTGGAGTTGGGAAATCATGTCTGTTGCTAAG
ATTCGCTGATGATACGTACACCGAGAGCTACATCAGTACTATTGGCGTGGACTTTAAAAT
TAGGACTGTAGACTTAAATGGCAAGACAATAAAGTTACAAATATGGGACACAGCTGGACA
GGAGCGGTTTAGAACCATCACCTCATCATACTACAGAGGAGCACATGGAATCATCATTGT
ATATGATTGCACAGACCAGGATTCATTCAGCAATGTGAAACAGTGGTTAGAGGAGATTGA
TCGTTACGCTTGTGACAATGTGAACAAACTGCTCGTCGGTAACAAGTGTGACTTAACCAC
TAAAAAGGTTGTCGACTTTAGTACAGCTAAGCAATATGCGGAACAACTGGGCATTCCGTT
CCTCGAGACGTCAGCGAAGAACTCTACGAACGTTGAGCAGGCGTTCATGACGATGGCGGC
GGAGATCAAGGCGCGCGTGGGCCCGCCCTCCACCGGCGCCGCGCCCGCCGGCCACGTCAA
GATCGATCAGGGACAACCCATCGACACCGGCAAGTCCTCGTGCTGCTGAATACTGCCTGC
TTACTCACGAGCGTGCGTGCGTGACGCGAGGATAGAGACAGACGAGGACAGTTCCGGTCA
CACCCGCGACACTACAACAATGAAATTACAACAAAAAAATATCGCAACATTACGATTATA
AATAAATAAATTTAAACAATTTTGTGTGACGCCCGCTCGTCCACCGCTAACGTTATTTAG
TTGCTGTCAGGTTAAAATTTAGAATGAAAAAAAAACGAATAAAAAAATATTTACAAAAAA
ATAAAACGAACGGTGTAGTGTATGAACGTATGTTCGTACACATGTTTATATATATAATGA
ATATCTTAGGTTAATTTTGTGCTGTTTCCGGTAAGACTATGATTCGATAACTGAGCGACG
TTAGGATGTGTGTGCGCAGTGCGATGGTTGGAAACACAGGTATAAAGCGGCTTTCAGACT
ACGATATAGTATGCCAGCATATAGTAAGCCAATAATATATAGTACAGTGTGAACGTGTCC
ATAACAATGTATGGTGCGCGATATTGTTGTGCTATGAGCTATATACTATATTATATTATA
GCATAGTCTGAAAGCGGCCTAACATTGTATAGGAACGGGCCTTGTAACATATTCGTAAGG
AATTAGCTAATGTTCCGGTGGTCGCACACTGGGACTTGGGGCGTCATACGATATGTATGT
ATTATAGTATTTGTAACTCCATGCACATGTGATCGAGCGAAAACCAACCTAATTTTAATA
GATACAAAGTTCGATTTTGTTTCGATCGTATAAGGCGAATATTTAATAGATTCGTCGAGC
TTAGTGGCCCGATAGGAGTCGTGCCAGACTTGTCTATGGCTATCGATAATTTATGTAAAA
TGTTTGGCTTGCCGTGAGGGACCAAGCACAATTCCACTGAGTATCTAACATTAAATTAAA
AAACAATATACCTAAACCTGTGTTTCGACAATTCTCCGACCACCATGTACACGTGTGATT
ATAGAATCAGTGATACCACAGTAACATTGTGACAGTGTGTGACCATCATAAAAAAAAACT
TAAGTGAAGAATTAAAAAAAATAATTAAATCTGTCTTTCTAATACTGTCCATTACGCATA
GGCTAATTATAGGTTTTTTTTTTATCAATATTATTATATTCCAGCTTGTGTTAAGTTTTT
TATTTTATCATCACTCGAGGTACTAATATAAATATGCACTGGGTGTTTTAATATTTACAT
TGTAATAATGTTATGTCGAAGCCTGTAAATGTTGTGCTATGTTGAAAATTTTGTGTCCAT
CCGAATGATGATCACGGAATTGTAGATATAGCTAAACGCCCCTAGATTTAGACACACACA
TAAACACAGTAAATTTGTAGCAGTTTAAAAGCAGTTAACGCTTCGATGAACAGTTTAAAA
AAAAAGTCTACAAATCCCTCTTGCTTTATAAAGTTTAATGTGATTTAGTTGCAAATTGAA
TGTAACTCCGATATTTATTTGAGCACCATTTTGAACTGTTGATCGAAGGTAATATAGTAT
TAATTAAAAGACATATTCAATATCACGGCTATGTGATAGTTAATTTTTTTTTATTGCCTA
CTTACAAAGCTTTACATTATTAATTGTTGAATCAGATTTTTTTAAGTTTTGTAAACTGAT
TTAAACGTCTGAATGAAACAACAATTTGTGATGTGGGGATTTTATTATTAATTATATAAA
TTATTTTATTTAACTCCGGTCTATTTCTGTAATAATTCGTTATTTTTATACTATTATTAC
ATCAAGGTTAAGTTTACTTAATGTCGAGTCTGCTGGCCCCTGTAATTTCTGTATCGAGGG
TTCATTAGAAATTAAAACAGTATGCTATGAAAAAAAAAAAAA
(2622 bp)

- SilkBase 1999-2023 -