SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomaMG_comp61972_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		PREDICTED:_LOW_QUALITY_PROTEIN:_centrosome-associated_zinc_finger_protein_CP190_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003682 F chromatin binding
GO:0005515 F protein binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005694 C chromosome
GO:0005700 C polytene chromosome
GO:0005704 C polytene chromosome band
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005813 C centrosome
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0005874 C microtubule
GO:0005875 C microtubule associated complex
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007017 P microtubule-based process
GO:0008017 F microtubule binding
GO:0010468 P regulation of gene expression
GO:0016568 P chromatin organization
GO:0031208 F POZ domain binding
GO:0031937 P obsolete positive regulation of chromatin silencing
GO:0035191 P nuclear axial expansion
GO:0043035 F chromatin insulator sequence binding
GO:0046872 F metal ion binding
GO:0051493 P regulation of cytoskeleton organization
GO:0090202 P obsolete gene looping
Transcript
Level		FPKM:5.18 TPM:4.80
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
AGCCAGTAGCAATATGGTTACCATATAATTTTAGGTATTACTTAATTATTTAGTGCATGA
TTTTTTAGTACTTATTTCAAACTAATTACTATTATTTAACTAATCATAATATTAATACTT
TAAGAATAGCATTGATGGGACTTGATTTGATAAAAAGTGAAATATATTTTCTTGTATAAC
AAATATCTCATTATTTATTCTATAATTTAAGCATTATACTACATAGTACATATTTTATGT
ATGAACTCAGCCCCAAAGTTCGATGCTAAGTATTAATTGATTTTACTTTCCTCATCGTCA
TCATCCCAATCACTGACTAAACTTTTTATTTTGTCATCTGGTTTATCGGTTTCATTATCT
GGTGCAGGATCATGTGAAGCTTTTTTCTCAGCTGTTTCTAAAAGTCCACTATTTGGTTCA
TCTAGAATAACTTTTTCTGTACGATTATTACATTCAGTGGAAACTATCCCTTCATTTATA
TTTGCTAATACATTTTCGATTTGCTTAATATGTAAAGGGTCACCCATTTCTTCCCTGTTC
CTTTTTGGCAGACCACTGTCAGATATTCCTTCACTGTCTTTTGTCAAGCAAATATCTGTT
TTCTCATCTGCGTTTGTTAGGTCATTATGTACCTTTTCTTTGCTAACTTTTATTAGATCC
TCATCATCTTTCTCATCATTCAGATTGGGTAAACCTCTATCAATATTTTGTATATTGTAA
TCGGGTAAATCATTTCGCAATTTTTCTTCATACTCTTTTGGTAATATATTATCAATATTT
TCGTCATTGCTACTCAAATCTTCTTGCGAGTCTTCCCAGTCACTTAGCAGAGATGATATG
TTATCATTTGGAATTTTAGTTGTTTGTTTGTTTGGGCTCTCAGGTTTTGCAGATTCAGTT
GGCTCATTTAAATTTTCAGGTAAGAGAGACTCAGTGTTCACAGTTCCCTCTTCAATATTT
TGAGGCGTTTCAGTTGATTTTGTTAATATCTCTTTAGAGTCTTCACAAATTACTTTATTA
TCATTGATTGCTGGTGGAGAATCGTACTCATCTTCTGACCATTCTGATGTCAATATTTGA
ATTTTTTCCTCAGCTGCTTTTGGTACTGCTTGCGCAGACACTTGCGCAGACAGTGATACT
TTACATTGTACAATTTCCTCAGCTGAATCTATAGAATCAACATTATTTTCTAAACTTAAA
TCTGTTTGTTGTGTAAATGTTGGACTACAAATATTCTCTTCTTTGTCTATGAGGTTTTCA
CTGATATCATTTAATCCCATTTTAGTATTACAATCTAGTTTTGATTTAGTTGAATTTTTA
TCAATATTCTCTAGATTTTCTTCAACTGTTGGAAGATTTTCACTTGATTCTTCTGTAAGC
TGTTCATTGATGATCATGTTTTCCACTATCGTCCCTTGAGTAAGATTGCTTGAATCTGTA
ATGGGTGTAATTGTTGTAGCCGGCAATGTCTCACTTTGTGTGCATTTTTCATTATTTTCC
TGAATTGGCTCATTTATTAATTTACTTTGTATGGTTTCTTCTACATCCATATCTACTGGT
GAAGGTGGTTTAGGGGGGACTTGAACCTCAGGCGAAACAATTACACTTTGATGAGATGTC
ATTTGAGGTGTATTTTGTCCAGTTTTTTCTAAGTCAGCATTTGGTTTGTTACTAACAGGC
ATTGGAGTTATGTCATTTTCCCATTCTTGACTCTCAATTACGTGAGCATTCATGACCGGT
GCAGTAGTAGTGACAGTCTCGAAGTTTTGCGTAATTATAGCCGATGATTGTATTAACTGT
GTTCCTATTCCTTGTGTAGTCAGAATTTGGAATTGTTTGTTTGTGCTATCAACAGGATGG
CTATAAACTACTACTATGTTTGAATTGTCCGTTACAACTGACTCTGTTACATTTAATGGG
TAATTTTCTTGTATGATCATTATATCATTTGACTGAGTGTTGTCAAGTTCCATACTCGTT
GATTCTACATTGGAGGTGTGGGGGTTGGATAAAACAGCTAACGTTTTGTTAGAATCACCA
TTATCAAAAAGAATTGGATGGTTTGCAGTCATTAATGCTTTATATTCTTCTTCATTAGAA
ACAACAAACTGGATGGGTTGATTTAAGTTTGTTTGCTTACTCAAGATGACATTAGATTCA
TTTACAGTTTCTATTAAATTTGTATAGTCTAACTGAGTTGTAGAGGTAGATGTTTGTTGC
ACTGGTTCTGAATGCAACATTTCTGGGATGATGAATTCTGGTTCAGCATTTTTAGTTGAT
CTTGGTATAAGCTGATTATCTTTCAGGATGTACTCTCTGTCATCTATCATAACAATTTCT
TCATTTGTAATAACATTACTATTGTCTTCTTGAACATGACCTTTTTGCAGAGACGTAGTA
ACATTGTTAATTATGTTACTGTTTTCTTTGTATATTTGTTTGGGTTTAACTAAGTTGAAT
TCAGGATTAAGTATTTTATGCTTTTGATTTAAAGGTGCTTTTATTTCACCATTAGGAATA
ACATGGATATTTCCGTCTGGTTGAATTTGATAGTGTACATTAACTTCTTCATAGTCATGT
GAACGAACTGGGGGAATCTCAATCTCTAACTCCAATTTAGGTTTTTTATCTTTTGATTTT
TCTTCATCTGAGTCATCAATTATGCCACTCGATTTATCCTCTTTTTTGTGACATGTTTTC
AGATGATTATATAGGCTGCTTTCACGTAAGAAGACTTTTAGGCAATACATACATTGAAGG
TTGTGTTTTCTTTCAGCAGAATATTTGTGACCTGTCCTTTGAATGTGCTGGAGAAGTAAA
TTTGATGAACTAAAGTGTGTAGCACAAACATTACACTGAAAGCTCACAGTTGAATGTGTT
AACTTATGTTTCATTAAATATCCTTCACCCATAGCTACATAATTACATTGATTACATTTT
GGGAAATTATATGTTGGTGGTGGCTCAATCCCATGTTTTGTATACAGATGGTAAAGATGA
TAATTTCTTTTTAATGCCTTATATCCACAATATTCACATATATTGACTACTGGTTTTTCA
TTGTGCACTTCAACTAGATGTCTTCGGAATTTATAATATGACATAAAATGCAATGCTTTG
CCTGGTGTTCCACATATAAGGCATATCCAAGGTCCATTAATGTTCTCTGCCCCCATTGCT
ATTAACTTAGCTGCATGCTTTGAATCTATGACATCAGTCTCATAGGTGAAGTTAGAATCA
TGTCTTTCAACTTTCTGCTGAGAATTTTTCTGTTCACGAACAGTGGATTGCTTCTTTTTG
TTTGGAGTGTTTAATATTTTCAATTTGATATTTTTACTACCTTTCAATAAATGAGAGTAT
TTCTTTAAAACTTCACTTATTATTTTAGCATGATCAAGATTTGCCGATACTTTACTGTTT
TTAGTGTCTATTGTTATTTTAGGAGCATCATTCTGATCTAAAATCTGATCAAAGAGTTGA
TTGGAGTCCATAATTGGTTTATTCTTCTTTAAATATGTTGTTTGGAACATCTCATTTTCA
TCAAGTATACCACTCTCCAAGTAATTATCTTCAAAGATGTTATCAACACTTTTCTTACAT
TCTATAATGTCTAAAGTTGTTGTGTGTTTACTATCACTTGAAGAATTATTGAACAGACCA
CTTTTTTTAGAGTAACGCTTCTTAGTGTCAGGATGTACCATCAACGGTTGAGATGTATAG
GATATGTTACAGAAGGAACTGTCAAACACCCCATCACCATCAAACTCTTCTGATAGCTCA
TATCTTGTAGGTTTTGGATCTGTCATTGGGTTTTTTTTATTTTGTATATAAGGAGATGAT
GGACGGTACATTATTTCTTTATTTATATTCACAGGTTTATATACTTTTTTCTCTTTGCAT
GCACTCTTGTTGTCAAAAGCTTTACCATATGAGCGTTTATTACTAGTAGATGGAGTAGGT
TCAGAGCTTTTATGTTTTGGAGCATAGCACTGTGGATTCTGACTGGCACGGTGAGCTTTC
AGAAGTTTAGTTAGCACAGGCATTTTCATAATGAGAGAAGTTTGGTAAAGTTTCTCAAGT
AAATCCAACCTGAACTCTAATTGTCCAGTGTACATGAAGTTCACTATAGGTACAACGACA
TCAGCCTGAAGATCGTCCGGCATCACGAGACAATCTTCATACATTTCGCATGTTCTCTCC
AAAACTTCAAAATATTCTGTACAAGCATTTAAAACCAGTCTGTGGACTTTCAACTGTGCG
TTGTCTTGGAATTGTAGCGTTAAATCACAATAGTCAGTGCGGTTAAAGAAATGTTTTAAC
CTTTGGAGGAAATAAATTCCCCAGTTATCCACTTTCACTTGCCTTAACTCCGACATAGCG
GCGGTTTCAATGTTTTTTCATTATAGGTTATATTTGCAGTATATATATATCTCATCGAGT
GAAAATCAAAATATCGTAGTTTGTATTTCAATTACTTGACTTCAACACGACTCTACACAG
TTTTACTTCACTAAATTTGACCGAAGTTGACA
(4532 bp)

- SilkBase 1999-2023 -