SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp25775_c2_seq15
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
putative_pol-like_protein,_partial_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0005575 C cellular_component
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0006313 P transposition, DNA-mediated
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:0.29 TPM:0.27
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
GCGGGATCATTAGTGGTTTGTGCAGCCAACATGGCGGTCACGAGACGTGTATACATTTTT
GGGGCATTCCTACTCAGTGTACTGTCAGTGTTATTAACAGTCGTAGCAATTTCCAGTGAT
AGTTGGGTTGTGTCGACAGCAACAGCAGAAATACAATCAAGGGACAGTATTATTCGCTAT
GGACTGTTCACGGGAGAGCTCACTCTAAACACACTTGTCACGCCAATGTCGAATGCTTTG
TTCATGACCTGCCTATCCGAGTTCAACGCTTGTGCGTTAAGCTGTAAAACAGAGGAGAAC
GCGAGGATTATAGAAGTGGAAGCATTGGCCCAAGGATTTAGACCCACACCGGCCTGCACA
GCTGTTACGGAAGTGGACCAAAACGATCCTTTGTATCCGCAGCCAGTTTTGTCCTATGCT
GTCTACGTTGCGGTCATTGTGGTACTGTTCGTTCAGCTCGCTTTCGGCTTAGTGGCTGCC
TCTCTGGCCATTTTGAACGCAACGAAGAACCCCACTGAACCGATCTTCGGGTTACCAGGG
TGTCTTTGGGCAAATGTCTTGACTGCACTACTTGGCTCGATTGTTTTGCTGATCTTCGGC
ATATACTGGTTGGTGTCAGGCTTGAAGGACCATCTGGCGATATCGTATATAGCGCTGGGT
CTTTTCGTCCCAGGTCCAAGCTTAGGATACTCTTATTGGATCCTGATAACTTCAGTATTG
TGCAATCTGATAAACGTTTGTCTGATACGTCTAAGATCGTACCTGTTAGAAAGAGATCCG
CCACCGCCAACCATTAAAGTCGACAATCATTCCGACGGCACCATCTTTCTATATTAATAT
CTACCTTACTCATAAATTTATCATTAAGAACTCTCCAATAAAGAAATTTAGGAGATGGGT
GGACGATATTAAGGCAGCTGCGGGAAGCACATGGACCAGAACAGTTGAAAATAGAAGCTC
ATGGAGGCAGTTGGAGGAGGCCTATGTCTATAATAGACAAACAGACAGAAACTAATAATA
ATTTAGGTACAAAAAAAAGAAATCTTCCATAAAAATTTAAGTAATATTAATACCACTATT
TAAAACATATTATAAAAAAAAAAACAGACGAGTTTTTTTTTTGGCGCGTAAACGTGAAAA
AATTTAGGCGCACTGAATTTTAAAATTTGTTTTAAATATTTTTAACATAGTAATTTAGTG
TATTGTTTTGTAAAATAATTTCATAGTATATGGTGGATAAGTTTGTATAAATAATTCGCT
ATGAGGAGAAGCGGGAAAAGGAAAAAAAAGAGGAAGGAAGATGAGAGCGAAACGGACGAA
GGGGAAGAAAATTGTTTCTTTTCCAATACTTCGGACTCAGAAAGTTTTACACCAGAAATT
GATCCGTATAAACCTTTTCAGGTTGAAAATTATCACAGGAAGTATCCGGATAATTCCAAC
AAAAATGAATTTATCGTATTTCTTTCTCATATAGTTGATGATCGCACATTCACTGACAAA
GACCGCATGTATCTTTCTCAATGTATTCGCAAACACGGCGTCTCAGGTGTTTTACATTTG
AGAACAATCAATAAATTTAAAGTTGGTATTACTTTTGACCTGGCCAATAACGCAAATGTT
TTCTTACAAAATAAGAAGCTATTAGAAGAGCTTCGGTTAAAAGCAAGCATACCGGCCTCC
GATACTGAAATTACTGGAGTGTTAACTTCAGTACCAGTAGGATTATCAAATAAAAAAATT
TCAACTTTAATAGGTAGCTCTCGAAATATCATTCAGGTTCGTAGGTTTATGCGTAGGGTC
AAGAATGACAACGGGTTAGTCACATTTCAACCAACACAGACAGTGGCAGTGACATTTGCT
TCGACACAACTCCCACAGTACGTATACTTGGATTCTTGGCGACATGAGGTATCTCAGTAT
ATTCCCCAAGTAAAACAGTGTCTAAGATGTTTGAAGTATGGTCACATAGCTAAATATTGT
AAAAATGCAGAAGTATGCTCAATATGCACGGAAAACCATAACTTTAAATCATGCACAGTG
GCAATAATCAATGCCAAATGCGTAAACTGTGGTGGGAACCACGTTGCCATCTCATCTCAA
TGTCCTATTAAAAAGAAGAAAGTAGAAGAAAATAAAATAAAGTCTAAAACTGTTACCTAT
GCAAATATATTTGACGAAAAATCTTTTCCACAACTTACGAACAGACATATAGAAACTCAA
TTACAAAACTTAACTAAGTCCGAAATTTTTATGAATCTTTTAACCAAATCAATTCTTAAA
GTAATTAATGACCAAAAAAATGATATACCAATTAACACTGGTTCCATACGTAACATCCTG
CGTGAAACTTTCAGTCAAAAAACCTTATTTCCTTCTTAATGGATCATTTAAATATATTAC
AATGGAACTCACAAAGTATTCTTTGCAATAGATTATATTTAACACATTTCTTATACGAGC
AAGATATTCATTTAGCAATTATATGTGAAACTTGGCTTCGTCCAGAAACCGTTTTCAAAA
TTAAAGGTTTTAACGTTGTTAGACATGATTCAGGCAATAAGCACAATGGAGTGGCCATTT
TAATCAAAGATACTATTCAGTACAAGCATTTGCCAACTTTTTCAGATAATGGTCTCCAAA
ACATATGTGTGACAATTTTTCTTAATAATAAAGAATTAAGTTTAATTAGTTGTTACTGTC
CTACTTATAGTTATCCCAGATTCGATAAAACTAAATTAGATAATCTCATAAAATCTATTC
CACATCCTTTTATTTTGGCCGGTGATTTCAATGCTCACAATACATCTTGGGGTTGTAATT
CAACATCACGTCGTGGTAGAGAGATTTTAGACGTCATCAATGATAATTGTCTAGTTCTGT
TGAATGATGGGCAGGTTACTACTGTTGGATCTTCATCATGGCGTCCAAATGCATTAGACC
TTACAATAGTTTCTCCAGAACTTGCCATGTCTTGTGAATGGTCTGTACATAACGATCCTC
TCGGCAGCTATCATCTTCCAGTATTAATTAAATTCCATTTAACAACTGCAACTGATATCC
ACAACACACTTCATACAACTCTTCCTGTTTATCCAAATTACAAATGTGTCGATTGGAATT
CTTATAAAAATCGTGTAGATGTTGGTCTTCAAAAAATAAATTTCAGCCAATATTCATCTT
TAGAAAGTTACGATATATTCTGTAAATTATTGGTCGATTCAGCTCAGGCTTGTAGTGGCG
TTTCTCGTAGTAAACAAAATATATCATCTCGTAAAGGTCCTATTCCACGACCTAGACTAC
CTTGGTGGAATTTGAAATGCTTTGATGCTGTTGTAAAATCTAAAGAGGCATATGTGAAGT
TTAAAAATTGTCCATCACAAGAAAATTATATAAACTTTAAAAAACAACAAGCTTTTAAAA
AACTTACATTAAAAATAGAAAAACATAACAGTTGGGTCCGTCTTTGTGAATCATTCAATC
GCTCAACACCATTGTCTTTGATCTGGAAACATATGAGGAAATTTGGTAAAATTTATAATT
CAAAAGGAGAGCAAGATGGTTGGGTTTTGGAGTTTCTTGAAAAATACAGTTCTGTTTATC
AAAATCAGCTACAAATTGAAAATGTTTTGTCAACTAATAACAACAGTTTTTTATGTGATT
CTTTTACTCTCCAAGAGTTGAAATCTGCAATCGCTTCTCGTAAAGATACAGCATTCGGTT
TTGATGGTATTCCATACATTTTGTTTAAAAATCTCAGTGATTCTGCTCTGAGAAAAATAT
TGTTGATTTTGAATGAATTGTGGTTAAATATTGAAATCCCAACAGACTGGAAAATTGACA
TTTTAGTACCTGTATTAAAACCTCAAAAACCTAAATACAATGCTAATTCTTATCGCCCAA
TAACTCTCACTTCATGCGTGGGTAAACTTTTTGAACAGTTGTTAAAACAAAGATTGGAAT
TTTTTGTTGAAAAATATAATTTAATATCTGACAATCAGTATGGTTTTCGTAAAGGTAAAT
CTGCACATGAAAGCTTCTGTCAATTGCATTTAGATATTTGTAATAGTGTTGTAAATAAAG
ATTGTCTTGTTGCTGTATTTTTTGATATTTCTGGAGCATTTAACAGTGTTGATATTGATG
TCCTCTTCAACGAACTGTGTGGTTTAGGTATACCATTGGTTCTGTCGTTAGAGGCTAAAT
TTCTTGGTGTTTTATTCACAACTTCATTATCCTGGAATGAATATGTAGAATTAATTATTG
CAAGAGCCAATAGAGCTTTGAATATATTAAAGAGTTTGTCAAAAATCAGTTGGGGAGCAG
ACCCTAAAATACTGCTGATGTTGTACAAATCATTGGTCAGAAGTCATTTTGAATATGGTT
TTTTGTGTTTTGGTTCAGTCCATAAACTTGTTGATAAACTTGATAAAATACAAAACAATG
CCTTACGCTTAATTACTGGTGCATTTAAAACCACACCTATTAATGCAATGCAATTAGAGT
GTAATTTACCACCAATCAAAATCAGACTAGAGCATCTAAAAGAAAGATTCATTTTAAAAA
TATATACAAATAAAAACAATACATTACTTAATTATTTGTCATCTGCTTCTTCTACTTTCT
TCAATAAATGTCCATTTGTTCTTGAAAATATATCTGGGTTTCTTCAATTTCTTCATGATG
CACATATTCAGCGAAATGAATCCCATTTTCCTTGTTATCAAGGTGAATTTGAAAGTAAAT
ACCCTGATATAAATATAGTAATAGATTCTGAATTACATAGAAAAGAACAAGTATATGAAA
AATTTTTTTCTTGGCGAGATCATAGATTCATTTATACAGATGGGGCTAAAAATGATATAT
GCACATCTTTTGCTGTTTATGATAGTGTCCTGAAAGATGGACTTGGATATAAACTTGATA
ACAATTTGAGCATATATTCTGCTGAAGCTGTTGCAGTTCTGTCTGCATTGCAACATATAG
ATAAGCATAAAATTACTTGTTCAAAGTGGGTTATTGCCACTGATTGTATGAGCCTATTAA
AAAGTCTTGAAAATAATGTAAATAAAACAAATGTAAATTATTTAGTGTATAGTATAAAAC
AACTTTTGTATTATTTGAATGTAGTTTGTCATGTAAATATTGTACTAGTTTGGGTTCCAT
CCCACATTGGCATATTGGGCAATGAAAAAGCTGACCATTTAGCAACCATGATAACAAATT
ATAGTGTGGGTTCTGTCCCATATTTTGAAGTTGGAATTCCTTTCACAGATATTCATAGTT
GTCTTAAAAAAAGAATGTGTGATAACTGGAAGAAACATTGGGATCATTCTACTCAAGTCT
TATCTAAGGGTACTTGGTACAGTCTTTTGAATTCTGAAGTAAATAAAAGACCTTGGTTTT
GTAAAGGAGAATATGTAAATAGAAAGTTTTATTCTATTTTATGTCGTTTGAGGTTTGGTC
ATTGTCGTCTGAATTACCATCTATATCGTATGAGAATGATTCTCAGTGACTTGTGTGATC
GTTGTGGAAATGCTGAACAACAATCTATAAACCATATTCTATTTTCTTGCCCATCCTTTA
ACATTCAGCGCCTTGTGTTAATGGATGAGTTACAGGACGTTTATGGATCTTCAAATTTGG
TACCGCGCTGCATACAAGATCTATTGAAGAATGAGTCTACATACCAGTATATTTGCAAAT
TTTTTGTAAATACTGGAATAGAATTATAATCTAAATTGGCGATCTGAATTATAAAAAAAA
AAAAAAATTCAATTTGACATATGTCAGTATATTTTCAAGGAAAAGATTACAGGACTTGAC
GTACCAACTAAGAATACTATGGACTGAAAACACTCCCGGATTATGAAAAATGAAAATGTA
GAAAATGAAATAACGGAAGACAATACATTGTTACTTAAAAACTTAAGACTAATTTTACGA
AAGACGAGGCTGTAAGGACTCAGTCCATTGCCTGCTTGCAAGAGCAAAAC
(5990 bp)

- SilkBase 1999-2023 -