SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomaMG_comp25735_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		RNA_binding_region_containing_protein_1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0003729 F mRNA binding
GO:0003730 F mRNA 3'-UTR binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005829 C cytosol
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0006977 P DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
GO:0006978 P DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator
GO:0007049 P cell cycle
GO:0007050 P regulation of cell cycle
GO:0008285 P negative regulation of cell population proliferation
GO:0008380 P RNA splicing
GO:0010830 P regulation of myotube differentiation
GO:0030154 P cell differentiation
GO:0043484 P regulation of RNA splicing
GO:0044822 F RNA binding
GO:0070935 P 3'-UTR-mediated mRNA stabilization
Transcript
Level		FPKM:3.41 TPM:3.16
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
GCATCGTACATCAGTCCGCGCTCAACTACCACGCCGGTCACCCGCCAATACGCACTTCAG
TGTTTACAAGTGAACTCGCGTGGGTAATAAACTCGAAGACCGCGCTCGCGGTTGTGATAG
TGTTTCAAGAGTGTAAAGGTGGCCGGCGCAACGGAGGCGGTGCAAGGCATGTTGATGGCG
GGCGCTCTGCCGGCCGAGTCCGATGGACTTCTGGCTTTGGGCGCATTGCCGGGCCAGAAA
GATACCACCTGGACCAAACTTTTCGTCGGCGGACTGCCGTACCACACAACCGACAAAAGC
CTTCGGGAACATTTTGCGGTTTACGGCGACATCGAAGAAGCCGTCGTCATTACAGACAGA
CAAACCAACAAGAGCAGAGGATATGGCTTTGTGATAATGGGTGATAGGACTGCAGCGGAG
AGAGCGTGTAAAGATCCGAATCCCATCATAGATGGTAGGAAGGCCAACGTTAACCTCGCT
ATTCTTGGAGCTAAACCTAGAGGGAATCTCGCACCAGGGTTTGGCTTGGCCGCTGCCGCG
GCTGCAGGAGTGAGGGCAGGCTATCCGACTGTTTTACCGGCGCACTATGGGTTGTCTCCT
GGATATGTGTACGGAACTCCGAGTTACATGGGCGCTATGAGTGGCGTCGGTGGTGGTGTT
GGTGCCGGCGCCGGGGGGCTGGTACAATTGCCTCAGCTCCAACACGCTGCGGCAGTCGCG
GCTGCCAACCACCTATACGAATACCAAGCTGCCGCAGCCCAGGGTGCAGCTGCGTACCAA
CAGCAATACGCTGCAGCAGGATTTGATCCTTACGCCACTGCTGCAGCGGCCGCTGCAGCC
ACAGGCGCTGGTTACGTCTCGCCATACTATGCGCTGCCAGGGGGAGGAGTCCAGGGACCG
CTACTTCCACCATTGCCGTATCCTCCTCAACTGCAGGAGGCGAGGATGCAGTAGAAAGTT
TTTATTATTAACCCGAGCTACGTTTGTGATATACAAAATTCAGATTACAAGGATTTTAAA
GAAAGGTTAAGTAGAAAATTTTGAGTAACAAGTATTCTGACATTCGTTATTGAAAAAGAG
AATTATTTAGTAAAAATATTGATTATATATATGTAATTGAAAACGTTTAAGTTTAACTAT
AATCGGGAAATAAGCTCTGCCTTAGATTGAAACACACGAGGAATGGGTACTATGAAAAAT
CACAAATGTAGCTTGCGATTCTAAAATTGATTTATTAATATAGAAATTTAAGTACTTACT
AGAATCGAATTTTCTAGATTCTGTTAACATGCAGCAGTACGAGGCCAAATTGAAGTTTAG
ACAAGAATAGGGAAGACATAGTTTCTATCTATTTAACCAAATGAACGCTAATCATGACCA
AAGCTATAAGCTTTTATTTAGAAGTTAGAAAGTATTTGGGTACACCGGCCAGTATAGTGA
TGTAATAGTAATAATAGTTATTATTTTACTAAAGTAATAATATTAGGTAACTGATATATT
GAAGATCGGTTTAATAGGATTACTTAAGTAATCACCAGCGACTGAAGCTGGTGTACAATG
ATCTTACGCGTCTACACAGTTTCTAATAACCAACATTTTGACATAATAAAACCGACTTCA
AAACAATAAGATGACAATTTCATTAATGTATGTAATTGAAGTAAATGTAATGTGTATTAA
TAAGGAGAACTCAAAAACTACCAGTCAGACCCTGATGCAATTTAAATGGGACCACACGGG
AAGCACCGGCTTTTGAATGAAATTATCAAAATTCAGTTTACTTAGAAAAAATATCTGAGT
TATGTGAAACATAAGAAAAAACAAACGAATTATATTATTGAAGTCGGTGAAAAATAAACA
GTAATTATGTACAAAGATATAAAGTTGGTTGTCAACTTGAATGAATACAGTTAGAAAAAC
CATAACTAGAGGCTAGTTTATATTGGCACTGAAGTGTATGCATTGCCCCAGCAATGTAAT
GTGTTGATATATATGAGAATTTTATTTTTCTAAAACTGATGAATAGCACAGGCTTGCTAA
ACTTGACATTATAACCTTAGTAAATTCCAGTTACAACCTGGTTTCTGTATTTAATGTTCG
ACGATCGATATTTTAAATTTAAATTCGTTTGCAGAATGCAATTTCAGTGATTAACAATAT
AAAAAAAAAATTGACTTAAAGATTATATATTAGAAATAGCAAAGAAGCTCTGAAAGAAAT
TATATTTGTTCGTTCTATTAACATGTCCATGTTGCTCAATAAAGCCTGCATAGGGCTTCA
TTTAGCTTAAGGTGAGGGAGAGCAATAAAGGGCTATAGTATATTATACTTAAAACGTAAG
TTACTGTACTTATTTTATATATCGAAAACCTATGTTAGTAATTGCCCGTAAAATATTTAA
TTATAGTTCTTGCTCCAAAGCGGTATAGGGTACTTACTAGGTAGAATAATTATTCAATTA
CTAGTCCATGTAATTTTTAATTTAATGAGGATCATAAGATTGTCGGTTGCGTAAGCTGTT
CTAAAAAAAACAATTCAAACTTCTCTCAATCAGCTCCTTGCCATTTGACAGCTGATAATT
TAAATTTAGAAAAGCTACAAACAACCGGCGATATAGTGTAATAATTAATCAGTAGACCTA
ATAGATTACTGAAATTTAGCATGTAAGCTTATATAATAATAATTATAATATTATGCTGTT
ATTCGTAATTTATTTTGTTGATATTTGTAAATCTACATGTTGATAACTATTTATTATGAA
GAAAAAAAAAAGAAAAATATTGTTACTACTGCTGACCGACTAGCACGGGGCACATATTAT
AATATCTACATTATGTGAAGGTTCGGATTAAAATGTAATAAAAATATTAAACCCTGAATT
TCCTATAATGTTCCGTAATGAAAATCTTTTCCTGATACGTACGATAAAATTTTCAAAAGT
GGATTTAATTTGATTTAAATGCGGTGTTTACATACTTGTTAAAAAATATTAAAGTAGGTT
ATTATACTATTTACGGAAAGGTTATTTTTTTATCATCTCTGACATTTTTCTTTTAAGAAA
CTTAATCACTTAATCACGTCCCAAACTATAAGTACTCAGTTTGGACATTGTAAGTGTTAT
TGCCGAATTTTCACTAAACACTCATCAAATAATCCACACAAACGTGTCTTATAAAATATT
CGATCAGATATCACTATGGTATTAAAATATAATTAGGGATCCTTGTACTGAGTGTAGTAC
GTATAATGTGTATAAAAAGAAAATACCGTGTACTCAACATGTACAAGTATTTTAGTTATG
TTTTCGAAACATTGACTTAATAAAACTGAAATTTATGTATTGTACGATTCATTCTTTTTC
AGGAGAAATATTTTAATTAATCGCTTTAGAAAATGTATGTAACGTACATATGTGTATGGG
GTGCGAAAGAATTGTCATAAAACTGAAATATTTAACGAATAATCTTATTTAAATGATCGA
AGTGTTCGGGGGATAACTCGGAGCAATTTATGTAAACTCCGATACATAGATAAAAACTGA
AACCAAATGGTACATATTAATATAATATGAGCCATATTATGTGGCCATCTTGCCTTAAAA
AGTATAAATATGTTAGAAAATAATATACTATTTTATATTATATCATACTTTATAAAACAC
AGAGGAATATACTTTATACATTCAATTCATTAATATTTAAAATAATAATAGGATAAAATA
CAATTTAAAACTATATATTATCATATGTGAGTTAATTACACATATCAATCACATCACATA
ATATTTAAATGTAGGAAGAGTATGGTTTTTAAGTATGTATCCCTCGGGTTATTTTTTCAT
TTCACACTGTAATTGGGCGTTCCAGTCTAACACGTATTTTTTTATATAAAAACAAAAGGT
GATATATTATCCTCCCAAAAAAATTAGGAAGTACATATTGAATTCTAAAAAAATATTTTC
TGTCATACGTAAATATTTTCAAATTGTATTAAAAGCTATACATACGTCTGTAGTTTACGA
CTTGGACTCAAACTGATTGCAGTGATTATAAGTATTTAAGATGTACACATGGTAATCTGT
GACATAGTCACTTTTCACTGACGACAATAATCCGATGTTTTCCCTGTCCAACATCACGTT
ACTTATTTTTTTGATAGCTTTTATTTGTTCTTATGAACCGAATATTATGCCATGACAGTG
CCGTACTAAACAGTCCATTATTAGTGCATTTCATGAACAGTAATATTAAGCACAATTTAA
TATTGTTTTATTTATGTATCTATAATTATGTATATTTAAATAAGTACTACATGCACATAT
GAAGGGAATACATAATAAAAT
(4341 bp)

- SilkBase 1999-2023 -