SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp25699_c3_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_RNA-directed_DNA_polymerase_from_mobile_element_jockey-like_isoform_X2_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0003964 F RNA-directed DNA polymerase activity
GO:0006278 P RNA-dependent DNA biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
Transcript
Level
FPKM:0.47 TPM:0.44
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
GGAGTGGCGAAAAAACACAACATCAGAGGGTGTTTGATGGTTAGCACATGCGAACGATTT
TTCCTTTTAATTTTTAATTGTTTGTATTTTTGGTTATATTTTTTGCTGCCTATATCTATC
TGTGTTTGTTCTTCTTGTTGTAATTGTCAAATTTTGTGTGAAGCCATAAGGTAAGTTTTC
ATTTATTTAATCTCGCATAGTCAATGCGGGCCGATCATGGAGGTTGACGATCGACCCCCT
GGCCGTCCCCCAGATCCTAGTTTAACCTGGAACGATGAGGGACAACATCCTCAGGGTGAT
TTTACATACTCACCAGTCCTTACTGTACCATTAACTAGTTTCGAGTCGATTGAAGCACAT
CATCGTAAGCGAGCTCTCGAAACCAACAATGATAATGATCTTGCTTTGTCTACTTCCAAA
CAACAACGACCGTTAGCACCTAATAAGTATAGCCGCGAACGCTATTCTGCGAGGGATGTG
GCTCCATTTTTGGTCCATGTTACTCGTATAGAATCTGACCCGAAATCGGGAACTACCCTC
CACCCCATTAAGTTTGGACAGATGATGATCAAACTTAATATTAAAAATGTTCTTCCTGAT
GGAGTCAAAAAAATAGGTCGGAATAGGATTGCTGTCCAGTTTAAATCTCCAGAGGATGCA
AACTCATTTTTGGCCAACAAAGAATTGTTAGAAAATGGATACTCCTCATTAATCCCGACT
TATAATATCACTAGGATGGGTATTATTAAGGGTGTGCCTAATGACTGGTCAGAAGAAGAG
ATAGCTTTAAATATTAAGACACCATCTGGTTGTGGCGGAATACTGAAGGTGAGACGCATT
AATCACAAAGTTATTACTGATGGGGTACCAGAATGGAAACCTACTTCCTCTGTGGTTCTT
ACATTTGATGGTCAGACCCTCCCAAAACGTGTCTTTTGCTGCTTCAATTCCCTCCCTGTA
GATATATATTATTTCCCTACTGTACAATGCTTTGGATGCTGTAAATTCGGTCATACAAAA
ACTCAATGTCGCTCAAAGCCCCGCTGTTTCCGCTGTGGTGATGAACACTTTGGTGAGAAC
TGCACTAAAGAGGACCCAACTTGCTTTTATTGCTCTGGACCTCACTGTGCTAATAGCAAG
CAATGCCCTGAATACCAGAGACAAAAAAATATTAAAGTTGCTATGGCCCAGAACAACATC
TCATATGCAGAAGCATCCAAAACATTCCCTACTGTGTCAAAGTCCTTTGCTGATGTTTCA
GCATCAGTCCCTCCCACAACTCATATTATTCCTTCAGCCCCCTCGTCCTTACGTTTCCAT
CCTCAGACTTCCTCTTCCTCCTACAGAAAAACGATCCTCCAGAAGCCTAAAAGTCATGCC
CCTCACGTCCCGGGCTATGATCAAAGAACCCATAGAGCTATTACTAATTCCTACTCTTTT
TCTCCCTCTACTAATGGCTGCGCTCTCAGTAAAAATTCTTCTCCTTCTGAAGATATTCCC
TCTAGTGAAATCTTCTCTCTAATTAAACTACTAGCTTCTCTTTTAACTAAAATTAACCTA
CCTGACCACGTTGCCAATGACATAATTGACAGTATTTTTTCCCACCATAATGGATCTAAA
TCTCTTGCAGTGGAATGCCAGGAGCGCCCTCCCAAAAAAACATGACTTTCTCCATTTAAT
CAATTTATATAATCCCGCAATCTTTGCAATTTCTGAGACGTGGCTCTTGCCACATCTCCC
ATTTCACATCCCAGGTTATAGCACCTACCGTGATGATCGTGATGACGGGTATGGTGGTGC
TGCTATACTGGTCAACAATGTCTTCCCTTCTTCTTCTCTTTCTCTTCCTCCTCATGGAGC
CGAGATTAATGCCATTGGTGTTAACATCATTGGTATTAATTTTATCTCCATTTATTTCCC
TCCTTCTGTCCCTATATGTATTCCTTTCCTAAGAAATTTATGTATTTTATTGAACCCAAT
TATTCTTATGGGAGATTTTAATTGTCATCACTTCTTGTGGGGATCTGACCATTGTGACGC
TTCAGGTACATATTTGGCAGAGCTAATAGATGAAATAGGGTTATACGTCCTTAACGATGG
ATCAGCCACTAGACTCCCTAGACCGGGTCAAAGCAGAAGTTGTGTGGACCTAACACTGTG
TTCATCCACTCTAGTAAATTCCCTAGACTGGAAACGTCTTAATTTAACATACGGTAGTGA
TCATTACCCTATTTGTTCTACCTTTTCCAATAGGTCTCTCCCCAGCAAAAATAGAACTCC
CTTATTGCAGTATCGCATTACTGACGCCAGGTGGGACATTTACCAACAGAATCTAGATAA
AAGAATCCTTTCCTTTCCCCAAATCTCTTTTGACAATTTGGATGCTTGTTTGAGTTTGTA
TTCAGATTCCATTTCAGCTGCTGCAGATCTGAGTATTCCCTTGAAAAATTCATCTTTGGG
AAAATTATCTTCTCCTCCCTGGTGGGACAGAGAATGCACAGACCTTATTAAATCCCGGAA
AGAAGCTGAATTTAATTACATCAAGAATATGACCCTCTCCAACCTTCGGGAATTTAACAG
AATAGTGGCTAAATCCAAGCGCACATTCAAGAAAAAAAAGTATGAGAGTTGGAAAAAATT
TTGTTCCTCTCTTTCACCTTCATCCCCGTCTTCCCTAGTCTGGCAAAATTATAAAAAATT
TAGACGCGGATGCTTCCCTCAAAATTCTCCCAATATCTCACGGAGCATCGCCCTACAATT
CATTAACAGATTGGCTCCTGCCTATGCTCCTCTTGTTGATGAATGTCCCTCATTGGCAAT
TAATATGCTCGCTGTTGATCCTTTAGACGAACCTTTCTCCATAAATGAGCTAAATTCTGT
ACTTAAATATGTCCAGGACTCATCTCCTGGCTTAGATGGCTTTCCCTACTCGTTTTACAA
AATGTCTGGTCAACATAGTCGTCAGTTCCTTCTAAATTTAATAAATACATGTTTTAATTT
TGGTTATATCCCTGACGCTTGGAAATCTCAATTAATCATCCCTATTCTGAAGCCAGGCAA
ATCTCCTGATAATCCTGATCACTACCGTCCTATTGCACTCTCCCCTGTAATTGGTAAGAT
CCTTGAACATTTAATTAAAAATAGGTTGGAGTGGTATGTGGAAAGTAAGGGAATGATAGC
AGACTCTCAGTTTGGATTCCGAAAGGGGTTCAGTACCTTAGATAGCATCGGCACCTTTAT
TTCTGATACGCGAATTGCCTTCAGTGAAAACCGGTCGGTTGTGGCCTGTTTCCTAGACAT
TTCATCTGCATACGACAATGTTCTTCTTTCCGTGCTCAGAAGTAAATTACGTGAGCTGAG
TGTTCCGGTAAAGATACAACGTTGCATATGTAATTTTCTGGCAGGCCGTACTGTTAGCGT
ACACATCCCTGGTGATCTTGTCCACACATCCAGGCTGCTCTGGAGGGGTCTCCCCCAGGG
TTCGGTGTTGAGTCCCTTGCTGTACAACATTTATACATCTGATTTGCATAGGTCACTCAA
CATCGGATGCCATATTTTACAATATGCAGATGACCTGTGCATATATACAGCTGTCCCATC
CATAGTTGACGCTGGCATATCCATGCAAATATCCCTCAATTCTCTGAATCATTGGCTTTC
TGCTCATGGACTCCAATTGTCAGCCTCTAAGAGCTCTGTTGTGGTTTTCTCTCGTAAACG
AGTTATACCAGATGTGCATCTAGAAATTGAAGGATCTCCCATCAAGGTCGAAGATAATGT
GAAATTTCTCGGCGTCGTCTTGGACTCTAGACTATCCGGTATCGCACATTTTAATTACAC
AATTAGTAAATGTGAGAGAAATATTAATATGTTGCGGGCTCTTGCGGGTGTTTGGTGGGG
TGCCCATCCTATCACATTAAAACTCATTTATAATGCTACAATAAGAAGTTTATTGGATTA
TGGCTCTTTCTTATTAGACCCTTGCAACAAAACAGCATTAGCAAAATTGGATGCCATTCA
ATCAAAGTCTCTCCGCATTATATTGGGTTGTATGAAGTCCAGCCCAAGCAATGCCCTGCA
GGTGGAGAGTGCCGACCCACCTCTTATCCTTCGCAGGCAGTATCTTGCAGATAGGTTTAT
AATTAAAGCATACTTCCATAAAAA
(4164 bp)

- SilkBase 1999-2023 -