SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp25674_c2_seq23
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_homeobox_protein_Hox-A1-like_[Papilio_xuthus]
Ontology
GO:0003677 F DNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007275 P multicellular organism development
GO:0043565 F sequence-specific DNA binding
Transcript
Level
FPKM:31.20 TPM:28.89
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
TTTTTTTTTTTTTTGAAAATAGATAAAATTAATTTAATGCCATTCATCCGCTCGCACGCG
CCCACAGAGGACGTCGCGCTAAGACAACTATTTACATCGCATCGATAATACCTTCGATTT
CGTATTACATAAAGGACAAAAGGACTAGCTTTGTTTTTGAAAACAATAAAAATACACGAC
TTACATTCATTACAAATGATACAAGATATAATACGTTTTCGGGCCGAGCATTAGAAAGGG
TTGCTTAATTTAAAGTTTAGCGTCTGTCTCGGCAGTCAAGGAATCGTGAACAGTGAATTA
ATTTGCTAACAGTTTCTGATGACTCTCAGCAGTCCCGGATGGGAAGTGTCGTGAGCCCAA
CTATGACAGTAAAAGACTTGGGACCACACCACAGAGCTACAGCAATGTACACCCACGAGA
ACATATTTCTTTAATTTAGCTTAAGATTTTTTTTTATTCTTTGTTAGAGCCATACACGCT
TAAGAAAATTCATAGGTAAAGTTATACGTTTCTCGCCAACAGCCCTAAGTGTTCGTTTTC
ACTACTTTACTTTCTCTGATGGAATATATGAAAGGTTTAAATATGTAAGTATTTAAAATC
AGGAATGTACTTTCATGATTTTAGTTGCAAAAAATATCTGTTTCATTTTGTATACTGTTT
TGTGCGTTACAGAAAATATTACTGATAATAGAGCTGTAGTAACAGTATTCAAAATAGCAG
TAAAATTACAGTGATTACTTGGAGTAAGTGCGAAGAAACATCTATATCTGATTCTCATCC
GCATTTCAGTGATTGATTTGAAAGATGTCCAAGCGGTTTCACACAGATTTTAAGAGATTT
TATTTAATAAAACAATATCAAACTTTAGTTAAAAATACTGAAATCAGTTTCAGTTGTTTT
TTTAAACTTAATGCTAATTTTAAACAAGTATTATTGGGTACTTTTCAAAGGCAGCCTCTG
GTTTTTCCTGGGAGGGCCCACTTATGTCGACCGCTCGTCTCCGTGCTACTTCCTGACCAT
TCCCGAACAAATCAGAACCCATAATCCATAAAATAAGCAATAAAATGTATTTTTAAAATA
TGTGATCGGATTATTTTACGTTTTATTTAATTTTCATTTTCAAAATATACAAAACGAGAT
TCGTGATGGTTGCGTTTTTTTTTTAGTTTCTGATCTGTTCTTTACAATGACACCGCTTAT
AAACGATTAATAATGCTATTAAATCGATTTGCAGAGTAGAAGATGCTCCGTCGTAACTCC
CAAACTACGTATCTTATTTAGCAATTGTCGCTGTACTAACCCAATTCGGACTCTTCGCAT
CTCATACATTTCATTAAGTTCCTGAACCAAAGCTGTATAGTTTTGATCTGGTCATTTGAG
CCAATAATGGTATTCTTTTGTTTTCAACTCGTAATGATCATTAGAAGAAAGTCTTACATA
AATAAAAATAGCCATAACATATATTATATATTTTTTAATGAGTTCTTACCACTTAGGTAC
TCAACAGCGCTGAAATATCAGAATATTTTACAAAATGAAACTCGTGGTATGGATCCGTTA
AACAATCTTATGTAAAATATAGGTATTTGTAAAAGTTTAAAACAATTCGTAACAATATGT
CCAGTCCTCCGTGACCACGAAAACCGTAAAGTTAAATTATCTTTTAATCGTACATGAAAG
ATATTGAACTCTTGTCCTTTTAAATAAATTTTGGCGAAATCTACAACGGATGTATTTCGA
ATCGAAAATAGACTTTGGTATAGTGATGATCTTAAAAAAATAAATAGAAAAAAATATATG
AAATTTAACTTATTTACTACTTTTTCTACAAAACTTTGCTTACAGTTAAAGAAATCTTAA
ACAAAACTGGCCAGTAAGGCATTGTCGTTTTTTTAAATAATTTATTCAAGACTAACTTGC
TATTAGTTATATTATAGCAGTTACCAAGTTAGATTATGAAATTGAAAATACTATTATGCT
AGAAGTAAGTAAAGAGTATTATTTCTTATGTTGTTAGATACCTACCGAAATATGTACTGG
TATTATCAGAAGTTTCTTTAAAACATACAACTTAATCTTTGTTGATGTTCGATTGTTTTA
GATAAGAAAATATTACATGAATAGTGTGGCATTGTTTAAATAACATAATTCAATTTTCGA
TAAAATTATTACAAAATTTTGTCTTCAATCCTACTAATATTATAAACGCGAAAGTATGTA
AGAATGTATGGATGTTTGTTACTCTTTCACGCAAAAACCACTAAATGAATTTTGATGAAA
CTTTACAATAATATGGCTTACACGTCTCAATAAAACATAGGCTATAATTTATAAAGATAT
AGTGTGAATCGCCCAAAATAGAACGATAGGTGTCAAGTAAGTAGAAAAAAAAATCTGCGA
TTTTATATTCATAATCGATAATAAATTACAGTTCTCCAAGGGGAAGCGAGGGCGGGTCGC
TAGTATTAAATAAAAGATTAACACGTCCTGATTATCATCTTCAGCCCACGGACGTCCACC
GCCTTAATATAGCCCCCTAAATGTTCGTCATAAGGACAGATCCTGTACTATCTTCCTCCA
GCGGATTCGCGAGACCTTCAACATGTAGCCCACAGATCATAGAAACACAGGAGATTAGTT
TTGGACACAAATTTATTCGTGTTCAGATGTCTCCGCGCACAGATCATAGAAACACATGTA
GCCGGTCCATCTTTTGGGAGGCCTACCCACTCTGCGTCTTCCGGTATGCTGTCACCCGTC
GAAAACTTTTCAACCTCCCCAATTCTTTGGGCTATGCCTTCTATTTGGGTTCTCCTGCGA
AACTCCTCGTTCCTGATACGAGGGCAACTCCGAGCATAGCTCTCTTCTTAAATTTTGAGA
CCCTGCAGATGATGATGAGGATATTCTGTGCATCTTCCCGAGCGTTGCTCATCTGAGTTG
AATCGGACGATTGATCCTTGAATCGGACGATTGATCCCTTCTCGAAGTTGGACCCACCTG
GCTGGACAATTTACTCTGGATAAACTTACTCGTCAATAACTCCGAGTGTCTACCTAGTCC
ATGATCTTTGTTGAGATGGACATTACATGAAATAATAAAATCGTTTAAGGTTTTATAAGT
CGTTAATAAGAATTAATAATTTAATTTGTTTGACGATTTTCCACATATCACGCTTATGGA
TCACCGGTTAAAAAATAGTTAAAAATTATCCAGAACGGTTACATAACATATTTATTCAAG
AATTCTATAACTAGGGCCTCCGAGACGGAAAACTAAGTATTTGCATCAAACACGCATTTT
ATGGTTTCAGTAAATATGATTGTCGAACGATAGTGGACATTGGCTTGACCTAGAGATGGA
AAAAATGATCATTCATTTTTCATTAGGTCGAATTTAGTAATTATTAGGTCTAACGATCTT
AATGATAATAGTACATTCGGCTATTAGTCAGAAGATACGGGAATGCGGCTCATAGCTTCT
CAACTCACTGCTACGTCTGTCATATATTTCGGTCGTAGTAATTCGGTTTTCTAAGGGTAC
CGTCGTTCTATTTCTGTGTCAATTGAAATATTACCAATGCTGTTAAGACTAGTCTTATGT
CATAAACTGGATAACGGCATTCACGAGAACACAGCATAGGGTAAACATTTTAGGGTAAAT
TAATCCGATGAGTTTGAAAACCTCTTTATCAAAGGAACACATAAGGTATTTAGGTAATAG
TTTGATTATCTCGGAGCCCTTTACAAATTGAATATGACAAATTAATGAAACTAACAATTC
TTAATGTTTTATACATTAAAATTAGCGGACTAAGTTATGCAGAAAAGTGTGTTTTTAACA
AAATCGCATCACGCATCTCTTTCAATGCAACGCAAATCCTTACATTAGATTTTTTATAAA
ATTGAAAATAAACCTTAGTAGTTCAAGAATCTATAAATGTTTTTTTTAATTATTGTAATA
AAAGCATAAAAACCTATGTAGATTCTTTCGCTTGATCTGTAAGATTAATGTACATTGAGT
ATTAAATGTGTGACTAATCAAATCACATTTTGACGTATCCTACTGGCTTAGTTGCATGTT
ATAAAACATTAGCTGAATCTTTTCTGCATAACAGGGTCTATTGATTGGTATTGGAAACGC
TCAGATGGATTATAAGTTTTTTTTTAATATAGTAAAAACCTAACAACATTTTTAATAATC
ACGCAATATAATTTTTTTGACTTTATTATTGTAGACGGAAAGAGGAGTTCTGTGGCCGCA
TGCCTGATGGCACTCTTCTTGGCAATGTTAAAGTCAATGCTAATCCGGTTGTAGGACAGA
ATACTGCTTTATGTTCGAGAAGCAGCTTGCTTTTTGCTGCACTTAACTAATAGCTTATTC
ACCCCCTTCTTATCCGTCACGCATAATCTCTTTACGGGGAAATACATACATAATTTACAA
CGCTACATAACTAAAGTTTGTACACGATTAACTCTCGCATCTGAAATTTCTCCGAGAGTG
CAATAACGATAGTTGATTTTAATAAAATAAATACACAATAGGTACATTTATCTAGCGCAT
TTTTCGTTCAAAGTTAAACTTAAACTTACAAAAACGACTACGAAACATTAAAACTAAAAT
GACACCGGCTCGGCTCACTGTTGTTGAATGACTATCGCATGAACATGAACAAGCTGTACG
TCCTCACTCATAAAAAACAATGTTTTATTATAATTTAATTCAATCGTCTGTATAGATGCG
ATTTCGGACCACAATACACTTAACTGGACTCCCGGCTGTTTTCATTAGATCCCACAATTG
TTTGGGTTGACGTGGTCGGGGTGGCCTCGGGCGCTACTATCAGCCCCTCCTTGATTCGCT
TCTTCTGCTTCATCCTTCTGTTCTGAAACCATATTTTAACTTGCGTCTCGTTGAGCTGTA
ACGCTGAGGCTATTTCTATCCTCCTCGCCCTGGTCAAGTATTTGTTGAAGTGGAATTCTT
TTTCCAATTCCGTGAGCTGTTTGTTGGTGAAGTTAGTCCGTCCGGTGTTGTTCAGGTTGA
GTAAGGGATTGGCCATCATTTGGGGGCCCGTTGGTGTACGCATTCCGTCTTGTGGACTGC
CCAGGACGCCTTGACTGACGAATTCTGCTGGTGGTATCATCAGCTTCGGCGCGGTTGGTT
TGGGTACGTTTCTCTTGACTTGCATCCATTTGTAGGTCGGCACAGTGGCGTGAGAGGGGT
GGGATTGGTGACCGCTCGGGATAAGGTGCGACATCGTCTCTCCTTCACGAGGGAACCCCT
CCCTCAGTCCTCCGTACTCCTCTTTGGGCTGGTAGTGCTCAAACTCCGCGCAGGAGAGCG
GGGACCCGGAGTGGTTGTACTGCATGGAGGACTCATCAACGAAATGCATATTATATTTCG
TCTCCAAGTAGTGGTTGTCGAGCTTGTGCTCGTGTAAGTGCATCTCCTCCGGTCTCGGGA
CCTCATCCCGGTGCTTGAACGGCTCAATCGGATGCTGCGGTAAGGCGTGTAAAGGGTAAT
TTGGCTGCAGGTCACCGTAATCCAAATTCGTGTAACACAGTCCCGTGTCTGTGCTTATGA
CCGGCGCGGGGGGGTGGTCGTGGGCCGGCTGCCCGGGCAGTAAAGGCTCGTAGTAGTGCG
TCGTCGGCTCGTAGTATCCCTCGTGGTAGCCCTCGTAAGGCGGCTGGTACCCGGTCCCCT
GCTGATAGTACTCGGCGCCTCCGTACCCGTTCTGTTGGTTGTTGTACATCCCGACGTCCA
TAGTCATCATGTTTGTCACGATCACCGCGTCTATCGATAGCGACAATACGTTTACATCGC
GCACATCACTACGTCCCGGATGTAGGTGCGTTTGGTTGCGGAGCGGGCTAGCTCAGCGGC
GCGGGTTATCGATTGCACGCCCGCACGTCAGCCGCACCGACGAACACTGGCCGCGGCGGG
CAGCACGGCATATTTTTTTTCTTAACGACAC
(5971 bp)

- SilkBase 1999-2023 -