SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp25489_c1_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_TAR_DNA-binding_protein_43-like_isoform_X1_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0003676 F nucleic acid binding
GO:0003677 F DNA binding
GO:0003723 F RNA binding
GO:0005634 C nucleus
GO:0006351 P transcription, DNA-templated
GO:0006355 P regulation of transcription, DNA-templated
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008380 P RNA splicing
Transcript
Level
FPKM:4.58 TPM:4.24
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
AACATATGTTTTCAACCTGCAAATTGCAATGGGTTCGTAACCCGTAGGTGACGTTTAATT
AAATTTTATTTATTTTAGATGAAGTTAAATTATACAATTTTCTAGTAATAAGTATAGTTA
TTGTGTTAATTTTCATCAGTTTTTAACTATATTGTTCATGAAGAATAAATAATGTCTTTC
GAATATTTGCCCGTTGCTGAAGACGAAAATGAAGAACCCATAGAACTGCCTATCGAAGAA
GATGGAGCTTTGATGCTATCGACTGTGTCTGCACAGTTTCCAGGTTGCTGCGGATTGAAA
TATCGACACCCTGAAACGAAAACCATCAGGGGAATTCGACTAAGAGATGGTCGACTATAT
CCTCCTCCAGAAGGATGGGGAAATTATTTGTATATATGTAGTTTTCCTAAAGAAAATAAA
CGCAAACCTGGTGAAAATTCCGAGTCCACAATTATGAGACATAAAAGAAATGACACCTTA
TGTTCGGACCTGATAGTTTTGGGACTCCCTTGGAAAGCCACAGAGCAGACAGTGCGAGAA
TATTTTGAAAAATTTGGTGAAGTATTAATGGCTCAGCTGAAAAGAGACCCAAAAACGGGA
ATGTCTAAAGGTTTTGCTTTTATTCGATTTGCATCTTATACATCCCAAATGAGAGTTCTT
GCTCAAAGGCACATGATTGATGGGAGGTGGTGTGATGTAAGGATACCAAATTCCAAAGAA
GGATCTATACCGTCTATGCCTTGTAAAGTTTTTGTTGGCCGCTGTACTGAAGAATTATCT
GCCAATGACTTGAGAGAGTATTTTTCTCAATTTGGAGAAGTTACTGATGTGTTCATCCCA
AAACCATTCAGGGCATTCAGTTTTATAACATTTCTTGACCCAGAAGTTGCGCAGAGTCTA
TGTGGACAAGACCATATAATAAAAGGTGTTTCTGTTAATGTTTCGAATGCATCTCCAAAG
CAAAACAAAAGTGGTACAAACCAACGTGCCATGCCTAGTAGAAGTTATGATGAAGGTCAT
CCACACAATGTGTCTAATAATAATTCTTGGAGCAACCGAAACATGGATATGGTTAATATG
CAAGCACTTGGTATGTCTGGTCAACATGGACAAACAGCTGTAGCTGGTGGTGGAGGACAA
GCACAAGGTGGCAGTATGCCTATAGGAATGGGAGGACTACCTGTAAATCAAGCTTTAGTA
GCAGCAGCTCTTAACCAGGCAGCTGGATGGGGTCTTATCAACAACATCCCTTCAGGTGCA
TCAGAACAAGGTGCCTTTGCTGGTCCAGCATCATCGGCACCTCCAGCACCACCAAACTTC
CTGTCTTGGATGCAACAAGGTAATTCAGCACAAGGACCCTCTAGTCAGTGGGGACAAAGA
CATCAGTCCCAAGGCCACTCTGTCTGATCAATATTTCGACAAGCTCACAATAATCTCTGT
GATTGTAGCAACATTTTTTAGATAAATAGTACTTGTTTTTATCTTCAGTAAAAGATGGGT
TGTTGTTGGTGGCAAGTGGTTAACCTAAAAATTTGCTAATGATGTTATTTATTTATGGAA
TTGCTTGTTTTCAATTTTGTTCTTATGAATTTTATCCTAGATAGATAAAATTATGCACCA
TAACAAAACATAACACTTTACAAGCAGTTTCTGTATAAAAATTATGTAATACTTGTATCA
TATGTTTTAGATTAAGATTGTTGTTGTGCTTTTATTTGTCATTTCATATTACTACTTAAA
AATACTAATAAATATCGACATAACTAATTAGAGCTGAGATGTAATCAACAGATTCCTCAA
CTTTGAGGTAGATTTTTGTAATTTTTACATTGTCATGTTTAGGGCCGTCCGTCCATAAAT
GAGATAATGGTAGGTAAAGTAATATAACCATCTAAGTACAAAATTAACAGTAACTTCCCT
TAAATAAATCTAAGAACAGAATTTACATTAAAATTATATTTTGAAAAATATTCACATCTT
TATGACTATACAATTACAATTTAATTTAAAACACGGCAATTCTGTTCTCTATGACAAATA
ATATTTATCAGCAAGTTTGGATTTGTTTGAATTCATTCTTACATTGTACACTAATAGTAC
CATAGATGTACAGATAATATCATAATTACAATGTAACTTGCAATCACTAATCTGAAATCT
CATACCATTTGTAAGAGCTAGCTAGACCTTACATTAGGAAATACAAATGGATATGAAAAA
GTTACTGCAAAATTACCTAAATCCTTATATAATTTATAAAAAAAAATTGCTGATTACAAA
CAAGTCCTATTTTAGAAAATGCAGGTGTTACTTTTATCTCTATCCCCTATTTTCAAGGAC
AATAACAAGAACTCAAACTGTTACATAATTATAATATATAAAAGCCTATAAAAATGTTGA
AATTGAATAAATGTCTATTTTTAAATCTATTTGATGCTGATCATACTTAAGAACAGTCAC
AATCGAGATGAAAATATGTTAAAATGTGGACTATAAAATTTCGTTAAAATTAGCATTCAA
TTTATATGTACAATGATATAAAATATACACACTTTGGCAAAAAAAAATGTATATAGGATA
GATAGTACTATGATAAATGTTATTTTGAAATTAGCGATATATGTATATCATATCACATAT
TGTGCTACAGTCAATTTAATCCAACAATTTGCCTTATTACAAAAATAGATACTCTGTTTG
AAAGTTTATTAGATAGTATACAAGTGTTGTTATATTGAAAAATACATTTAAAAAAATAGT
ATACTCATTCATTTTAAAAATATAAAGCTAAATAAGATAAAAATCTGTGCCTCGTAACCA
ACA
(2823 bp)

- SilkBase 1999-2023 -