SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp25105_c0_seq1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_myc_box-dependent-interacting_protein_1_isoform_X1_[Plutella_xylostella]
Ontology
GO:0005086 F guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005515 F protein binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005802 C trans-Golgi network
GO:0005856 C cytoskeleton
GO:0008022 F protein C-terminus binding
GO:0016020 C membrane
GO:0030054 C cell junction
GO:0030672 C synaptic vesicle membrane
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0032403 F protein-containing complex binding
GO:0043195 C terminal bouton
GO:0043547 P positive regulation of GTPase activity
GO:0043679 C axon terminus
GO:0045202 C synapse
GO:0045807 P positive regulation of endocytosis
GO:0046982 F protein heterodimerization activity
Transcript
Level
FPKM:7.23 TPM:6.69
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
TTCACGAGTGCCGAAAACGGCGAAAGCACGCATTTGGAATTTGACGTGTGACAGCAACCA
GCTGTACTGTAACCAAATTCGGTTGCAGATTGATGGTGTATCGTGATTTAGACATTTGGT
AATGAAAAAGTGATTGAAATGGCTGAAAGTAAAGGTGCGTTAATCGCGAAAACAGTGCAA
AAACATGCAGGACGAGCTAAGGAAAAGCTCCTGCAGAACCTGGGCAAGGTCGACAGGACT
CTCGATGACATATTCGAAGAGCACCTACAGAATTTCAACCGACAGCACCAGCAGTCAACC
AGGTTGCAGAAGGAGTTCAACAATTACATAAGATGTATACGAGCGGCGCAGACAGCTTCG
AAGTCGCTGATGGAAGCGATCACGGAGGTTTACGAGAGCGGCTGGTCAGGTCACGACCTG
CTGTACGTCCAAGCTCAGAACATGGAGGTCCTTTGGCAGGACTTCTCGCACAAACTCGGC
GACCAAGTACTAATACCGCTCAACACGTATACGAACCAGTTCCCCGAAGTCAGGAAAAAA
ATCGAGAAACGTGGTCGTAAACTCGTGGACTACGACAGTCAAAGGCACAGCTTCCAGAAC
TTACAGGCGAATGCCGCTAAAAGAAGGGACGACGTAAAGGTGACGAAGGGACGCGAACAG
CTCGAAGAGGCCAAACGCACCTACGAAATATTGAACTCCGAACTGCACGACGAGCTGCCT
GCGCTGTACGATTCCCGGGTATTGTTCTACGTCAACAACTTGCAAACACTCTTCTCCGCC
GAGCAGGTCTTCCATTTCGAAAGCTCCAAGGTGTTCGCCGAACTAGAAGCGGTAACGGAC
AAGCTAGCGAATGACTGTCAGCGCGGCTCGTACACGAAGAAGGCGAACAACGTGTCCCCT
CCCCCGCTGCCCGCGCTCCCCGCCGCCCCCGCGCACAACGGGAACGCCGCGCACACCAAC
ACCGTGCAGACGCCCCCCTCCCCCGCGCTCAACGGCGACTCCCCCACGCTCTCCGGGAAT
AAAGAGCCGGCTCCGGTCAAAGAGACCGCACCGGACCCCAAAGACCTCGAAACGCCCATC
AAAGAACCAGCTCCGGTCGCCAAAGAACCCGTATCGGTTGCCGAAGAACCGACGCCGATC
AACAGCGAAACCGTTAAACCCGAGACTCCGCCCCCCACAATCGAAACGACCAATAGCAGC
GAGCCCGCGACGGACAACAAAGTCGAACAGCTCTACGACATACCTGTCGGACCTACTACA
GTCGTCGAGAAAATGAATAATAACGAAGAAACAAATAAACATACAAATGTCGAACAGAAT
TTAATCGAGAAGAACGAAAAGCGAAACAGTGAGAACGCCGAAGAGGTATACGACATACCA
GTCGGAGCGACGCTAGCCGGCCTGCCGCCCGGCGTGCTGTACCGCGTGCGGGCCACATAC
CGGTACACGCGCGAGGATTCGGACGAGCTCTCGTTCGAAGTCGGCGACATCATACGCGTC
GTCGAATACGACGATCCAGATGAGCAGGAAGAGGGCTGGCTGATGGGCATCAAAGAAACG
ACCAATGAAAAAGGAATGTTCCCGGCGAACTTCACGCGGCCGATCTGAAGCTAACACGAG
CGAACGCGCTTCGCTTCGTCAAGCCAGTGGACAGTAGGCTTTATCGATCGAACTGTAGCT
GTATGAAAATTTTGTAAATTTGAAATACCAATTCCTTGGTCCCAATCGTAAAGGTGACTG
AAGACCTCCACATTAACAATGCACAATGAGATTTAATTGACTAATGATTGATAAAGCTTT
ATTGTCCTTTCAAAGTTCGGTACGTCATTTTTGTATGTATGTATGTATGTATGATTAACT
CGGTCTGTTGTTTGCAATGAAAGTATGAATGTCTCCACTGAAATTATTTAGTAAATTGAA
ACGCATTCAAGGCGACGCGTTTAGTCTTAATTCAATTTGATAATTAATTAACCAACAGCA
AAGATTGTGTTTTTTGATAAATTAAAAAGCAAAAAACGTTTTTTTTTTTTCAATTCTTAA
CATTTCACATGTGTCGTATGAATAGTTATGATTTTGATTTTATTGTCATCTATATTATCA
GCAATCATAATGTGTTTATTTATATATTACATCTATTAAATTAATTCAAATAAAAATCGT
GTTAACCTAGTTTAGTTTGTTGAATGTTTATGAACAACATGTATATTTAATTATGAATAA
TATGATTATTTTGTTTGAGATCATAAAGAAACATTAAAGCATTTTATTTAAAAAAAAAAC
TTAAATCGAATAGCGCTTTTGACTAAGATTTCCTAAACGGTCAGCCATTATTGTGAATAA
AGATTGTTCGCCAGGTTATACTAAATGTGTAATATAGTTATTTTTTAAATATCATGTTAC
TTAGATTTCACACGAAGGTCTTTCTTCATATAGAAAACATTTTTGATTAATAAATTGTCA
TTAATGACAGGTGTCAAAGGTGTTACTGTAAAAATATTCTAAATAATATAATATTATAAT
ATAATAATTTGCTCATTAGAAAGTGACCTTATAATTAATGTTTAAATTGGAGTAATCAAA
ATAATAAAAAGAATAGCGTTGAGATTTATAAAAAACGAAAGTTTTAATATTTATTTATTT
CAGTATTAATAAAAAAATTATACTTTAAAGATGTCATGTTTTCTAACGATTTTTTGTTAT
TAATATAATTTCACTTCGATTGAATTTATTTCACAATTTTTTGTAATGGTAATAAATATT
ACAACTGAAAAGAAACAGTTCTCTGTGCTGGGATTGAAAACAAAACACTTCTATATTTCC
ATCACGTCCGTGCATTTCGTTTTGTATGCATTTCGAAAAAAAAAACATTTTTCTATATTC
CCTATTCGCGAGTCTATACAGTCTTTAACGAATACAGATGATCTAAATCAATATACTAAA
AGATAGATATTGTAAAATTTAACTATAAAACAAAACTTGCTACGGGATATTATGAACGGA
ACCCGTATTAATTAATCTGATAGAAAATTTCAATTAATGTCAAGGTTTTGACTGAATCTT
CAAAATATAATGTACCGTAGTTTAGACTCAAGCTAAAAAAAACAATAATTTCTTGTAAAC
GTTTTTATCCATTGACTTTTTTCATCGTTTATCGCTAATCAAAATAATTCACATGATTTA
TGGTAGGTACTCGTAGGAGCATACTTTGTTTTCACTAGATTTACCGTATTCTCTGTTATA
ACTGTTTAGTGAATTGAATACTAACCATTGTTATTTTAATGTTATTATGCTTTTAATTGA
TAATCATATATGTATAGGTGGTTTGGAACTCAAACGTGCATAAGTTTCAATAATGAAATG
TTGAGTTCCACAGCACCTATCACGTATGATTGGTTGTTTGTACCCAGAACAAAAACTGAT
ATTAGAACGCCAGTGTAAAACGAGGTGCTTTAAAAATGTACATATAATATACTCCCCTGT
GTATGTACATTAATAGAATAAGGATTGATTGATTTGTAATGTGTTCCAATTTTAATTATT
TTTTACATTAAAATGTTATGTTTTTTTTTTCCTGGTAACATTTTTCGTAATCTTTCTTAA
TTCAAAAAATTTATTAGTTAATTATTTAATATAACGAACGTATATCTTCCTCCATGTATA
CATAATATGTTAATGCCAAAACTGTATTGTATAGATGTGGCCTTATTTATGGCGATTGTC
AATGTTGTTGTAAATGACTGAGGAATTTTTGAAATTTGGAATTTTTACGTATAGATACAT
TTATATTGTTGTGGCGAGATTGTCAGCAGTGCCATGCGAGGTCCATAATTTTTAATATAA
CTTATAGTTTTGTTAGGACTTGTACAGTTTTACAACTGCAAATAAAATATT
(3891 bp)

- SilkBase 1999-2023 -