| Name | A_BomaMG_comp24920_c0_seq1 |
| Scaffold_id | |
NCBI non-redundant
(nr) | PREDICTED:_CBP80/20-dependent_translation_initiation_factor_isoform_X2_[Bombyx_mori] |
| Ontology |
| GO:0000184 |
P |
nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay |
| GO:0003674 |
F |
molecular_function |
| GO:0003723 |
F |
RNA binding |
| GO:0005737 |
C |
cytoplasm |
| GO:0006417 |
P |
regulation of translation |
| GO:0006446 |
P |
regulation of translational initiation |
| GO:0048471 |
C |
perinuclear region of cytoplasm |
|
Transcript
Level | FPKM:3.42 TPM:3.16 |
| ORF Entry | |
Sequence
(Nucleotide) | AACCGCCCGGGCGGGCGCCACACGACCGGAATCTGCGCGAGCGACGAGCGGTGCCAACGA
ATATAAATTTCAGTGAAATAAAACACGCATCCGCGTACCGCTGTAACGTAAAATGCGAGC
GCAAGATTCTGTGAATCAAATACGAGAAAAGTGAACGAGCCTCGAGTGCAGAGTACGACG
CCACACGTCGCACTACGAGAGAGCGATTAGGGTTTATATAACTCCAACGACGAAAACGAT
TCGAGCTTCGTGCTGCAGAAACTCTCAGCCCCTCGAAATATTGTATAGAATCGCTCGGTG
ACTGCCAGGCATTGACACATCACTGCACTGCTCTTGTATGATAAACGTCTTAGAAATAAA
AGATTTAAAAAAAAAAACGAAAAAAATAATATAATACGAACTAACGCCCTCTCGGTGGCC
ACGAAGAGGGATATTTATTATACTTTATTATTATTATTATTATATATGCATATATAAATC
GGAGAAAAGTGATCTCTAAAGTGACGTCACAATATTAATCTAATTGTGATCTTGTTAATT
AGTTAGCCGTGTCGCATTTCGTATTGCCCGTATTTATTGTAGTTAATATTCTTTTATTAC
GTTGTAAATATCAACAATATTTATATGTTACATGTGACATCGCGTTATACTATAATACTA
GTCATCGATCTAGTGTGTGTTTATTGTAAAATCAGAATTTAATTGTTACTAAAAAATATA
TTTACGAAACATCAGTCGAGTGCACTGAAGGCAAGAAGGGAATTCGTGTTTGAGAGCAAG
TTACGTAACTGTCAAGATGCAGACTCAATTAGGATCAGGCAATGATCTGCAGAGGAGCTA
CAGGATCCAGGACTTCGCCACGCCTGGCGTCATCATGAGGGAGCGGAGCTTCGTACGCCC
CCAGTCGCATCACAACATGCATCATCACCAGTTTTCAAATAATGGGAAACGACGGAGTAT
GATCCTCACCAACGCAAAGGGAAAACCGACTCTAGAAATCTACAGGCCACCAGGTGTCCG
CACAGACGGCGTGGTGTCAACGAACGCTGGTGCCGCCTGTACGACCACCACGGCTGCCGG
CAGTGGTGCTGCGGCCACCAACAAGCTGAATGTGCACGCAAAGGAGTTCACAATGGCGAA
ACCGATTGACCTACACAATAGAGGGGCATTGGGCGTGGGGTACGCTAGTGTGGGACTTCA
GCACTCCAGGTCGGCGGTGCTGCACGCGCAGGTGCCGCCCCACTACCGACCCGTGATGCC
GCCTCACGCGCTCCTCAATAGCGCCTCCAGCGGGAACGTGCCACATGCACAGGGGCCACG
CGTGCACTTCAAGCTGCAACCACAGACTATCATTCCTGAGAAGAAGAAATCTCCTCCGTC
GTCGCTGACGAATGGTAATGGGAAGAGCATCCGTCCACAATCATTTACACCAGGATTGAA
AAGGTCAAAGTCCTTAACGTCAGCGGATGCACTCGCAAGTGGCATGGCGGCCCTGGGTCT
GGCAGCCGACGCCGGCGACCTTGGTACATTCCCGCCGGAGATTCAAGAGTGTATTGATAA
AGCCCTGGAAGATCCGAATGCCGTGTGCGCCCGTACTCTGATGGATGCTGTGGGGCACCT
GGTCTCGCGCGCAGTGGAGTCGCCGCGGTACGCGCTGCCGGCCGCCCGCCGCTGCATCGC
CGTGGTTGAGCGCGAGCAGACGGAAACCTTCCTCGAGTCGCTGCTTAACACGTGCCAGCA
ATGGTACCACGATAGGGACAAGCTGTTGGGCGCGATGATCGGCGGTGGACGACCTCGGTT
GATGGCGTTCCTGTCGTTCTTGCTGGAGATGTACTGCCAGCTGCGGCGCCGGGCCATCCA
GCGACGGGGAGCCAGCGCCCAGCCCGGGCACGTGCTGCTCGCGCTCATCTGCAAGTGCTG
CGAGGACTGCATCAGGCAGCCGGTGCCTTCTGCTAGTGATACTGAGAATCTGTTCTTCGT
ACTGACGTACATAGGCCGAGACTTGGAAACTCAGCTACCTGGAGATTTGGAGCGATTACT
TACAGCCGTCCGTGACGCTTTCCTCAATACTGCCGCGGCTCCTTCCATCAGGCGTACTTT
ACTGCAGCTCATAGAGCTTCACGCATCTCGGTGGCAGCTACCAGGATGCGCAGTTCTTTA
TTACTATCCTTCGTCCAAATAGCACGTTGTGCAAGGTGGTAGGTTGCAATGATATTGTCA
TCCATATAAACCTAGAATCGGATGTTCGTTAATATCTCACATTATGGATATTATTGCAGG
GCATATCATTTTAAATCATCTTTGATGATTGGCCTTATTTTAGAGCTAAATAAATTAATA
TATTTAGACGGCTGAGGGTTTTATCGTGAGTATCTTGATGTGATGGAAGTCGCGAACTGA
ATTTAATCTTGTGGGATTTATAAATTCTTTATTATTCTCACTAAGAAAGGATCGTGTTTC
AAAAAGCAAAGGTTACGAGCATTTCTTAATCGAGTGTTCGCTCGTGTTTCTTAGTACTGT
TGCGTTAGTTAATGTACAGGAGGTATGGAATTGTCCTCTGTCGTAGGCATAAAGCTGCCA
TAAGCTCATATTAATGTGCCTTTAAAATAATTTAATGGATATATAACACTTTATCGTCAC
TTTCATGCAACAAATAAATTTAATAAAAATATTGAAAGTGTGGTAAAGTGTAGTATTTAT
AAGATTTTGTTAATTTAGCTTAAGGTGGATTCGAAAAAAAATCTTTATGCCTGGAAAGTA
TTAAAAAGGTACATTGTAGATTAATTTGTTTGGACAAATTGACAGTGTACACTACTGTAC
GATTCTCGCATAGTACTTTGTGCATTGTATCCTTGTCGTATTCTAATTTAGGTATACATT
GCCATCTATTAATAGCACTAAATATCTTGCTTGTTGTATCGTTTGCATAGGATTCAATTA
TGTTTAGTAATTAAGTTACAATGCACTTATTCCCAACATGATTTAGTACTTCATTGCACT
CAGGTATTTAATTTAATTTATGTTTCAAAAATGTTTTAGGATTGGTATCAAAATTAAAAA
AATAAACGTTTGACTGAATTGTTTGTGGAAGTGAAACTATCTCTGTTTTATGCTTGTGAT
ATTATAAATTTAAGGTTTCTGGTATATTTTCTGTCCTAACCAAAGACTGTAATGAATGGG
ATATTTCGTTTTTATTTTTTATTAACAAAAAAGAAAACTTGTTGAAGCTGGACCAAATTT
CTTGTTTCGAGCTCATTATCTGAGGTTGTGTACGAGTGAGCGAGGAGACGTTCATCAACT
TAACCTTAGATTGCTCTTATCAATATATAATTATCAAAGTAATTTAAATGAATAATATGG
GAAATATATTATTTAAAAAGACCTTTGACTTTTCATAATAATGCATTCTTAGCGATTTAA
GTTAAAAATACGTTTGTAGAAAAAAGTTGAAATTAAAAAAATGGTGCTAACAAAAGAGAT
ATTGGTGTATTGTATCTTTATTCATTAATCTTATTACGGGCAATAACGTTGTTTTTTGTT
ACCGCTGTAGTTTTTGTATGAATAAAGCACTTAAAGG
(3577 bp) |
