| Name | A_BomaMG_comp24718_c0_seq2 |
| Scaffold_id | |
NCBI non-redundant (nr) | PREDICTED:_cold_shock_domain-containing_protein_E1_isoform_X2_[Bombyx_mori] |
| Ontology |
| GO:0003676 |
F |
nucleic acid binding |
| GO:0003677 |
F |
DNA binding |
| GO:0003723 |
F |
RNA binding |
| GO:0005737 |
C |
cytoplasm |
| GO:0005743 |
C |
mitochondrial inner membrane |
| GO:0005794 |
C |
Golgi apparatus |
| GO:0005886 |
C |
plasma membrane |
| GO:0006355 |
P |
regulation of transcription, DNA-templated |
| GO:0044822 |
F |
RNA binding |
| GO:0070937 |
C |
CRD-mediated mRNA stability complex |
| GO:0070966 |
P |
nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay |
|
Transcript Level | FPKM:11.91 TPM:11.03 |
| ORF Entry | |
Sequence (Nucleotide) | CGAAGTTTGAATAGGTAGTTGAACATAATACAGAACCAAATCGTGATAAATGTTGACATT
CAATATGGCGGTATGTCGTCAGTGCTATGCTGTGTCGTGCTTGTGAATATCGACTTACAA
ACGTGCAGATAGCAACACGATTTTATTATTGTCTGCAACCGAGCCAATGCATCACGGAGC
TCCGATTCAGCAAGCATTGAAGACATCTGAGGATTTAGCTTAACACAATTTAAAGTACAT
AATTTTATTTTGCAACAATAGTGGTTTTGGTGTGTATTAAATTGTCACAGTCGCATTGGT
ACATTATGTTCGCGTGAACGCAGACTTTATAAATATGATTTGATTAAAGCTTTGTAATCG
CTGTAGATTAAATTGTGACACCATAAAATTAACTGTGATATATTGGTAATAAAACAGATT
TTTGACTCTTATACAAAAAACCTAAGAAAAATATAATGTCTAGTAATCCTCAGTGGAAAA
TGTTCCAACCGCCAGATTCACACTCATCTCCCCTGCAAGATATTTTAGATCTCCAGCACT
CCAACATGCAGCACAAATCTTCGTATCGTAATGGTACCTACAGCAGTGAGTACCCAAGTT
CTCCTCGGGATAATTATAATGGTGGTTCCAAATCAAGTGGTGGAAACCGATTCTCAGGTG
GATACAATGCTGATGGATGTCCAATGGGTGACTCAGCGTATTCATCTTCTTCAACCAATA
ACAGTTCATCCCAATATGACTCAGTCAATCACCCACCTATTAGAGAGACCGGCATTATTG
AAAAACTTCTCCATTCTTATGGTTTCATACAATGCTGTGAGAGACAAGCCCGTCTTTTTT
TCCACTTCAGTCAGTTCAGTGGTAATACTGAACATCTTAAAATAGGTGACCCTGTGGAAT
TTGAAATGACTTATGATCGTCGAACAGGCAAACCAATTGCATCAACAGTCACTAAAATTG
CACCGGAAGTGGTATTAAGCGAAGCTAGAGTCACAGGCACTGTAACAACAGAAGTAAAAG
GTGAAGGATCTGGTGATAATACAGGTAGAATATCCTATGAAACTCGTGGAGAATGTTTCT
TCTTGCCCTATACAAAAGATGATGTTGAAGGGAATGTCACTTTACGCACTGGAGATGCTG
TCAGCTTTCAAATTGCAACTAATCAAAGAGGAACATTAGGTGCTTGTCATATACGTTTTG
AGAACCCCGTACATCCAGTTAAATATCATGGAGTTGTCTGCTCCATGAAAGAAAATTTTG
GTTTTATTGAACGTGCTGATGTTGTAAAAGAGATATTCTTTCATTTTTCTGAAACTAAAT
GTAAAGAGGAATTGACTCTCGGTGATGATGTCGAGTTTATTATACAAACTAGAAATGGCA
AAGAAGTGGCATGTAACATTACTAAGTTACCAAGTGGTTCAGTCGTGTTTGAAGATGTAA
GTCCTGAAATAATGCGTGGTCAGGTGTTGAAGCCTTTGGAACGCGGTAACTTGGTGCGTG
CAACACAGAACGATCCTCTCCCTGGGCGCATCCGATACCGTGCTGCAGATCATTCTGAAG
TTGAGGTCCCCTTTGGAGATAAAGACCAGTGTGGTGAGTTTACGCTCCGACACGGAGATT
GGGTGCAGTTTCAAGTTGCAACCGATCGTCGTGACCAGCTCAAGCGCGCCACCAATATTT
CACTCCTCGATGAATCTTTTTATGTATCTGGTGAACGGCGGGAGCAAGGTCTCGTGTGCT
CTCTGCGGGAAGGGTTCGGATTCATCCGTTGCGTGGAAAGAGAACAGACTATGTTCTTTC
ATTTCGCCGAGGTTCTTCGCTTAGGACAAGATCTCACCGTTGGAGATGAGGTGGAGTTTA
CCGTTGACCATTTATCGACATTCTCGAACATGAACACGCGGCAATCAGCTATTCGCATCA
AGCATCTCTCGCCGGGCACGGTTCAGTTCGAGACTCTGATCGAGCGCGGCGTCAGAGGTG
TTGTGACCAAGGAAGCTCAAGTGTACAACAACACCGGCAGTCCGACCCGGCAGCCTCCAC
CGGATACAAATGGACTAATCTCTTGTCAGATTAATCAGACTAAGAAATCTCTGCCTTTCA
TGGCCAAAAAATGCGAATCAAAAATGCTACCCCGTGTTGGAGACAAGGTCACCTTCGACT
TATACCAGGTTAAACGCACAAAGGAGCTTGTAGCGATGTCAGTACAAGTCCAACACAGTC
TTACAAACGGCAACTCGAGTAATGGAAACGGCAGCCGTCCCATCATGCAAGGTTTCATAG
CTGCTCTGAAAGATGGATTTGGTTTTATTGAAACCTCAGATCACACCAAAGAAGTGTTTT
TCCACTTCAGTAATTTGGAAGGTAGCCCGGAAAATCTGGAATTGGGCATCGAAGTCGAGT
ATAGTTTGGGTCGCCTGAACGGCTCTGGCGGGGGCTGTGCAAGCGCTGAATACGTCCGTG
TTTTGCCTCGAGGTACTATACCTATTGCGAAGACGCTAGAACCAACTCTAAATGGAACTG
TGACGAGAACCTTACGGGCTCTGAACCCTGATCAAGCCCAATATTCCGGTTTGATTCAAG
TGGAAGGTGGGACAAGCTATGAGTTTGGCATTATGGGATTATCATGCAAGCGTGAGATTC
TGCAGGTTGGTGATCCAGTAACTTTCCAAGCTGATATAGAGGGACGGGCCAGTAACATAG
TGCCAATTAGAAAGAAGCGACGTGCCATTGTTGACGCCATAAAAGGTGTTTTTGGCTTTT
TGTCTGTCGACGGCGAAGATACTCGTCGTTTGTTCTTCCACATGTCTGAGGTTCGAGGTA
ATCCCTCCGAGTTGCAGTCGGGGGATACTGTTGAGTTCGTGATGCTTACTAATCCTCGTA
ATGGGAAGTCTTCTGCTTGTAATGTCGTTAAAATAGCGAGCAAGGGTAAAGTGAGAAGTG
AACGTCCAGAGCGGCTTCTCTCTCGGCTCCGGACGGCTTCGTTGGAGGAGTCGGCAGGGC
CTCGAGTGATTGCTGTGCGCACTCCACGCGGCCCGGACGGATCGAGAGGCTTCCGTCCGC
GTCGTCCCATCGCAGAATTGTTGGCCGAGTGAGACGTCGTGGTCGACCAACCACAACAAG
ACCTGAACATTTTACAGCTATGTACGTAGTTAAAAAAAACAGCTATCGGTTTGATTTTCG
ATTTAAATTGTTTCATTGTATTCGTGAGAGACTGACTGATCCTCTTTTCATTAGCAGCAT
TTAGATTGTGTTTTGTTAATTGTGTCAAAAGTAGGTGACGAAGGAAAAGAAAAATAATTC
GTTACTTTGGCCCTTTCGATAGATCGGATCGCGTATCACCTATGTCGCTTAATGATCAAT
AAGGAGTTCAACATATCAAGTTTATTGATATCGTTTTTTATTCGCTATTTTTTTTTAATT
TTCTTTTATAAGAGGTTCTTTTTCGCATAGACACGTTGTTCAAAATTCCAACTATCTATT
TATTGTTTAGCATATTACGGTTTGCCAAGTTCAATTATGTATTTGTATAGGCTACTTGGC
GGACACATAACAAATGAAGGTCGAATTAAAATTAAAAACGCATGTATTACATATACGTCC
ATTAAATATACTTCTCTTATATGTATTGAATATATGCTTTGAAAATTTAGAAGCATTTTT
ATAATTATATGAAAAAAAAAAGAAACAAAACTGGACCACGTCTGCAAAGTGATAAACAAA
CTTTTTGTATATTTATGTACAGTTCGCGAAGATCGGATATAAAAATGGAATGTTATTTAT
TATTTGATGGCTTGCTGTTATGTTGTTTAAGAGATCTCTGTTATACGAAACATGTTCTGT
GATTTTGTAAAATTTACGTGCAATAAACTATGAAATGAATTATGAGCTACTTTTATCAAT
GATGTAATCAAAAAGTGAAATCAATTTCAAAAATAAAATGTTAATATTTTAAATACAAAG
TCCTTACAGGACAATTCTGCTAGTCCTTTAGTGTTATGTGTTTTCTCTCCATTGTTATTT
TACTTCATATGCTATGTGTCGCCAGAAAATTAATACTCTTGTAATTTACCAATAATTAAC
AGTATGACGAACAATCACTTGCAACAGCAATACATTTGCTATGAATTATGCAACATTTTT
TTTACCAAAGACTGAAATAAAAAATCATTTGAGTAAATAAGATTGGTGTTAGATTTAATT
TAATTGTATGTTGCACACATATCTATAGTACGAGTATTTTGTGGCAGTTTAGATGTTTTT
TCTTCATAATCTACAATAAATAAATAAACATTAGAATACAAACGTATTGCCTTTCATGTA
AGCTTAAACGTACGGAATTACGTTTTTGCTTGTTTTCATATTTATATAATAAAATATTGT
ACATAATATGTTTGTATCCGACGAAGAATCGAATTTAGCTCGGTTAAGAAAATTAGTTTT
GGCATTGTATAGACATACATATATATTTTATGAACACCTGTCTTACTACACCGCAATAAA
GATGTGATAATAATAAATTCTTGAAGCGCGTGGAACTATCCACGTAACTATTCGTAGAAT
TAATCAACATGTGCCTCACTGGCCAGCCGAGATTAGGCTTTAGGTAACGCGACCGTAAAA
AGCTTTTAAGGATCTTTATGAATGTGATCGAAGTCGGTTTTGGAGACGTTACCGACGCAT
CAGTGTTGCCAATAACAAAAAATATATATATCAGAGAATTAGTTTATATGTAACCCATGT
TGACACTTAAAATACTTTTACTCATTTTGCCACTAATAAATTATAACGTTTTTTTTGTCT
TTTCAAATTAAGATCATTTTAAATTTGGAAATATGGTAGTCTTTTTGGTCACCTGACGAC
GTTGAAATTTATTATTATCATGAGCGTCACATTTAATTTTATAATCTTGATATACAACCG
GATTTATTTAATTTTATACATATTTCTGTTACTAATTTATCTCTATAAATTTATTTGTTA
ACAGCGCTTCGTATTATGACCTTCAGAAATGTATTGTCTAATCATACTAAAATAAATAAA
AAATTGATTTTCACAAGATGGCGGCTGATGCGCCATTGTTATCACGTTCAAAATGATCCT
TGTCTTGCGTCTAGCTATCGATTCTCAGGTTACCTACCGAAGCTGGCTAACGTCTTATGC
ATATAAAGCAATAATACATTTAATTAATATACAAAGTACCAACTGTGCATTATTAAAATT
TGTTAAAGCGATATTAGGAGAATTCCTTTAGCTTGTCTTTGCCTAGCTGCATATCATATC
CCGAAGGCGCCTCTCGGGTACTATTACGTTAGAAAAGGGCAAGCAAGACCGGTGTTTTGA
TAAGCGTCATTTACACACTGGATCTATAAAATAGTCGTTACACGAAATGAATCTATACAA
CAACATCAGACTTCGTCTTAGACGGAAACTTATAATTATCTTAGATAATATTTTCATTAC
GAGCAATAAAATGTGTTCAAATATTTAACGTGCCCAATGTGAATTTTGATATTTCTGATA
AAATTTCCATATTTTGTGATAATACCTGGCCGCGCTGACCAGTTTTTGTGATCAATGATG
AACCGTAAATGTGTAAATGTCGTTTTTTTTAATCGTACGATTCGACGGGGCCACTGCGTT
TTGATGTGGTAAGTGATTTAGTGCTAAATGTGATTACACTAAGAAACGGATAGGTGATAA
AATTTACGACAAGAAATTCAAAGTACAAGTACAAAGTGATCATAGATTTCTCATTTTTTG
ATATCACGTTTTTAACGTGTTAAGATTAGTGAAATAAGCCTTGTTGTTTGATGTGTACAA
TATTTTTGAACGTATTTCAATTGAACGGACTAGAACCCGAAACGGTAGGAGGCTATTAAA
TGTATTTTTAGGTGTTGCCAGTTTTTCTTTTTTTTCTTTCTATATCGGATCTTACCCTTC
AATTTTTTTTAGTGCTCTGTAATCTAATACCCCTCCTGTAAGCCTTTCTAGACGAACAAA
TTTTTTTAAATCACATTTCTAAGTATTTTAATGTCTTTGACTATGGCGGTATGTCTTAAA
TTTCGTTTACGATCGATTACGTATAACTGTTTAGGAGTGTGAGTATTGTGAATTGTAAGT
AAGTAAAAGCGAATCCTATGTAATTAAGACCGGTATAACCGTTATCGCTTTCTCGCTTGT
ACATATTTATTGAGCGAGGGAATTTTGAACAAATGTATATGCTTACTTAGCCTTTAATCT
TGATGATTTGATATTCTGAATCGTAATATTTATGCTCATGTAACCATAACATAGTAATAG
TAATGTAATAATATTATCAAAATATTTGGTGTTGTAGTTTACGAAATTAAATCCCGTGCT
ATTTCGGGTATAGGTATTAATATGTACTAGTCTTACATATTTACATCATCTATTTTCACT
TGAAAAATGTATATTTAAGATGCTATGAATGTCTTGTGAGATCTGACCAACGTAAACTGT
TGTTTATACTCAAACCAAAGTGTCTAGCAGTGAATTTGGCGAACCTAAAACAATTGTCAA
ATACAGTGCCTAAAAGAACCTCTCGGTCGGAAATACCAAACAAGAAATGTTAAATTATTT
AAGCTTTCAGAATTACAAACTCTGGAATAATACTAAGGGTATATTTTTATTTTTTATTCT
TCGAATATAATCGTAATGGGAACCGTCTTTGCCAAATGTTTTTTGAGACTTGATTAAACA
AACTTTTACTATTTCTGATAATATCCAAATGTGTCGTGTAATTTGTAGATAAAATTAAAT
AAGAGTCGTCTCGTAAAATTCTGTAAACATTTTATTAAAAAAAAAAAAGTATTAATATAA
AATACATTTCTTGCATTTAAATAAATGTTTTGTAGCTTGGCTCTCAAAAACGTATCTTGT
TTTTTATGCACGTCTATGAATGAATTTAAGATCTGAATTTTTCGTAAACATTAAACTAAG
GCTAAAATAACGTCAAATTATTCAAACACGAAATTATTATAACGAAAAATCGTCGTAAAT
ACTAATCGAATTTTATTTATAGGCCTTAATAGTTTTAGTGAGATAGTAATTTTAATCTGA
TTAAAATTTATTGCACGTTACTGGGGTGAGTGCGTTAATTTTTTGATCAGGCTATGATTA
CGCGTTGTGCTCGCTAGCGTATTACAATCGAATGGACCTCGCCAGTGATAAATATCGGAG
TTTTGCTCCTAACTATAAATACTAAAGCAACGACGATTTTATAATTTTATACAAAGCAAT
GAGTGCTGTTTATTAACGACTTTGAAATACCTCTCGATTATTATACAAAACAAATTAGGT
TTTACCGTATAACTTTTAGAATATTAGTGTCGGTGTCCGCACTGTGTTAGTTTTATTTGA
AATTTTCCATGGTTATCATGTGATGTGAAATCGAACAAGGCACACCTGGGTTATTCCATT
TAACAAATGACATTGCTATCTATATATATATATATCGTTCAATGTGTTTATGTTAACATG
GTATAAAACTCGAAGGC
(7517 bp) |