SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp24535_c0_seq6
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_phosphoserine_phosphatase_[Amyelois_transitella]
Ontology
GO:0000287 F magnesium ion binding
GO:0004647 F L-phosphoserine phosphatase activity
GO:0005509 F calcium ion binding
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0006563 P L-serine metabolic process
GO:0006564 P L-serine biosynthetic process
GO:0008152 P metabolic process
GO:0008652 P cellular amino acid biosynthetic process
GO:0016311 P dephosphorylation
GO:0016787 F hydrolase activity
GO:0016791 F phosphatase activity
GO:0042803 F protein homodimerization activity
GO:0046872 F metal ion binding
Transcript
Level
FPKM:109.39 TPM:101.29
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
CTCAGATAGTAGTTTTGTAGCTCGCATCATAACTTATCTCGAGGAGTGTTGTGGATATAA
GGCGATAAAACCGGCATGAGTTTACTGTACCGTGTGATATCACATTCGACGGAGGCGTGT
TCGTCGTATTTCCCGCAAATTTGAAAAGCAACCTGCAGTACGCGACGTTGAAGACGCTCT
CACTGGTGTCGATCAGCGTGATGTCGCCTCAACAGACTGTCCAGGAGTTGTTCAGGACAG
CGGACTGCGTTTGCTTCGATGTAGACTCGACTGTCATACAAGATGAAGGCATCGATGAAC
TGGCCAAGTTCTGCGGGAAAGGAGACGAGGTTAAAAGATTAACGGCGGAAGCAATGGGCG
GCAATATGACATTCCAGGAAGCCTTGAAGAAGAGACTGGACATCATCAGGCCTAACGTCG
GTCAGATCAGAGAATTCATTGAGAAATTTCCAGTTAGACTAACTCCTGGTATTACAGAGT
TAGTGAAAGAGTTACACGAAAGAGGAGTCATCGTATATCTAGTTTCGGGCGGATTCAGGA
GTCTAATAGAACCGGTCGCGGAGAGACTAAACATCCCAACTATCAACATCTTCGCTAATC
GACTCAAGTTTTATTTCAATGGTGAATACGCTGGTTTCGATGAAAACGAGCCAACATCGA
GATCCGGCGGCAAAGGTTTAGTGGTGAGACGACTGAAGGAACTGCACGGGTACCAGCGCC
TGGTGATCGTCGGGGACGGGGCTACCGATGCCGAGGCTAGCCCACCTGCTGACGGCTTCA
TTGGCTTCGGGGGTAACGTAGTACGTGACGAAGTCAAGAAGAAGGCAGCCTGGTACGTCA
CGGACTTCCAAGAGCTGATAGATTCCTTCACCATACAGACCAAGTCTTAGTGGGGAGTAC
AATGACCTTATAGGACTCATACAATTTGCATGCTTCAAATTACTTTATCGACATTAGACT
AATTTCAATATTAGTAAATACTAAATATGTCTTATAGATTGATTTTTATATTAGCGACCA
TAGGTCGTGTAGTTTGAATGTAGTGAATTTTGATGTTGACATCTTAAGATTTTTAATACT
TCAAATTGCTTTCATGACTAGCTCCTAAACTAGTCTAGTGTAGACTATAGTCGGATTTTT
TATTAGACGAAGTAAACTGACGTTTACTGTGTTGTCAGTTTTTGATGAAATAAAAATAGT
GTTGTGACAAAGTGAACGATTGAAAAAACTCCTGAATTAATGAAATTGCCTCGATTGTCT
AGTGAATAGTTAGTGTGCCGAACTGCCGATATCGGGCACGGGGTTCGAATTTTAGCCGTG
TTTTGTACATACCAACGAGTTTTCGACGAAACATTATGTTCCTATGGTATCTACCTGTAC
TAAATACCGAGTGTTTTAAACATTAAGAAAAACATTGCGAGGAAGTTTGTAAGACTGTCC
TATTTCCAATGCATCATATAGTTGAAACTACAGATGTATAAAATATAACAATTATAGGTA
CATAGGTAATGAAAATAAAAAAAACTGATTGTAGTTACATACTACTAGTAACATATTATT
ATATTGGATCACTTTAATACAATTTTATTGTAAAATATAAATAATATTCTTTTATAGTTT
GAAATTAATGATTAACTCTTCACACTCATTGTTCATTTATGTGATTGAACGAGAACTGAA
CGCATCACTATTACTTTAAATATAGCAACATTATTTCACAAAGTGACATTAGCTACTGTC
AGCTGGCTTCGTCTAATTAAAAATCCGACTATAGTAGTTATGACTTCATTTAAAGTTTTA
ACGGAAATTGACAACTTTCAAACCGATTCGGGAATGAAATAGGTGTTGCTAGTGTTGAAA
TCTAAATTTTACCAACAGTTAAAGTGAAACGTGTGAAATTTTATTTATTTAATCCAATAA
TAAATATATTTTAATAAACTTTTAAAAAAACGTGGTAATTTACACTGTGATGTAACATCG
CCTTAAATATTATTTGTATATGATAATAGTTATTAAGATACAATATTTTAATTAAATTTA
CTATTAGTAATCTTTGGATTTTTTGTATCATTTCACTAATATATTTCGAAACAGAACGTA
GCACAGTCTTTTAACTGGAACCTGTATTTCGATTGTGCATTTATAATGAAATTCTTTTAG
TAAAATTCTAACACACATTTTACATTGTGATCGTACTTTAAGTACAAAAAATTAAGCTTA
TTTTTGTATGTAGTGTTTCAGGGACTTAGTCCTTTTTGGAATTTTTTTTTTAAACGAAAT
TCTATTTTTATGTTGTCGTATGTGTAATATTTAGGTTTAATTACATTATAGTAGTCAATT
ATAATGTTTTGTAATAGAGGGTGCCGCGAGGGTAAAACGCAATTGTGCTCAAAACGTAAG
CGAGAAACAGTACTCATTTTTTGAGCGTGTATTTGTCGTTTTAGCAAGTAATCTAAACTG
AGGGTAGAAATGAAAACCGCTCCTTGAGAGCGTAGAGTCCCTTTCAGTCGATTTTCAGTA
CATTGCGTGCTGATGCGAACCAACTGAAATGCCAAGTGTTATATTAAGGCAATTAATGAA
TAATAGCCGACTTAACCTAATAGTTGTGTGGCTCTAATAATGAATATAATAATAATAATG
AATAATGAAAATATTGGTGAACGGTTAAATTCCATAATATTATGTTACGAAATTGGATTG
TGTTGCCAACACAAAAAGTTGGTATCTAAAACACCGGAATTGTTGATTGTTAAAAACGGC
TGTGTACTTCTTATGCTCTAAGTTTTTGTAATTAAACGAATAAAATTTTAATATCATGAT
GTGAAAAAAAAAAAAA
(2836 bp)

- SilkBase 1999-2023 -