SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
NameA_BomaMG_comp24386_c1_seq4
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)
PREDICTED:_calcium_channel_flower_isoform_X1_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0003674 F molecular_function
GO:0005262 F calcium channel activity
GO:0005829 C cytosol
GO:0006810 P transport
GO:0006811 P ion transport
GO:0006816 P calcium ion transport
GO:0006897 P endocytosis
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0030054 C cell junction
GO:0030285 C integral component of synaptic vesicle membrane
GO:0030672 C synaptic vesicle membrane
GO:0031410 C cytoplasmic vesicle
GO:0045202 C synapse
GO:0046530 P photoreceptor cell differentiation
GO:0048488 P synaptic vesicle endocytosis
GO:0070588 P calcium ion transmembrane transport
Transcript
Level
FPKM:17.04 TPM:15.78
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
GTCACATTGCCGGCTTTGATAATAATCTACTCACTTAGGCTGTGGATAGCTTTTAAAAGA
CTACAGAAACGAAACGATTCTTTTAATTAATGTTAAGCATCTCTTGTTATTTTATATATG
ATGTTTACAAAGATTATAATATATGGTTTATGTGAAATGTTATTATTTTCCTAGTACGAG
GCAATGAAAACAAGAACATCAATATACACACATTTATTACAGATATGCAATACTAACAGT
AACATTAACTTGACGAGAACAACCGCTTACGACTATGTATAGTTATTATAAAATATTTAC
TGGAATAATTTGCGTTTCAAATAAACACAAAACATTTACTCCACATTGATAATATACAAA
AAAAAACTATGATGATTATAAGTAATTTATTTGATTAAATAAAATAAACAATATACAAAA
AATATATGTTGATAAATGACTTAAAAAGAACCATAGAAACAGTTCATGTTTATGATAAAT
TCTTGAAAAGCTTACCAACCTAAGACCTCATCAAGGAATATGATAGATTAAATTCGACCA
AAACTTGACTATTATTTATTTTTATGCAACAATACGAAATATTACCATCTCGGTTCGGAT
CCGAATATTAATATTTTAAATTGACATTTTCATCATTATCCTCATTAACGTCCTATATTA
GTCCAGCGTGGGACATTCTTTTTTTTTTAAATTTTACCCTCATAAAGTGTGTTTTGTTTT
AGACGAAAAGAGTGGTCCTGTGTAGAAATCTTATGTAATTACATTCCGATTACAAAATTG
TAGAACATAAATTAAACTATGAAAAACAGTAGTAGATCATTATCACTACATTATGTACAC
AGAAAAAAAAAGAAAATCATGATCAATTAAATTTTCAGAATATAAGCAAAATTCAACAAC
ACTAGATGACAATATTAGTTATGCATAACTAGTTACATAAGTTAAATTTCATATAATAAT
TTTTCATTTAAGGCAACGTGCATGCATAAAATCAGCTATTGTAACTATAACCATATTACC
AATCTGGGTAAATGTTTAAGATTCTGCTTTGTTCGTAATTTTTAAGTCTTCATAATTCAG
TTCCTCCAAGTCTAAAGCCATTTTTCTCTGAACAACTGATATGACGATCGGACTGCCAGC
CAAATGAGCAGAGTTTATCTCTACTGCCTGGACACTCTGCAAAGATCGTTTCAGCCAAGT
TCCAGCTGACTCTAAAATGAACTCTTGGTGATTCTTGAATGCTATGACGTTTCCTTATTT
AAACGAAAGAGAGTCCTCAATGGTAAGCGACTTCGCTCTACATCTGATAGAGCTTATGAA
GAACCACACTGAGAAACCACCAACACGCCTAACCGTTGACCACCCTAGACAAGATCTGCG
AGCCGTGAGAAGCCACTGACCACTCCATCACACGTTACGTACATAGGCTCTATTCCATTG
TCTATTTACGGTCAGTTTTAAAGGATCCGACCATTTTGTATTATGTATCATAAAATTTGG
ATCAGTCCAAAAGTCCAAAGAAGCCACAGGTACCCAGATTGTATTGGTCGGTTATGAGCA
ATACCGTTTTACTAAAATTACGAATATCTAAGACTAGTCGCCTTTCACTCGATAATACTT
GGAAGCGTTTTATTTATGAACGTAGCTATTCATTTACTTACAGTAAAGGATACCATCTGT
TCCCGTGCTAACGGAATCTGAGACCGTGTTTTGTAATGACTGCCAACGCGACCAAAGTTC
CTCATATAACAAGCAATTTCCGAGAGCCCTGAGACTTGATAAAACTAAACATGCTCGCTC
ATATTGATGTCAACTTGCATAACAAATACATTTAAATTTGAAGGCGCGAGTTGAGCTTTA
TATGATGCAGTTGTGGTCCATCTGACACCATGGTACCTAACTAGTCAATGTGGCTCGTGG
ACATAGACGAAGCCATGGACAGTAAATTCGCGGCCTAAACGCTGAGAACTGTTCCAATTT
TGTTTGGCGTAACAAGTCATGGCGCTTATGAAAAATCGTGGGAGATCGAGCGGTGCGTGA
CGACGTGCTCTCTGAAAACGAACTACAGATGAACGCAACGGTAAACGAAACAATAATAAC
CGATATCGTGTTCCCGGAATCTTCAAACGGTTATTGAGATCAACATTATCAATCGGTCTT
CTGTACACAGACAAATGTAAGCAGGCAAGGGAAGTAGGAATAAATCGTGAAAATTGTGCT
GTTTGCTCGTGTGTGCTGTTTGTGCAAGAACTGTAAATGGTAATGTAAACTCAACGAGCA
AAACAGCCATAACACCGACAGTAAAAACAACGCTCAGCAAATTTAATTTCATATGTGAAC
TGCGTCGTGATGTTTTCAACTATGGAAGCATCTAGAAAACTGCTCGGTTCGATAACGTAA
GGACTTTTTGGAGAAAACGCGGGGAGCGACGTTGTGGGAATTGTTTAATTTTGTAATTTA
GTGTTTCTTTAGATTTAAACGTGTGATAGCTGTGGTTTATTAACTGTTTAGCATCTGTGA
AAGTGCATGAATATCGGAAAAATGAAACAAAGCCGCCGAACGTGGCTTCTCGTGTTCTTC
CAAAAAGTTCACTCAAAAAGTCTTCATAAATAACCACCATTTTACTGAGAATTTATCAAA
TACGATCGCATCTCGTTTCATTTCAAATCATCCTAATTTATTTAAGTTTCAAATTTATCA
ATCTTCATCTCATTTCGGTCCATATTATTTATCATCTTGCATTTAACAGAATATGCATGT
AATTAATAATTGAAGTTTTTTTTAATTCTACACTGGCAACAACAGCGTCTTAATAAGCTA
ATTGCCATACTTAAAAAAAGGGAAGAAGAGATAAAATATTTATGGGTTCGTATCCCGTCG
TGTACTGTGCACAATGGCATTATGTGTTTGTCACCCTTGTGATTTAGGACGTTCATAAAA
ATAAGCCTTAATATCAACAAATCAAGGAAAAATAATAATTGGAATGTTGTAATTAAACGC
AGGCGACGCAAAACGTACATACGTGATAGCGTCATACTTCATACCTCCTTCAATCGAGCC
TGTGTTTCATAGTTACAATTTATGGAATATTCTAGATCACTCCTAAACAAAAAACTCTAG
AAGATCAGATAGATTTATCCAAAGTCTTTAGCCTATTTATTTTAAACAAGAAACGTTATA
TTGACATTACTGTATTAACATCATAAATATTGTAATAATATTTAGTAGTAGTACATGATT
TTTTCTTGAAATATACATATTTTACATCACTAAATCAATGAACATTGGACTATCTATTTT
ATGTTACTATTCTTTGAAAAACTTTTCAATTTCACAAATCGTGCAACAAAGACAACTATG
TACTTCATATCAACAATTAAAGAATATAAAAAAATAATTCAATCGTTCTCCCGTAATATT
TCATCTAAACTTTATATTTGACTGATAACTAATTTACTTTACAAATTTGCTATTAAATTT
ATCTAATAAATAAATGTAGGAATAGACAGCATTACTACATACTTGTCTGATTAATAAATT
TATTGTTGTTTGCATCAATGAATTTTTTTTTTATTTATTTACGGCCAATGGTTACAAGAC
CTTATAGCCTTTGCATCAATGAATAGGTATAGTGTTACCACATCACAAAATTTCGCTAGA
CGAAACCTATTCAACCTCTGTACTTCTGTAATATCTACAACGCGACTTTACAATTACGAA
CAAACCTACAAGTACTACTTAACAAGTGAACATGCATTATACTATTCATATACCTACACA
TCTGATTTATCTTTTCAACGACAGCGTCTGGATATGCGCGTAAATACATTTATAAATGAA
GAAAAAAATTACAGCCCTTTTTTTACATAAATTAATAATATTAGGCTGCCAATAAAACAT
TTTGATTGAAATGATTTCATATTGTTTTTTACTTGATGTTCTAAAAACAAAGTTGCCATA
TCGGTTTACACAGCTAAACATATATTTTCCTTTGATTTTTTAGACATCCTGGAAATCATG
GTTATGGTAACCTTGAGACATGCTGAAAGACGGCGACAATATCCTTTGAAACAAAGCATA
CAGCAGCAGCAGAAATATGAAGGTCGATAATATAATTTGACCGACAATTCACTATTTTTT
AACATTGGAATCGTAAAAGTTTCTAGAGTTTAAAAATATATTTGTATTACCTAAAATAAG
TTATTATGAGTCTCGTCGAAATTGAAAGCAACTTACAAAATAAATCTTAATAAATAACAT
AGGTAGTAACGTCTTTTAAACAATTCAGTACGAAACAATTTGGAAAAAAAACATTAATTT
ATACGCTCCTGGCAACCCTATGCAGAACACCTGGAAATTTAACGATTCGCTCGTGTTAAC
TTTAATAACTTTCCCCATTGTGTTTTGGAACACTTTGAGCACATAAAAAGTTTACCTAAT
TAAGATCATGTCATTTTACAACGTACAGCCTCAATTGGTATTAATATTAAAAAGACCTTA
CTATAAGTAACGATAAAGAAAATTGATAAATAACCTAAAAACTATAAAATATACTAACTA
CAAAAATTGTATATGATTAACAAAAACATTTGAAGCAACTACCAGGCAAACATAACTTCA
AGAGAAGTTTTAAAAAAAAATACACGTCTGAATTCGGAATTCGAACGTCGCCCTTCAAAA
AGTACCAGGGAACTCGACTATTGAGGAAGTAAATGATGTTCTGAAAAATGAAAAGTCTCA
CGTCCGAGTACTAGGAGCGCATAACTTTGCGGAAGGTGAGCGGTCACTTGGTGACAGGCG
TGCCGGTGAAGCTGACGGGCTGCTCGTTGGTAACGAGGGTCGCACGGGGCGCGGTCGTTG
GCCCCACGCCCGCCTCCAGATTGGCCGCCGACGACCGCATGTCTTCTATTGACGCTTTTT
TGCCGAGCGCCATCATTCCGTATATGATCCCGGTGGCGAATATCAGTCCGCTACCCAACC
ACGTACTGAAACTGAAGAAGCAAAGGAAAAACGGAGGCACGGCCAGTCCAAGATACATAG
CGGCCTTGTTCCAATAAGGTCTGGTCTCCATTTTCTGGCTCAAGGTCCCCACGTAGTCGA
TGAAGAAACAGCAGCAGGGAGCCTCGCATACTATGACAATGAAACCAGCAAGCATCTGCC
ATATGCCCGCGATCAGGCACGGCACGTCCAAGGTTAGAATGCCCAAGCAGTTGAAGAGAC
CAAAGAAGATGGCGATGAAGCTGCCAACTGTTCCAAGACCCCGTCCAGCATATCGCATCC
AAGTAGGAACGTCATCTTTCTGGGCATTGTCACCCCCCGGACGCGACATGAGCATCGATA
TCTTGTCCGTTAACGACATTTTTGTGAAAATCAATTCAACCTGCCAGTACCGCCTGCGCT
GTCAACGAAACTCATCTGGGCATTGTCACCCCCCG
(5435 bp)

- SilkBase 1999-2023 -