SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomaMG_comp11191_c0_seq2
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		putative_tumor_suppressor_protein,_partial_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0000010 F trans-hexaprenyltranstransferase activity
GO:0005737 C cytoplasm
GO:0005739 C mitochondrion
GO:0006744 P ubiquinone biosynthetic process
GO:0008299 P isoprenoid biosynthetic process
GO:0016740 F transferase activity
GO:0046982 F protein heterodimerization activity
GO:0050347 F trans-octaprenyltranstransferase activity
GO:0050878 P regulation of body fluid levels
GO:0051290 P protein heterotetramerization
GO:1990234 C transferase complex
Transcript
Level		FPKM:3.09 TPM:2.86
ORF Entry
Sequence
(Nucleotide)
GAGTGCGATGCTTGCTAGTAGTCAATTATTTAAAATATTTTATTGACAGACGTTGATTAA
AGTTATTGTGAAATATCATAACAAGCAGTGTTTATTCGTTTTATTCACTGTTATTCATTT
TTGTTAGCCTTTTTAAGGATGACAATTTCATAGTAAAGGAGAATCAGCTTTTAGTGCATT
ATAATGATCCTCGATAAGTGTATCTGCAATGTTCAAATCAATCCGACATTCTGTAGGGGG
TATAACACATTCAAGGATTCCATTACATCGATACATACCAAGCTAATAAAAACGTGTTAA
AAAATGCTTAAATGGCGTCTAACTTAAAATTATACTTAAATGAAATTTAAAATTTAAATC
TTTTGTTTTTCAGGAGTGCTTCAGAAGTTCCTGCAAAATTTCCTTCATATGCACAGGATC
ATTGAAAGTAGCCTGCATCCATTATTTTCCATAATCTATAATCTTCACTCACAATAAATT
ATGTCAATTTCTATTAAGGTAACAAGAAAATATACCTATAATTTGAAGCATAATGCTATC
AATAAAAATTGGGTATTTTTCATTACTTAACCACGCTAATGGTACAGAATCACAGATTTT
GCTTACTGATTTATAATATTAAGTCTTCGTGGGCCGCTGTGCAGGGCATGCATGGAGCCG
CTCAAGACAGTGTCTCCTTACCTACTTCGAAGAGCTGGGAAGGTAGATGCTTATGAGGGT
ATAGTGGAATCATGGTATAGATGCTTTCCACACAACATTGAACAGTTTTAAGATGTAAAA
AATCTGTCTATAAATGTTAAGCTACAAAGTTGTTATCATTTTCTTTATGGTATCAACAGA
TTCACAATCACCGAACATCTCAATGTAGTTTAATGCCTTATTAGCATTTTCGCTGTAAAG
TGATCTAGTTTGTTCTATAGCATTAGTTCTCAATATTTCCACTTTCAATTTGTCTAAATC
TATGTCTGAAACGCTCTTAGCATTTTCTAGACCATGATATAATTTAGGGTTTTCATGTAA
AGCAAACAAAACTGGTGCACTGACTAATGAGTAATGTTCTTTGTTATCAGATGTTAGTTT
TTGGATTTCAGCTGAAGCTTGCCACGCTAAACAGAGATAGCAGCCAAATTTGTATGCTAT
TTCTTGTTCTTTTTCACCTTTTGCTGAAAGTAGTAATGCGCCTTGACAACCTCTGCCCAA
TAATGTACCCCCATTGAACATAGTTCTCAGAGTCCATTCCCGAATTGGTTCACCTAGTAT
ATTGTTAACTTTTAACGGTGTTGTATCACTGCATATATCGAACTCTCCAGTTTCAAAGGG
CACCGGTTTGCCTGGTATGGGTATGTTTTGATTGTCCCGTTCACCAAAGAACTCTCCTTC
GCTCAAATCTCTCAATGCTGTTGATATCAAGTAAGATAAATCTTGGTTTTTAAGCCTAGC
AAGCATACCGTTTGCTGTGACCAGTAGATAATCACCAATGAGAATGGCTATTTTATTTGC
GAACATAGATGTGGCCATACTACTGTCTCGGTCATCAGGTGCTATGTTTAACAATCCTCG
ATGGACATAATGACCTGTTCTAATCATTTCTGTCAGTTCAGCTAGTATCCTTTGATCTTG
GGCAAGTGCTGAATTTTGTAATGATGAAGTCTCTGGACTGACAGCTTTTGATAGCAATAA
AATGATGAGACCCCATGGCTGTAGGTTGTTGTGTTCATTGTATAAAAAGTTTTTAGCAGT
TTTGACTATTGGATGATTGCTGCCAACCACTTTTCTCAAATGCATGGCCAAATTAGCAAA
TTCATCGCTCAACAACCACCTCAAATTCATGAAGGAAGTCGGATAGCCCACGATCTTCTC
CGCTTCTCTTATAAGTTTGCTCCAGTGAGTTAAAGGAGGTTTAAATACAAAGTCTTCTTG
AGTCACACTGGTCATGGTCGTTTCATAACGAATTTGTTGTGTTAAAATCACGGTACGACG
TAAATGGCGCATTATAGCGTAAGACATGTTTCGTTAATAACTTATACGAATATATTTTTC
ACAGTCACATTCAATTTATTCAATAATTATGAGGACGATAAAAAACCCAAAAACACTCAT
TCGCGGTTTCCGCGTATCTTTAGGAATATAACATTTTGACATTTCCATATGTTGTTCAGA
AACATAAACAGCAAAATTGAAAAAATCCCAA
(2191 bp)

- SilkBase 1999-2023 -