SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomaASG_c7536_g1_i1
Scaffold_id
NCBI non-redundant
(nr)		KDEL_endoplasmic_reticulum_protein_retention_receptor_2_[Bombyx_mori]
Ontology
GO:0005046 F KDEL sequence binding
GO:0005783 C endoplasmic reticulum
GO:0005789 C endoplasmic reticulum membrane
GO:0006621 P protein retention in ER lumen
GO:0006810 P transport
GO:0006890 P retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum
GO:0015031 P protein transport
GO:0016020 C membrane
GO:0016021 C integral component of membrane
GO:0016192 P vesicle-mediated transport
GO:0019233 P sensory perception of pain
GO:0030140 C trans-Golgi network transport vesicle
GO:0046923 F ER retention sequence binding
Transcript
Level		FPKM:56.67 TPM:44.34
ORF EntryO_BomaASG1110_complete:A_BomaASG_c7536_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
GTCATGTCAAATGGCCACGTCATTTTGGCTTGAATGAGAGGCATACGCGGCGATCTTTTA
ATTAATTGTTTAACGAACAAATAATAGAAACATGAATATATTCCGTTTGCTTGGTGATCT
ATCCCACCTGTTAGCTATAATAATATTGTTATTAAAGATTTGGAAATCAAGATCATGTGC
AGGGATATCAGGAAAGTCTCAGATTCTGTTTTCAGTGGTATACACGACACGTTATTTGGA
TCTACTTACAACTCATGTGTCCCCATATAACACTGTCATGAAGTTGGTGTTCATCTTTAC
CTCCTATGCAACTATTTATTTGATGTATGTCAAGTTTAAGGCCACCTATGATCACAACCA
TGACACATTCAGGATTGAATTTCTACTGATCCCCACTTTTATCTTGGCTTTATTGATAAA
CCATGAGTTTACTGTTTTGGAGGTATTGTGGACTTTTTCCATTTATTTGGAATCTGTCGC
TATTCTACCTCAACTGTTCCTGGTTTCAAAAACAAGAGAGGCCGAAAGCATTACCTCTCA
TTATCTGTTTGCTTTAGGTTCATATAGAGCTCTGTACCTCTTGAACTGGGTTTACCGTTA
TGTTGTGGAGTCTCACTATGAGTTGATAGCGATTATCTCGGGTGTTGTGCAGACAATTCT
GTACTGTGATTTCTTCTACCTTTACATTACGAAAGTGTTGAAGGGAAAGAAACTACAGTT
GCCAGCTTAAGTTTTCTGATAATATCTGTTTAAATGTTTTTGGTGTGAACCAATAAATTA
CCTAAGATTTAGTTTGTATAAACTTTGTCTGTTTTGTGCTATTGTGAAATTGTTTATTAA
CTAATCACAATGTATGATTGTAATACTGCAACAAAATGAATGCAGTCACAAGCAATAAAT
AATTATTATATGGTATTTAGGATTTTTTAATTTGGTACAACAAATGTAAAAAAGGATAAA
ATTATTACAAGAAAATTCCTAGGATTTCTTATGTATGTTTGAAGTACTATGGACTAATAT
GTATTTAAAATTATAATTACGTAAGTGGTGGTACTTGAGGTAAGAAAAAATGCAGTCAGT
AAGTATATACACAAGTGTAGTTCATTAACATCAAAAGTATGGCTGTTTGTCCATTTATAA
CTTCCTGTCCTGATCATTAAATTCCCTAAAGTGGTATGTACCATATTATTTTGCCCTAAA
AATCGATAATTCAGAACTTGTCTGTTTTGCAAGTGTTTAAAGACACTTTAATTTTCGTAT
TCTGTATTGGAATAAATTTATAGAGTCATAATTGTTTTATTTTTTATAATTGAGCCATTT
AACGAGAAATTACTAGGTAGTAGTTTTCAGTCTACCCTTAAAATCTATAAGTTTAGTAAA
TTGGACTCTGTAGCTGTGACATTATTGTATGTGACTGCTTTTACATTTTACGTAAATTTA
AATAAATGAGTACTTTCGTACTCGTACTTCGTAGATTGACGAATAAGTTCAAAATATTAT
GAATACCTTCAATTATGACTGGTTTTGCCAATATTTATTTCTTATAATTACACAGGGTCA
ATTTTTAGTGGTGAATCAAATATTTTTCTTAGTTCATCATACAATTACTTTCACTGGTAG
TTAAATAATTAAAATTTTGTTATCTAATTTATTTTGAATTATTGGTAACATTTCATTAGG
TTTCGCGTTTATCACGACCACGACTAGAATTTTGCTGGCTGCATTTTGTTTTGGTGTGAA
CAAGATTTGGTGTGGTGTACCAAGAGCAGCAAAGTACTATTTTTTGTATGTAAGTATACA
AATTTAATTCCGACGAGTGAAGTGATCCGACTGCGGGACCATGGAACACAACAGTAACAC
TGATAGTATTTCTTTTTAATAATTAAATAGCTTATTAATAATAATTGTGACCAATGTAAA
TGGTTCGTCTTTGACTTTATTGCGAAATGCAGCTTCGATTCACCATTAAACATTCACCCT
ATATAGGACTTAGATATAGGATGAGTCCATTACAAACAATTTAAAAAATCGCGTCTTCTA
AATTATAAATTAATATTACTTATATTAATTTAGACTAACAATAATATGTATGTATAAGGT
AGAGCCGACTAGAGCCAAATTTAGTATTATAATATATTTTTTATGTGTATGAATTTCATA
TTATTTGTTGGATTTGGTGTGCCTATAAATGATAGGCAAACTACATAATAGGTTAATGTA
TGGAAGATTTCCTACCGGTAATTTCTTCCATACATTGATTTAATACATTATAGTTTAAAT
AAGGATACGTTTTACTGTGTGCACGTTTATATTTTTCATTTATTACTTTAAAAAAGACCT
TAGCCAGTTTAGGGCGTGTTTAATTTTAATAAAAGTAATTAATAAAAAAAAAAAA
(2395 bp)

- SilkBase 1999-2023 -