SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18
 
NameKWMTBOMO11846
chromosome
/Scaffold_id
Bomo_Chr20 (Genome browser)
vs nrGag_polyprotein_[Operophtera_brumata]
Ontology
GO:0004190 F aspartic-type endopeptidase activity
GO:0006508 P proteolysis
Protein Structure
Expand view
Expression Level
InterproscanInterproscan result page
Sequence
(Amino Acid)
MVFTIKFLSLQKTELEYEVAIRGETPGATVADLRKQISKLSQSFPSEDVLCSHLEPLDDL
QAVLDLLNKVNASLESSPTDKSTLSRIENIFHHLYHRINRIVVDEVEKLHSACSKLFKEF
YEKFQKLSKKAIDPLLVGVSSSASASVPGIQAPINVAVTCDRGVTSELSRLKFDGKSCVR
SFIQRVYEFSEARSIPDSKLLSSATEIFTDDALHWFRSIKDQVSSWDDLVVLLKKDFDKA
DYDYRLLAEIRARTQGETENITIYLAILSGMFARLLKSLSEEDKLEIVLHNIRPCYASTL
ASATEICNIDQLRSLCRNYEIVQSRLVHFREPSAATSDTLAPEFAYKYATKAKSTYDYKS
SYSYNKQSYQPLKINRNTNINQKYLHSIEESHHDAREKLPYCPRCRNNTHSFRDCTNTEV
LCFKCGRKGVKKPECSHCTGKQAPKKLNLQNCSKPLSLEHVKIHRTSRDEWKNLLKTISL
FFNGYKVASILHTKPTNDKRPYVNIKIHDLTVSGLLDSGSAVTILGNNAHSALVSRGLEL
CTDDKLTIIAAGGQNFRSIGYINMPVHFENQFHIIQSHVVPEVQSSLILGIDFWHTFKIC
PKYLSSLHFPGPPLANLDVGSPTNFLRSYDYLDESQKAVVDNITKQFEEISFERKGLGRT
NLITHHIDTGNSPPVRQRYYRLSPEKQRILVEQVDEMLQLDVVEPCESAWQSPVLLVTKK
DGQPRFCLDSRKLNSVTKRDAYNLPYISEILDNLRDARYLSSIDLSKAFWQLPIALEDRD
KTAFYVPGRGTLRFKTTPFGLTNAPSTQQRLVDLLFGDMDHKAFAYLDDVIIVSSTFDEH
VSLLLRVLDKLRHANLTINLEKCEFFRSKLKYLGYVVDANGLRTDPDKVTAILNYPTPTC
RKDLKRFLGTATWYRRFVPNFSTIAGPLNRLTSNKKSTPPFQWTDEADTAFKKLKESLVS
APVLSCPNYDLPFEVHTDASNYGIGGMLTQTIDGKEHPIAYMSKSLSGAEKNYSITERET
LAVLVALEHWRCYLENGKTFTVYTDHSALKWFLSLNNPTGRLARWGVRLSSFDFEIKHRR
GVDNVIPDALSRAVPVTTITTAKSLTTSSDDXKPFEFNVGDTVYKRAYVLSDKDKYFSKK
LAPKYIKCKVVEKLSPLVYVLEDMSGKNIGTWHIKDLKILGQHS
(1184 a.a.)
Sequence
(Nucleotide)
ATGGTTTTTACGATAAAATTTTTATCCCTACAAAAAACTGAACTGGAATACGAAGTTGCG
ATAAGAGGTGAGACCCCCGGTGCTACGGTGGCTGATCTTAGGAAACAGATTAGCAAATTA
AGTCAATCTTTTCCTTCAGAAGATGTATTATGTTCTCATCTCGAACCCCTAGATGATCTT
CAAGCTGTTTTGGACTTGCTGAATAAAGTCAATGCAAGTCTCGAGTCAAGCCCTACTGAT
AAAAGTACATTATCGCGCATAGAAAATATTTTTCATCACCTTTATCATAGGATCAACAGA
ATAGTGGTTGATGAAGTAGAGAAGCTGCACTCTGCTTGTAGTAAACTTTTTAAAGAATTC
TACGAAAAATTCCAGAAATTAAGCAAAAAGGCAATTGATCCTCTATTAGTTGGTGTATCT
AGTTCAGCATCTGCTTCTGTACCTGGCATTCAGGCACCAATTAATGTCGCTGTTACTTGT
GATAGAGGTGTTACTTCAGAACTGAGTAGGCTGAAGTTCGATGGTAAGTCATGTGTTCGA
TCTTTTATTCAACGTGTTTACGAATTTAGCGAGGCGCGTAGCATCCCCGACTCAAAACTT
CTCTCATCTGCTACAGAAATATTTACAGATGATGCGCTGCATTGGTTCAGGAGTATTAAG
GACCAGGTTTCATCTTGGGATGATCTTGTTGTTCTTTTAAAAAAAGATTTTGATAAAGCA
GACTATGATTACCGTTTACTTGCTGAGATTCGTGCTAGGACTCAAGGGGAAACGGAAAAT
ATTACGATATACTTAGCTATTCTCTCGGGTATGTTTGCCCGCCTCTTAAAATCACTTTCG
GAAGAGGACAAGCTTGAAATAGTATTACATAATATCCGCCCTTGCTATGCAAGCACTCTA
GCCTCTGCTACTGAAATATGTAACATTGATCAATTGAGATCCTTGTGCAGGAATTATGAA
ATTGTTCAGTCTAGGCTCGTCCACTTTCGAGAACCATCTGCAGCGACTTCCGATACCTTG
GCACCAGAATTTGCGTACAAATATGCGACCAAGGCGAAATCGACCTACGACTATAAATCT
AGCTATAGTTACAACAAACAGTCGTATCAACCATTAAAAATAAACAGGAACACTAATATT
AATCAAAAATATCTACACAGTATTGAAGAAAGTCATCACGATGCAAGGGAAAAATTACCC
TATTGTCCTAGGTGCCGCAACAATACGCATAGTTTTAGGGACTGCACTAATACGGAAGTT
TTGTGTTTTAAGTGTGGTCGCAAGGGAGTTAAGAAACCTGAGTGTTCACATTGTACTGGC
AAACAGGCTCCAAAAAAACTAAATTTGCAGAATTGTAGCAAACCATTGTCCCTGGAACAT
GTAAAGATACACCGTACCAGCCGGGATGAATGGAAGAATTTGTTAAAAACAATTAGTTTA
TTTTTTAATGGCTACAAGGTTGCTTCAATTCTGCATACAAAACCAACTAACGATAAAAGA
CCCTATGTTAATATTAAGATACACGATTTGACAGTTTCCGGCCTTTTGGATTCAGGCTCA
GCGGTTACTATTTTAGGCAACAATGCTCATAGTGCATTAGTTAGTCGTGGGCTGGAGTTG
TGTACTGATGATAAATTGACTATTATTGCGGCTGGTGGACAAAATTTTAGAAGTATAGGC
TATATTAATATGCCAGTGCATTTCGAAAACCAGTTCCACATTATTCAGAGTCACGTAGTT
CCAGAAGTTCAATCATCGCTTATTTTAGGGATTGACTTTTGGCACACATTTAAAATTTGC
CCGAAGTACTTGAGTTCTCTTCATTTCCCCGGCCCTCCATTGGCTAATTTAGATGTTGGT
AGCCCAACCAATTTTTTGCGCTCGTATGATTATTTGGACGAATCACAAAAGGCCGTCGTT
GACAATATTACCAAGCAGTTTGAAGAAATATCTTTTGAGCGCAAAGGACTTGGACGCACA
AACTTAATTACTCACCACATCGACACGGGGAATTCTCCTCCTGTGAGACAGCGCTACTAT
AGGCTTTCACCAGAGAAACAGAGAATCCTAGTCGAGCAAGTAGACGAAATGCTCCAGCTT
GATGTAGTTGAGCCTTGTGAGAGTGCCTGGCAATCCCCGGTATTGCTAGTCACTAAAAAA
GATGGTCAGCCGCGGTTCTGCTTAGATAGTAGGAAGCTAAACTCTGTTACAAAACGCGAC
GCTTATAACTTACCTTACATATCGGAGATATTGGACAACTTGCGAGACGCGCGCTATCTT
AGCAGTATTGACTTATCAAAGGCTTTCTGGCAATTACCAATAGCACTCGAAGATAGGGAC
AAGACGGCATTTTACGTTCCGGGACGAGGGACGTTACGGTTCAAGACTACACCGTTTGGT
TTGACCAATGCGCCTTCTACGCAACAGCGGTTAGTCGATTTATTGTTTGGCGACATGGAT
CACAAGGCGTTCGCATATTTAGATGATGTGATAATAGTAAGTAGCACGTTTGATGAGCAT
GTTAGTCTTCTTCTTCGCGTGTTAGACAAGCTGCGCCATGCTAATCTAACAATTAATTTA
GAAAAGTGTGAATTTTTTCGAAGTAAGCTTAAATATTTAGGCTATGTGGTCGACGCGAAT
GGTTTGCGGACTGATCCGGATAAAGTTACAGCCATTCTAAATTACCCAACTCCTACATGT
CGTAAGGACTTGAAACGGTTCCTAGGCACGGCAACATGGTACCGGAGATTTGTCCCAAAC
TTTAGCACTATCGCAGGGCCGCTTAATAGGTTGACATCGAACAAAAAATCAACACCTCCC
TTCCAGTGGACAGATGAGGCCGACACTGCGTTCAAAAAACTTAAGGAATCTTTGGTCTCT
GCACCTGTTCTCTCCTGCCCAAATTACGATCTGCCTTTCGAAGTCCATACAGATGCTAGT
AACTATGGGATAGGTGGTATGCTCACACAAACTATTGACGGGAAAGAGCACCCTATAGCG
TATATGAGCAAGTCCTTATCGGGGGCCGAAAAGAATTATAGCATTACCGAACGTGAGACC
TTAGCTGTTCTCGTGGCTCTCGAGCACTGGCGTTGCTATCTGGAGAACGGAAAGACATTT
ACGGTTTACACAGACCACAGCGCACTTAAGTGGTTCCTTTCCTTGAACAATCCTACGGGT
AGGCTTGCACGTTGGGGAGTTCGATTATCGTCGTTTGATTTTGAAATCAAACACCGCCGC
GGTGTAGACAATGTGATTCCCGACGCTTTGTCTAGAGCTGTCCCGGTCACTACTATCACT
ACTGCTAAATCACTCACGACTTCTAGTGATGATTGAAAGCCTTTTGAATTTAATGTAGGA
GATACTGTTTATAAACGCGCTTACGTCCTGAGTGACAAAGATAAGTATTTTAGTAAGAAG
TTAGCACCGAAATATATCAAGTGCAAAGTTGTCGAAAAACTCTCGCCACTTGTCTACGTT
CTAGAAGACATGTCGGGTAAAAACATAGGCACTTGGCATATTAAAGACTTGAAAATATTA
GGTCAACACTCATAG
(3555 bp)

- SilkBase 1999-2023 -