SilkBase IMG001 IMG002 IMG003 IMG005 IMG006 IMG007 IMG008 IMG009 kuwako IMG010 IMG011 IMG012

Last updated: 2022/11/18

Bombyx mori Assembled RNA-Seq Entry

NameA_BomoN4EE_TR100057_c0_g1_i1
Scaffold_idBomo_Chr2
NCBI non-redundant
(nr)		RNA-directed_RNA_polymerase_L_[Papilio_machaon]
Ontology
GO:0000166 F nucleotide binding
GO:0001172 P transcription, RNA-templated
GO:0003824 F catalytic activity
GO:0003968 F RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0004482 F mRNA (guanine-N7-)-methyltransferase activity
GO:0005524 F ATP binding
GO:0006370 P 7-methylguanosine mRNA capping
GO:0006397 P mRNA processing
GO:0008152 P metabolic process
GO:0008168 F methyltransferase activity
GO:0016740 F transferase activity
GO:0016779 F nucleotidyltransferase activity
GO:0019012 C virion component
GO:0032259 P methylation
GO:0036265 P RNA (guanine-N7)-methylation
GO:0042025 C host cell nucleus
Transcript
Level		FPKM:1.54 TPM:2.05
ORF EntryO_BomoN4EE50646_complete:A_BomoN4EE_TR100057_c0_g1_i1
Sequence
(Nucleotide)
CATGTTGCGCGGGTGCAACGCCATTATCGATAAAAACAAATGAGTTATCGAAGGCAGGTA
CACGGCGGCGGGGCGGTATAAAACGCGTCACAAAACGAAGAAAGGCCTAAAGTCATTTGA
AGAGTTCAACCTCTTAATTATTGGACAGTTAAATCTATCGGGTTTTTTCTAAACACTTAA
TTTAATCAATACCTAATTCTAATACTATTACTAAAAAACTTGTCTCTATTATCTTCTTAG
AATTCGAAGGTAACTTGAATATCCACATTCGCTTTCTCTAACCAATTCTTTGAGATTTGC
CTCAACTTCATATCTCATTTGTTCTGCTTCTCTCATTTTAGTAATCCCATCTCTTAAGGT
ATAAGCGGGGACTCTTGGATTTGCTGGATCGCGGAAGAACGGCAAAGTCCTGAAGTAATC
TTTCATTTTGTGGTCTAGGATACCAAGAACAGATCGAGATGAAGTCTCTGGGCCAGTTAT
CAAAACTAAGCTCACTTCGATCTTCTTCGGTGGTATGATGTTACATTTGACTTCTAAAAT
CGAGAGAGAGTCCAAGATTGAAACGAGTTGGTCAAAATTTCGATAAAGTGATGTTAGTAC
AGATAATACAAGAAGAGATACTATTTGTTCTTTGTTAACAAATGGTATATAGACCATGAT
CTTTTCATGATAATCTATAACTTCAGAATTTCTTTCTATTGCGAGAAGACACATGATTAA
ATTCCTTTGATGTCTTTTCGTAATAAAGTGTTCTGAAATTTCTTCGACTTGATATTTCTC
CCTGACTGTCCAAACACAAGGATGACTCCTTACACTTTTGAGAAGACTCTCATTGGCCTG
TCCTAATATGTGCTTCAGGTAATTTACCCTGTTAGGTCTTGTTGATAACAGCTGAATCTT
TTTTTGTGCTAGTTTCCAATTCAAAGAATGAAGTTCTCCAATGGGTTCTTGTGATTCTAT
GTAGTTATTCTGTAAATCCAGAAAACAAACTACATAGACCTCATCATTATGAGGATGGCT
GGCGGATGGTTTGTGGAAGTCGCAAAGATATCCAAGAGACTTGCACCGATATCTTATGTG
AGTTAACTCGTCATGGGATTTGATGAACATTTTGTTTATAATTAAACTTGCAGGTGTTAG
ATAGGTTCTAACTAAAGGAAGGTATATATCCAATTTGTCGGTGTTAGTCAGATCTGTTTT
TAGTTCTGCATCCATATTGAGAATAAGGATTGCATGATTTTCGCTCCGTATTATAGTGGT
GAATTTTTCAATGAAAGCTTTGTTTGTAATATCAGTTTCTCCTAGACATGTTTCCTCTAA
GTATAATAGTCTATCTGTAGGACTACATTGATCTCCGACTAATGCTGGAGGACTTATGTT
GAGTACATTCTCTTTATTTTCGACGATGTCACTTTGCAATGTATTATAAATCAGATGAGA
AGTGGTGAACAAGTGAGAGAAGTAATGGAGGATTCCTCCTGATCCCTCTGCTAGTGTGAT
GATCAATCCCTCTTGAGGAAGTATTTCTGGATAATAACTCATTACTTGATGAATTTTTGA
TGCTGAAGTACTAATTCTTCCAACCTGTCTGGTGCAGTGATGAACCCACTTTACCCATAA
TGGACTTTCTGTCATTCCGTGTTCTAGCAGGGAGTCAAAAGAGAAGTGGAAACAGTTGTT
TAATGGCTCACTAATCTCGATTCTCTGTGGAGAATCATTATCTTTGACCATCTCTTTGTT
GAATCGGCTGGATAAGGGAAACCTAGGCTCTATGTGTTCACTTATCTCACTCTTGAGATC
ACGCCAAACAGAAATTGCATCAGTTTCTTCGAATTTAATCTCAACCGAGAGCCCCTTTGT
TAGATCTATAGGGACCTTCGATCTCCATTCGTGAACATTAGACCCTCCGCATTGAGGAAT
TCTCATAATCCCTCTTTTTTGGATGGTTGTTAGTCTTGAATCTTCATGGATAAGGTGTCC
TACAAAGATTCTCCAGAAATAAGCTTGTTTAGAAATTAAGTCAGAGGAGAACGTGGTAAA
TGCACAGGCTCTAAAGAACATTCCTTTTCTATTTCGGATATACTCTAGAGTTGACTTAGC
AAGTATCTTTGCTAGTCCACTTGTTTGAGTCACTGAGGAGTGCTTCTCTATAGGAACTCC
TAGGAGTTGAAGTATTTCTTGCATTCTCTCACTGTTGATTATTAAGTAAGATAAGTGTTC
GAATATCGAGACAGGATATTCTCTAGAGCTTCCTATTACAAATTCTACTAGCTGCTTGCT
TCCTTGTAATGCTCCAACCAGGACATAGTCTATGTTCGCATTACGAAATTCTGACATTAA
GTTGCTACTAGTTCTTTCTGTTGACTCATCAGTCTTGACCCCTTGAAATGTTTCCAATGT
ATTGTGAACTTCTGGGTCATGGAGACGTGCAGTTGCTAATTTCCTTCCTACAGATAGAGA
CATTGCGAGTGTGCAAATATGAATACTTTCTGTCAAGTTAGTTTTACTTAATTTAGAGTT
AACTTGATCTTGAATCATTCTTGATTGGTAGCTCATGTGTTGGAGATTTATTGATATAGG
TGTATTGAGAATTAAATAAGTACAATCCGGACAATTTAAAGGCACTGCATATGTATCGGC
AATAGGTATTCCTCTACTCGCACATTCAGTTACATAATTTTGTATATAAAGAAAAATTTC
TTGGAAAAATAGGTTGTAATCTTCATTTCCTCTGAGTGCTTTTCCAAGAAGGTTGGTATT
GATAGTGACATGTGTTGCAAGGTTTTCCATTAATGAGAAAAGAGCAGACCTTTTCTGGGA
AGAAGCTTTAAACCTGTGTTCATAACTCCCGCCGTAATTCCTTCCACACCAATCTGAGAG
AGGAGTTTGACTAAATTCAGTGGGTAAATATTTAAGTTTTTCTTGAATCATTTTATTCAC
AAGCCCAATTAGAGCACTATTAGGATCCATTCTTTCTAAATATGTAAGAATATAGTACAG
TTTCATCACTGATTTGATTTGAGGATTTGGGTTAACGACTGTCAATTTTGGTTTGATCAT
CTTTTCAGGGGTCGATGAGCCCAAATAAGGTTCAAATGGTCCTCGAACCTTGAGTGCATT
TCTCCCTTCAGTTTTAAGTTTGTAAGATGTTTTAACAATTATACAGTCTTTTTTAAGGTG
TTTTTCTGCTGTGTCATAATCTTCTATTTTAACCTGTTCACAGGGGACAGGACTTGTAAT
CCCAGTAATCGGAAATCCCCAGGTAGTCTCTCTGAGCCACTGTGAAGCTTTAAAAGTACA
AGGAATAGAGGAAAGGGCACTTTCTAAAAGATGGGTTCCATTGACCGGTAATTCCGATTT
GATCAATCTTTTCTTAAGTACCTCGATGGCCTCAGCATCTTTGAATTTCCCCAAAGAGAA
AATCGTCTCTGTTCTATTTGGATCCTCATTTATCATCCGATTGATTGTTTGAAGATTAGA
GAAACTCCCTATTAGCTGTAACTGGACTCCTTCATTTGAATTTCTTAGAATCTCATGTGC
CAGATTAGCAACATATGGTCTCATAGTAGTCAAAATACTACATAATGCTTCCAGATCTGA
ACGGTCTGCACCTAATAATCTTATAACTTTAGGGTTGGTGACATAGGTGGGTAGAAATTC
TTCGATAATTTCTCGAGCTTTTCTTTCAAAGTTTGGCATGCCGACAATATTCAAACTGTA
TATATCTTCTACTAATTTGACAGGATCATAAGTAGCTTTAATATTACATGGAATGAGGTG
TAATATATGATTATATATTCTAGGACTATTCTTTCTTATAGTCTCAATAACTTTAAGCCA
GATTGTTAGTGGATCAGGGCATCCTCTCTGACAATGTTGATACATGTTTGAAAGAGGTAA
TCCCCCTAGAATAGAGGGAATATTCATCAGGGCACATAATTTATCTGTCTCTCTGGACTT
AAGATCAAGTATACCTTTCCGTTTAAGAGTGTTACCTAATTCTAGCGAGTAAAGGAAAAA
AGGTGTGACCGGAGAGACATAATTTCTGGACATATTTTCGGTTGTGGTAGAGACTCCAGT
AATCAAGGATTGTAAAGATGGAAATCCTTCATTTATATCGGGTATCATTCTATTGAGTCT
TTTGAGACTATCATCGATTCTGATTGACTTGTAATATCTAACTTTTGAGTATTCAAACAG
ATTTTGAGAATACCAAGTTTCCTGGAGTTTCAATAAGAGACCAGCGGATATGAAAAGATA
ATCCAAGCTATTGAGCAGAAGTTTAATATAAAAATGAGGTCTGCCCTGTTGTTCAGTACT
CAATCTTATGTGGATTATCTGATTATCTCCTTGCCCCATTACTTCACCATGGATATTACA
TTCTTCTAACGCAATTTTGATGATCATTATTGTTGTTAGTGTCCACGCTTTTTGTCTCAT
TCCTTCGAATCCTCCAAACTGGTTGTAATGGCAATAATCTCCTGCTAATGGTTCGCCGTC
TGGTCCTATTTTTGGAGGGGTTAATCTAGAACTAAGCAATACCATGCAGCGATTAAACCA
TAAATGAGAGTCAGAATAAAGATTCTTCCTTCCATGTAAATCATCCAATTCTTGAAATAA
ATATTTATTTAATTCATGACGATTAAGTTGATTCCATGAACTCAGATCTAAATTAAGGTT
TGCATGACCTTTTTCTTTGAGATGAGATGCAACTTTATCCATCCTCTTTGCAACTTCAAG
TTCAGTATTAGTCATAGTTTGTTCTCTTATATATGGGAGAATATTGTCACTTAGAGACTT
TTCCATACAAACTTGCATTAGTCTCATCTCGTAAGTTTGCTTACAGAACACCCTGCCCTT
GATGTTTAACTCTCTTTCCTTTCGACAAAGTTGCACTATATCATCTCGCAAGTGATTATA
GAATGAATTTTCTTGATCCATTATTTTTCTTGCTAATTCTCCTTCATCACCCTTGAGGTA
TCTTGATAACACTCGAGGTTCAAAATCATTCCAACTCCTAGGTTTTCTTTGATTGTAAAG
ATTTTGGAAAGCACATTGATCATAGGGTCGAAACCATTCTTCTCTTGGGGGTGAGCATGC
AGTATCTTTCAACAATTCCTTTTCATCTATTTCTAAACTCATGTCATGGTTTTTATCCAG
TTTCAGGTTTCCCCAGGCAGATAAAGGTAATGATTTTAATTCATTAGCTGTTAATACTCT
TTCATCTTTCAAGCAATCAACTAGTACTGGGTGAAGTTCTCCTAATACTTTATGATGTGG
ATAGTTCCCTTTCTTCCTAAAGTAATTCATAAAGTACGTCTTTCTGAACATCCACAAAAC
TTTCTTCGCTATATTATCATCAACTGGGATCTGTTTTTTAGAGTTCAAACGGAGTTTTTC
GATCCCTTCAGTTGGATGTAATATTGGATGACCATAATTCTTGCTCAAGTTTGAGAAGTA
AAGAGAGATCGGGACTGCAATATCTCGGTTATTTGATATGTTAAGACAGGACATTAAATC
TAATATATCTCTTATATCATGTTTATTGTATTTTTCGAACAACTCTGCCTCTATCGAATC
CTTTAATGTTTTAAACCCTAGATCTTCTACTTCATCTGACACTGTACATCCTATACAGTA
AGCATCCCAGTTCTTCATGATATCAAAGAAGTGATTTTTATACTTAGATCTAAGTAAGAC
CAATGATGAGTGAAGACGGTCATAATGGTTTAAAAGACCTCTTAGTCCTTCATTTTGTTC
TTTAATTGCAACATGTAATCTTATGTAGAATCGTGTCTGCAAGTTATCAAGAACACACAT
AATTAATGTAGTAGGGAACAAAAAGTATTTTCCGTTTGTTTTGATAATGGTCAGCTCTTT
TTCAATTAGCAAGTCATCTGAGATCATATGGAATTCTCCTAGAGTTTGTTCAATATTAGT
TATTTATACGAAGGGTGGTGAGACATTGTTATGCTACGAGTCATTTTTTTTAAATTTTTT
TTATTGCTTAAATGGGTGG
(6019 bp)

- SilkBase 1999-2023 -